Ούτε η αφρικανοκεντρική παραλλαγή S47 ούτε P72 του TP53 συσχετίζεται με μειωμένο κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας σε μια μελέτη κοόρτης του Μάλι

Ιστορικό. Το TP53 έχει αποδειχθεί ότι παίζει ρόλο σε φλεγμονώδεις διεργασίες, συμπεριλαμβανομένης της ελονοσίας. Βρήκαμε προηγουμένως ότι η ρ53 εξασθενεί τη φλεγμονή που προκαλείται από παράσιτα και προβλέπει την κλινική προστασία έναντι της μόλυνσης από Plasmodium falciparum σε παιδιά από το Μάλι. Εδώ, διερευνήσαμε εάν οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου p53 47 και 72 σχετίζονται με διαφορικό κίνδυνο μόλυνσης από P. falciparum και μη επιπλεγμένης ελονοσίας σε μια προοπτική μελέτη κοόρτης για την ανοσία της ελονοσίας.

Μέθοδοι. Οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου p53 47 και 72 προσδιορίστηκαν με προσδιορισμό της αλληλουχίας του εξονίου 4 TP53 σε 631 παιδιά και ενήλικες από το Μάλι που εγγράφηκαν στη μελέτη κοόρτης Kalifabougou. Οι επιδράσεις αυτών των πολυμορφισμών στον ενδεχόμενο κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας, περιστατικής παρασιταιμίας και χρόνου έως πυρετού μετά από επεισόδιο παρασιταιμίας για 6 μήνες έντονης μετάδοσης ελονοσίας αξιολογήθηκαν χρησιμοποιώντας μοντέλα αναλογικών κινδύνων Cox.

Τι κάνει το βότανο κιστανάκι — Αντι-φλεγμονώδης

Αποτελέσματα. Οι συγχυτές του κινδύνου ελονοσίας, συμπεριλαμβανομένης της ηλικίας και της αιμοσφαιρίνης S ή C, ήταν παρόμοιοι μεταξύ ατόμων με ή χωρίς πολυμορφισμούς p53 S47 και R72. Σε σχέση με τις αντίστοιχες κοινές παραλλαγές τους, ούτε το S47 ούτε το R72 συσχετίστηκαν με διαφορές στον πιθανό κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας, περιστατικής παρασιταιμίας ή εμπύρετης ελονοσίας μετά από παρασιταιμία.

συμπεράσματα. Αυτά τα ευρήματα υποδεικνύουν ότι οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου p53 47 και 72 δεν σχετίζονται με την προστασία έναντι της περιστατικής παρασιταιμίας P. falciparum ή της μη επιπλεγμένης εμπύρετης ελονοσίας.

Οφέλη συμπληρώματος κιστάνζης-Αντι-φλεγμονώδης

Λέξεις-κλειδιά. ελονοσία; P47S; πολυμορφισμοί p53; P72R; προοπτική μελέτη κοόρτης.

Ο πιο κλινικά σημαντικός παράγοντας της ελονοσίας στην Αφρική, το Plasmodium falciparum, έχει μολύνει τους ανθρώπους για σχεδόν 10,000 χρόνια [1]. Σε αυτό το διάστημα, το υψηλό ποσοστό θνησιμότητας της σοβαρής ελονοσίας falciparum έχει ασκήσει ισχυρή επιλεκτική πίεση στο ανθρώπινο γονιδίωμα [2]. Ως εκ τούτου, ειδικοί πολυμορφισμοί ερυθροκυττάρων που διαφορετικά μπορεί να είναι επιζήμιοι για τον ξενιστή (π.χ. μετάλλαξη δρεπανοειδούς αιμοσφαιρίνης [HbS] υπεύθυνη για τη δρεπανοκυτταρική αναιμία) έχουν διατηρηθεί σε πληθυσμούς ενδημικούς στην ελονοσία, καθώς αυτές οι μεταλλάξεις προσδίδουν αντοχή στην ελονοσία καθιστώντας το ερυθροκύτταρο λιγότερο φιλόξενο για το εισβάλλον παράσιτο [3-5]. Μελέτες συσχέτισης σε επίπεδο γονιδιώματος έχουν εντοπίσει πρόσθετους πολυμορφισμούς που δεν συνδέονται με τη λειτουργία των ερυθροκυττάρων ως προστατευτικοί έναντι της σοβαρής ελονοσίας, αλλά έως και το 89% της ευαισθησίας στη σοβαρή ελονοσία δεν έχει ακόμη αποδοθεί σε συγκεκριμένους γονιδιωματικούς τόπους [6-9]. Επιπλέον, δεν υπάρχουν στοιχεία για πολυμορφισμούς ξενιστών ερυθροκυττάρων χρήματος που μπορεί να είναι προστατευτικοί έναντι της μη επιπλεγμένης (μη σοβαρής) ελονοσίας. Προηγούμενες μελέτες έχουν ενοχοποιήσει τον ογκοκατασταλτικό p53 στον έλεγχο της λοίμωξης από ελονοσία. Η αυξημένη p53 του ξενιστή έχει αποδειχθεί ότι μειώνει την επιβάρυνση στο ηπατικό στάδιο Plasmodium σε ποντίκια [10]. Η ομάδα μας έδειξε προηγουμένως αυξημένη έκφραση των γονιδίων-στόχων TP53 και p53 στο αίμα μη μολυσμένων παιδιών από το Μάλι που αργότερα θα παρουσιάσουν ασυμπτωματική παρασιταιμία P. falciparum σε σχέση με εκείνα που αργότερα παρουσίασαν εμπύρετη ελονοσία [11]. Αυτές οι παρατηρήσεις έχουν οδηγήσει στο ερώτημα εάν οι πολυμορφισμοί TP53 θα μπορούσαν να εξηγήσουν αυτές τις διαφορές στον κλινικό φαινότυπο. Το TP53 είναι το πιο συχνά μεταλλαγμένο γονίδιο στους ανθρώπινους καρκίνους, με την πλειονότητα των λανθασμένων μεταλλάξεων να συμβαίνουν σε καυτά σημεία είτε εντός της περιοχής πλούσιας σε προλίνη (αμινοξέα 55-100) είτε στην περιοχή δέσμευσης DNA (αμινοξέα 102-192) [12, 13]. Η πιο κοινή φυσική μετάλλαξη εμφανίζεται στο κωδικόνιο 72 (rs1042522), που προκύπτει από έναν πολυμορφισμό ενός νουκλεοτιδίου (SNP) στο εξόνιο 4 [14, 15]. Ένα υπόλειμμα προλίνης σε αυτή τη θέση (P72), που θεωρείται η προγονική μορφή, βρίσκεται κατά προτίμηση σε άτομα αφρικανικής καταγωγής, ενώ ένα υπόλειμμα αργινίνης (R72) εμφανίζεται συχνότερα σε μη Ισπανόφωνους λευκούς Αμερικανούς και Ευρωπαίους, με συχνότητα να αυξάνεται γραμμικά με το γεωγραφικό πλάτος [ 16, 17]. Αν και η αντικατάσταση της προλίνης με αργινίνη οδηγεί σε σημαντικές δομικές και λειτουργικές αλλαγές [18], και τα δύο υπολείμματα πιστεύεται ότι λειτουργούν επαρκώς για να προστατεύουν από τους διαφορετικούς καρκίνους που μπορεί να συναντήσουν τα άτομα στα αντίστοιχα γεωγραφικά πλάτη τους (ανασκόπηση στο [13]). Συγκεκριμένα, η παραλλαγή R72 σχετίζεται με χαμηλές θερμοκρασίες και χαμηλή ένταση UV [19], αλλά οι μελέτες που αξιολογούν τη συσχέτιση των πολυμορφισμών του κωδικονίου 72 με τον καρκίνο του δέρματος έχουν δώσει ασυνεπή ευρήματα [20-23]. Παρά την αυξημένη συχνότητα του P72 μεταξύ των Αφρικανών σε σχέση με τους Ευρωπαίους [17], έχει προταθεί από άλλους ότι η παραλλαγή R72 μπορεί να είναι προστατευτική έναντι της μόλυνσης από ελονοσία στους ανθρώπους [24], με βάση στοιχεία ότι το R72 έχει αυξημένο αποπτωτικό δυναμικό σε σχέση με το P72. 25] και ότι η απόπτωση είναι ένας μηχανισμός με τον οποίο ο ξενιστής εξαλείφει τα παρασιτικά ηπατοκύτταρα στο ήπαρ [10]. Το δεύτερο πιο συχνό SNP που κωδικοποιεί το p53 εμφανίζεται επίσης στο εξόνιο 4 και εντοπίζεται στην περιοχή που κωδικοποιεί τον Ν-τερματικό τομέα μετενεργοποίησης στο κωδικόνιο 47 (rs1800371) [26], όπου η πιο κοινή προλίνη (P47) μπορεί να αντικατασταθεί από σερίνη (S47 ) [27]. Σε αντίθεση με τον πολύ κοινό πολυμορφισμό στο κωδικόνιο 72, η παραλλαγή S47 είναι σχετικά σπάνια στους ανθρώπους, με συχνότητα αλληλόμορφων 2%-4% στους αφρικανικούς πληθυσμούς [26, 27]. Καθώς το S47 δεν έχει ακόμη ανιχνευθεί σε Αμερικανούς μη αφρικανικής καταγωγής [28], αυτός ο πολυμορφισμός αναφέρεται ως η αφρικανοκεντρική παραλλαγή στη βιβλιογραφία. Η παραλλαγή S47 μπορεί να προσφέρει αντίσταση στον εξαρτώμενο από τον σίδηρο προγραμματισμένο κυτταρικό θάνατο (φερρόπτωση), οδηγώντας σε αυξημένο κίνδυνο αυθόρμητων καρκίνων [27, 29]. Σε ποντίκια S47, αυτή η ελαττωματική φερρόπτωση μπορεί να οδηγήσει σε συσσώρευση σιδήρου και αντιφλεγμονώδη απόκριση στην αιμοζωίνη της ελονοσιακής χρωστικής ουσίας, οδηγώντας σε εικασίες ότι η παραλλαγή S47 μπορεί να περιορίσει τη φλεγμονή που προκαλείται από την ελονοσία και έτσι να βελτιώσει την επιβίωση σε άτομα που ζουν σε περιοχές με έντονη μετάδοση της ελονοσίας. 30]. Οι μελέτες για τους πολυμορφισμούς του p53 και την ευαισθησία στην ελονοσία στον άνθρωπο έχουν περιοριστεί μέχρι σήμερα. Δύο μελέτες εξέτασαν τη συσχέτιση μεταξύ των παραλλαγών του κωδικονίου 72 και του κινδύνου ελονοσίας στους ανθρώπους με αντικρουόμενα αποτελέσματα [24, 31]. Ωστόσο, από ό,τι γνωρίζουμε, η συσχέτιση μεταξύ των πολυμορφισμών του κωδικονίου p53 47 και του κινδύνου ελονοσίας δεν έχει ακόμη διερευνηθεί στους ανθρώπους. Στην τρέχουσα μελέτη, εξετάσαμε εάν οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου p53 47 και 72 επηρεάζουν τον κίνδυνο μόλυνσης από P. falciparum και κλινικής ελονοσίας σε μια πιθανή κοόρτη παιδιών και ενηλίκων από το Μάλι.

cistanche tubulosa — Αντιφλεγμονώδες

Κάντε κλικ εδώ για να δείτε τα προϊόντα Cistanche

【Ζήτα περισσότερα】Email:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

ΜΕΘΟΔΟΙ

Σχεδιασμός Σπουδών και Συμμετέχοντες

Η τοποθεσία μελέτης και ο πληθυσμός μελέτης έχουν περιγραφεί αλλού [32]. Εν συντομία, η μελέτη διεξήχθη στο χωριό Καλιφαμπούγκου, στο Μάλι, όπου η μετάδοση της ελονοσίας του P. falciparum είναι έντονη και εποχική, και εμφανίζεται από τον Ιούνιο έως τον Δεκέμβριο [32]. Τον Μάιο του 2011, εγγράψαμε 695 υγιή παιδιά και ενήλικες, ηλικίας 3 μηνών έως 25 ετών, σε μια μελέτη διαχρονικής παρατήρησης κοόρτης για τη διερεύνηση της ανοσίας κατά της ελονοσίας, στην οποία διεξήχθη ενεργός παρακολούθηση της ελονοσίας ανά δύο εβδομάδες με εβδομαδιαίες εβδομαδιαίες κατ' οίκον ελέγχους και παθητική παρακολούθηση από μόνος τους. -παραπομπή. Τα κριτήρια αποκλεισμού κατά την εγγραφή περιελάμβαναν το επίπεδο αιμοσφαιρίνης<7 g/dL, axillary temperature >37.5°C, acute systemic illness, underlying chronic disease, use of antimalarial or immunosuppressive medications in the past 30 days, and pregnancy. Malaria episodes were defined as parasitemia of >2500 παράσιτα ανά μικρολίτρο, μασχαλιαία θερμοκρασία μεγαλύτερη ή ίση με 37,5 βαθμούς εντός 24 ωρών και καμία άλλη αιτία πυρετού που να διακρίνεται από τη φυσική εξέταση. Τα επεισόδια εντοπίστηκαν μελλοντικά με αυτοπαραπομπή στην κλινική της μελέτης και εβδομαδιαίες ενεργές επισκέψεις κλινικής επιτήρησης. Όλα τα άτομα με σημεία και συμπτώματα ελονοσίας και οποιοδήποτε επίπεδο παρασιταιμίας που ανιχνεύθηκε με μικροσκόπιο αντιμετωπίστηκαν σύμφωνα με τις οδηγίες του Εθνικού Προγράμματος Ελέγχου της Ελονοσίας του Μάλι. Κατά τη διάρκεια των προγραμματισμένων επισκέψεων στην κλινική, συλλέγονταν αίμα με τρύπημα δακτύλου κάθε 2 εβδομάδες για επιχρίσματα αίματος και ξηρές κηλίδες αίματος (DBS) σε διηθητικό χαρτί. Ασυμπτωματικές λοιμώξεις από P. falciparum ανιχνεύθηκαν με μικροσκοπική εξέταση επιχρισμάτων αίματος και ανάλυση αλυσιδωτής αντίδρασης πολυμεράσης (PCR) των κηλίδων αίματος στο τέλος της περιόδου επιτήρησης. Οι πρώτες λοιμώξεις από P. falciparum ανιχνεύθηκαν αναδρομικά με PCR των κατά μήκος συλλεχθέντων DBSs, όπως περιγράφεται αλλού [32]. Τα πρώτα επεισόδια ελονοσίας προσδιορίστηκαν από τα δεδομένα της κλινικής επίσκεψης. Οι τιμές της αιμοσφαιρίνης, που μετρήθηκαν με αναλυτή HemoCue, χρησιμοποιήθηκαν για τον προσδιορισμό της κατάστασης αναιμίας, με βάση τα κριτήρια του Παγκόσμιου Οργανισμού Υγείας. Ο προσδιορισμός της αιμοσφαιρίνης για το HbS πραγματοποιήθηκε με ένα σύστημα ελέγχου αιμοσφαιρίνης D{7}} (Bio-Rad). Τρεις κλινικές κατηγορίες με διαφορετικά επίπεδα κλινικής ανοσίας περιγράφηκαν αλλού [11].

Απομόνωση και Αλληλουχία DNA

Το γονιδιωματικό DNA εξήχθη από δείγματα ολικού αίματος χρησιμοποιώντας 3 μεθόδους: (1) από σφαιρίδια ολικού αίματος (100 μL) χρησιμοποιώντας κιτ QIAamp 96 DNA Blood Kit (Qiagen), σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή. (2) από DBS που χρησιμοποιούν το QIAamp DNA Mini Kit (Qiagen), σύμφωνα με το πρωτόκολλο του κατασκευαστή. ή (3) από DBS χρησιμοποιώντας μια προσαρμοσμένη μέθοδο εξαγωγής υψηλής απόδοσης, όπως περιγράφεται αλλού [33]. Το καθαρισμένο γονιδιωματικό DNA χρησιμοποιήθηκε για την ενίσχυση του εξονίου 4 του TP53 με PCR χρησιμοποιώντας τους ακόλουθους προηγουμένως δημοσιευμένους εκκινητές [34]: 5'-TGAGGACCTGGTCCTCTGAC- 3' (προς τα εμπρός) και αντίστροφη 5'-AGAGGAATCCCAAAGTTC CA-3' ( ΑΝΤΙΣΤΡΟΦΗ). Η ενίσχυση PCR πραγματοποιήθηκε χρησιμοποιώντας το HotStarTaq Plus Master Mix Kit (Qiagen) σε θερμοκρασία ανόπτησης 60 βαθμών, σύμφωνα με το πρωτόκολλο που συνιστά ο κατασκευαστής. Τα ενισχυμένα προϊόντα PCR καθαρίστηκαν και αλληλουχήθηκαν με τη μέθοδο τερματισμού αλυσίδας στην Quintara Biosciences. Τα αρχεία αλληλουχίας που ελήφθησαν αναλύθηκαν χρησιμοποιώντας λογισμικό Benchling (έκδοση 2022.2.3; https://benchling.com) και ευθυγραμμίστηκαν με την αλληλουχία αναφοράς TP53 (αναγνωριστικό γονιδίου 7157; Εθνικό Κέντρο Βιοτεχνολογίας Πληροφοριών). Οι βασικές κλήσεις που αναφέρθηκαν από το λογισμικό ελέγχθηκαν χειροκίνητα σε σχέση με τα χρωματογραφήματα. Οι δημιουργημένες ακολουθίες θα είναι διαθέσιμες στην GenBank (αριθ. πρόσβασης OP593553–OP594185).

Στατιστική ανάλυση

Οι καμπύλες Kaplan-Meier χρησιμοποιήθηκαν για να εκτιμηθούν οι αντίστοιχες πιθανότητες να παραμείνει απαλλαγμένη από (1) κλινική ελονοσία, (2) παρασιταιμία P. falciparum ή (3) εμπύρετη ελονοσία κάποτε παρασιτατική. Για το χρόνο μέχρι την εμπύρετη ελονοσία μια φορά παρασιτατική, χρησιμοποιήθηκε ως χρόνος έναρξης ο χρόνος της περιστατικής παρασιταιμίας, που υπολογίζεται ως το μέσο μεταξύ του τελευταίου αρνητικού αποτελέσματος P. falciparum PCR και του πρώτου θετικού αποτελέσματος P. falciparum PCR. Τα μοντέλα αναλογικών κινδύνων Cox χρησιμοποιήθηκαν για την εκτίμηση της στατιστικής Wald για τον έλεγχο της σημασίας των διαφορών στο χρόνο μέχρι το πρώτο συμβάν μεταξύ παραλλαγών TP53 στο κωδικόνιο 47 ή 72 είτε σε μονομεταβλητές αναλύσεις είτε σε αναλύσεις που περιλάμβαναν συμμεταβλητές όπως υποδεικνύεται στους πίνακες. Το τεστ αθροίσματος κατάταξης Kruskal-Wallis χρησιμοποιήθηκε για τη σύγκριση των διαφορών μεταξύ των ομάδων για συνεχή αποτελέσματα. Για τις κατηγορικές μεταβλητές, πραγματοποιήθηκαν συγκρίσεις ομάδων χρησιμοποιώντας τεστ χ 2. Η στατιστική σημαντικότητα ορίστηκε ως μια 2-ουρά τιμή P<.05. All analyses were performed using R software (version 4.2.0).

φυτικό κιστανάκι που ενισχύει το ανοσοποιητικό σύστημα

Ηθική Έγκριση

Η μελέτη κοόρτης Kalifabougou εγκρίθηκε από την Επιτροπή Δεοντολογίας της Σχολής Ιατρικής, Φαρμακευτικής και Οδοντιατρικής στο Πανεπιστήμιο Επιστημών, Τεχνικής και Τεχνολογίας του Μπαμάκο, και το Συμβούλιο Θεσμικής Αναθεώρησης του Εθνικού Ινστιτούτου Αλλεργίας και Λοιμωδών Νοσημάτων, Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας . Ελήφθη γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση από τους ενήλικες συμμετέχοντες και τους γονείς ή κηδεμόνες των συμμετεχόντων παιδιών. Αυτή η μελέτη εγκρίθηκε ως έρευνα εξαιρούμενων ατόμων από την Επιτροπή Ιδρυματικής Αναθεώρησης του Πανεπιστημίου της Ιντιάνα (πρωτόκολλο 2005922267).

ΑΠΟΤΕΛΕΣΜΑΤΑ

Συχνότητα πολυμορφισμών TP53 μεταξύ των συμμετεχόντων στη μελέτη

Από τα 695 άτομα που αρχικά εγγράφηκαν στην κοόρτη Καλιφαμπούγκου, τα 631 είχαν επαρκές γονιδιωματικό DNA για τον προσδιορισμό της αλληλουχίας του εξονίου 4 TP53. Οι ευθυγραμμίσεις αλληλουχίας αποκάλυψαν 40 άτομα (6,3%) με πολυμορφισμούς S47, εκ των οποίων 33 ήταν ετερόζυγα και 7 ομόζυγα (Πίνακας 1). Πολυμορφισμοί R72 παρατηρήθηκαν σε 327 άτομα (51,8%), εκ των οποίων τα 206 (32,6%) ήταν ετερόζυγα και τα 121 (19,2%) ήταν ομόζυγα (Πίνακας 1). Ούτε οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου 47 ούτε του κωδικονίου 72 ήταν σε ισορροπία Hardy-Weinberg (ακριβής δοκιμή Haldane, P=6.5 × 10−6 και P=1.0 × 10−12, αντίστοιχα). Η κατανομή των πιθανών τροποποιητών του κινδύνου ελονοσίας (ηλικία, φύλο, HbS ή αιμοσφαιρίνη, υπάρχουσα παρασιταιμία του P. falciparum και αναιμία) δεν διέφερε σημαντικά μεταξύ των ομάδων παραλλαγής TP53 είτε για το S47 είτε για το R72 (Πίνακας 1). Και τα 6 άτομα που ήταν ετερόζυγα και για τα αλληλόμορφα S47 και R72 ήταν αρσενικά και PCR θετικά για P. falciparum κατά την εγγραφή (Πίνακας 1).

Καμία συσχέτιση των πολυμορφισμών του κωδικονίου 47 TP53 και του κωδικονίου 72 με μειωμένο κίνδυνο επεισοδίων κλινικής ελονοσίας ή περιστατικού P. falciparumΠαρασιταιμία

Πραγματοποιήθηκαν αναλύσεις από το χρόνο μέχρι το συμβάν για να εξεταστεί η συσχέτιση μεταξύ των παραλλαγών S47 και P72 και του κινδύνου εμπύρετης ελονοσίας. Η αρχική ανάλυση μεταξύ P47/P47, P47/S47 και S47/S47 δεν έδειξε σημαντική διαφορά στον κίνδυνο ελονοσίας (τα δεδομένα δεν παρουσιάζονται), πιθανώς λόγω των μικρών μεγεθών δειγμάτων για τους ετερόζυγους γονότυπους P47/S47 και ομόζυγους S47/S47. Έτσι, αυτοί οι γονότυποι κατέρρευσαν σε ένα ενιαίο στρώμα. Για το κωδικόνιο 72, οι ετερόζυγοι και ομόζυγοι γονότυποι διατηρήθηκαν ως 3 ξεχωριστά στρώματα. Δεν υπήρχαν σημαντικές διαφορές στο χρόνο μέχρι το πρώτο κλινικό επεισόδιο ελονοσίας μεταξύ των γονότυπων P47/P47 (διάμεσο [95% διάστημα εμπιστοσύνης], 184 [165–210] ημέρες) και της παραλλαγής S47 (151 [133–210] ημέρες) ή μεταξύ P72/P72 (183 [59-210] ημέρες) και είτε P72/R72 (210 [160-210] ημέρες) είτε R72/R72 (159 [142-210] ημέρες) είτε στις μονομεταβλητές αναλύσεις (Εικόνα 1Α και 1Β ) ή τις προσαρμοσμένες αναλύσεις που περιελάμβαναν την ηλικία, το φύλο, την αρχική παρασιταιμία, την αναιμία και την παρουσία HbS ως συμμεταβλητών (Συμπληρωματικός Πίνακας 1). Τα άτομα που ήταν P47/S47 και P72/R72 εμφάνισαν παρόμοιο κίνδυνο κλινικής ελονοσίας με τα ομόζυγα άτομα P47/P47 και P72/P72 (Συμπληρωματικό Σχήμα 1). Η αυξημένη p53 έχει αποδειχθεί ότι μειώνει την επιβάρυνση στο ηπατικό στάδιο Plasmodium σε μοντέλα ποντικών [10]. Επομένως, προσδιορίσαμε εάν οι πολυμορφισμοί TP53 συσχετίστηκαν με διαφορικό κίνδυνο περιστατικών λοιμώξεων από P. falciparum, όπως προσδιορίστηκε από την εντατική, ενεργή παρακολούθηση PCR σε άτομα που ξεκίνησαν τη μελέτη αρνητική για P. falciparum με PCR (n=330). Δεν εντοπίσαμε σημαντική διαφορά στο χρόνο μέχρι την πρώτη ανιχνεύσιμη με PCR μόλυνση P. falciparum μεταξύ P47/P47 (διάμεσο [95% διάστημα εμπιστοσύνης], 85 [81-91] ημέρες) και παραλλαγή S47 (85 [58-124]). ημέρες) γονότυπους ή μεταξύ P72/P72 (88 [80-95] ημέρες) και είτε P72/R72 (81 [72-91] ημέρες) είτε R72/R72 (91 [80-116] ημέρες) γονότυποι σε κάθε μονοπαραγοντική ανάλυση ( Σχήμα 1Γ και 1Δ) ή προσαρμοσμένες αναλύσεις που περιλάμβαναν σχετικές συμμεταβλητές (Συμπληρωματικός Πίνακας 2).

Καμία συσχέτιση πολυμορφισμών TP53 με προστασία από εμπύρετη ελονοσία μετά από περιστατικό P. falciparum Παρασιταιμία ή διαφορές στη γονιδιακή έκφραση

Η ομάδα μας εντόπισε προηγουμένως ένα υποσύνολο παιδιών στην κοόρτη Καλιφαμπούγκου που ήταν εμπύρετα τη στιγμή του περιστατικού, επιβεβαιωμένο με PCR P. falciparum parasitemia [11]. Αυτά τα παιδιά ταξινομήθηκαν ως «καθυστερημένος πυρετός» ή «άνοσα» ανάλογα με το αν είχαν προχωρήσει σε πυρετό μετά από 2–14 ημέρες ή παρέμειναν ασυμπτωματικά για το υπόλοιπο της περιόδου της ελονοσίας, αντίστοιχα. Αυτά τα 2 υποσύνολα έδειξαν αυξημένη έκφραση των γονιδίων-στόχων TP53 και TP53 στην αρχική γραμμή της μόλυνσης σε σχέση με παιδιά που ήταν εμπύρετα τη στιγμή του περιστατικού P. falciparum παρασιταιμίας ("πρώιμος πυρετός") [11]. Για να προσδιορίσουμε εάν οι πολυμορφισμοί TP53 συσχετίστηκαν είτε με καθυστερημένο πυρετό είτε με ανοσολογικούς φαινοτύπους, εξετάσαμε την κατανομή των πολυμορφισμών S47 και R72 σε αυτές τις υποομάδες, αλλά δεν παρατηρήσαμε σημαντικές διαφορές μεταξύ των 3 κλινικών φαινοτύπων (Πίνακας 2). Η επανεξέταση της έκφρασης TP53 στα μεταγραφώματα RNA-seq που ελήφθησαν στην υγιή βασική γραμμή κάθε παιδιού (n=80) [11] από τους πολυμορφισμούς του κωδικονίου 47 και 72 δεν αποκάλυψε διαφορές μεταξύ των κοινών πολυμορφισμών και των αντίστοιχων παραλλαγών τους (Εικόνα 2). Για να προσδιορίσουμε εάν οι παραλλαγές S47 ή P72 σχετίζονται με την προστασία από τον πυρετό της ελονοσίας μια φορά παρασιτητικές στη μητρική κοόρτη, προσδιορίσαμε τον κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας, χρησιμοποιώντας τον χρόνο της πρώτης παρασιταιμίας ως ώρα έναρξης. Εδώ, συμπεριλάβαμε όλα τα άτομα που ξεκίνησαν τη μελέτη P. falciparum αρνητικά με PCR και στη συνέχεια είχαν επιβεβαιωμένη με PCR παρασιταιμία P. falciparum (n=292). Δεν παρατηρήθηκαν σημαντικές διαφορές στο χρόνο έως τον πρώτο πυρετό από τη στιγμή που ο παρασιτικός ήταν σε υποομάδες με πολυμορφισμούς S47 ή P72 σε σχέση με τους αντίστοιχους κοινούς γονότυπους τους με μονοπαραγοντικές αναλύσεις (Εικόνες 3Α και 3Β). Παρόλο που υπήρχε μια τάση προς αυξημένο κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας κάποτε παρασιτική για το S47 σε σύγκριση με το P47/P47 (Εικόνα 3Α), αυτή η διαφορά έγινε στατιστικά πιο ασήμαντη όταν προσαρμόστηκε για σχετικές συμμεταβλητές όπως η ηλικία και η HbS (Συμπληρωματικός Πίνακας 3).

ΣΥΖΗΤΗΣΗ

Σε αντίθεση με τη σοβαρή ελονοσία, οι γενετικοί πολυμορφισμοί του ξενιστή που συνδέονται με την αντίσταση στην μη επιπλεγμένη ελονοσία εμπλέκουν κυρίως παραλλαγές γονιδίων των ερυθροκυττάρων [2, 5]. Ενώ αρκετά γονίδια μη ερυθροκυττάρων έχουν συσχετιστεί με προστασία έναντι της σοβαρής ελονοσίας [6, 7, 9], μόνο λίγα γονίδια που εμπλέκονται στη φλεγμονώδη απόκριση, συγκεκριμένα το NOS2 και το TNF, έχουν συσχετιστεί ειδικά με διαφορικό κίνδυνο μη επιπλεγμένης ή ήπιας ελονοσίας [2, 35-38]. Ο μεταγραφικός παράγοντας p53 διατηρεί την κυτταρική ομοιόσταση ως απόκριση στα σήματα του στρες ρυθμίζοντας ένα ευρύ φάσμα στόχων κατάντη, συμπεριλαμβανομένων των φλεγμονωδών οδών, που μαζί καταστέλλουν τις ογκογόνες διεργασίες [39]. Το ογκογόνο δυναμικό της χρόνιας φλεγμονής είναι καλά τεκμηριωμένο [40] και υπάρχουν αυξανόμενες ενδείξεις ότι η ρ53 μπορεί να ρυθμίσει τη φλεγμονή του ξενιστή στο πλαίσιο των παθογόνων [41, 42]. Προς υποστήριξη αυτού, η ομάδα μας παρατήρησε προηγουμένως ότι η αυξημένη έκφραση της TP53 και των κατάντη στόχων της σχετιζόταν με προστασία από πυρετό κατά τη διάρκεια του περιστατικού P. falciparum παρασιταιμίας, υποδηλώνοντας ότι η ρ53 θα μπορούσε αρχικά να μειώσει την εμπύρετη απόκριση κατά τη μόλυνση από ελονοσία [11]. Σε μια προηγούμενη μελέτη, τα ποντίκια με την παραλλαγή p53 S47 εμφάνισαν αντιφλεγμονώδη απόκριση στην αιμοζωίνη της ελονοσιακής χρωστικής ουσίας, υποδηλώνοντας ότι συγκεκριμένοι πολυμορφισμοί ρ53 θα μπορούσαν να περιορίσουν τη φλεγμονή κατά τη διάρκεια λοιμώξεων από ελονοσία στους ανθρώπους [30]. Στο πλαίσιο της φλεγμονώδους πρόκλησης με λιποπολυσακχαρίτη, τα ποντίκια με τον πολυμορφισμό p53 R72 παρουσίασαν αυξημένη επιβίωση σε σχέση με τα ποντίκια P72, υπονοώντας ότι η παραλλαγή R72 μπορεί να προστατεύει από παθολογικές αποκρίσεις σε gram-αρνητικά βακτήρια [43]. Εδώ, αξιολογήσαμε εάν οι πολυμορφισμοί του κωδικονίου 47 ή 72 επηρεάζουν τον κίνδυνο ελονοσίας P. falciparum σε μια προοπτική διαμήκη κοόρτη και δείξαμε ότι κανένας από αυτούς τους πολυμορφισμούς δεν σχετίζεται με διαφορικό κίνδυνο περιστατικής παρασιταιμίας ή περιστατικής εμπύρετης ελονοσίας. Επιπλέον, κανένας από αυτούς τους πολυμορφισμούς TP53 δεν υπερεκπροσωπήθηκε μεταξύ της υποομάδας των παιδιών που προστατεύονταν από τον ελονοσιακό πυρετό και τα οποία εμφάνισαν αυξημένη έκφραση της TP53 και των στόχων της στην αρχική γραμμή προ της μόλυνσης στην προηγούμενη μελέτη της ομάδας μας [11]. Τα ευρήματά μας συνάδουν με συγχρονικές μελέτες πρωτότοκων γυναικών από τη Γκάνα (n=314) και παιδιών από τη Ρουάντα (n=545), οι οποίες δεν έδειξαν συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού R72 και του επιπολασμού της μόλυνσης από το P. falciparum ή της έντασης παρασίτου [31]. Η μόνη άλλη δημοσιευμένη έρευνα των πολυμορφισμών του p53 στην ελονοσία ήταν μια μελέτη νεογνών στη Σαρδηνία, η οποία βρήκε μεγαλύτερη συχνότητα του υποτιθέμενου προστατευτικού για την ελονοσία ομοζυγώτου γονότυπου R72 σε μια περιοχή με προηγουμένως υψηλότερη ενδημικότητα ελονοσίας (n=46) σε σχέση με μια περιοχή με προηγουμένως χαμηλότερη ενδημικότητα ελονοσίας (n=47) [24]. Με βάση την υπόθεση ότι η παραλλαγή R72 του p53 έχει ενισχυμένο αποπτωτικό δυναμικό [25] και έτσι μπορεί να αποτρέψει τη μόλυνση σε ηπατικό στάδιο μέσω απόπτωσης παρασιτωμένων ηπατοκυττάρων [10], οι συγγραφείς πρότειναν ότι η ενδημικότητα της ελονοσίας μπορεί να έχει επιλεγεί θετικά για τον πολυμορφισμό R72 [24 ]. Ωστόσο, αυτή η υπόθεση δεν υποστηρίζεται από τα δεδομένα μας που δεν δείχνουν καμία διαφορά στον χρόνο εκδήλωσης παρασιταιμίας επιβεβαιωμένης με PCR μεταξύ των γονότυπων του κωδικονίου 72. Επιπλέον, ένας πολυμορφισμός R72 που προστατεύει την ελονοσία δεν θα μπορούσε να εξηγήσει γιατί το αλληλόμορφο P72 είναι πιο διαδεδομένο στους Αφρικανούς παρά στους Ευρωπαίους [17], μια παρατήρηση που θα σήμαινε ότι το P72 είναι το αλληλόμορφο που επιλέχθηκε για διατήρηση σε ενδημικούς πληθυσμούς της ελονοσίας σύμφωνα με το υπόθεση ελονοσίας» [8]. Μπορεί η λειτουργική δραστηριότητα που παρέχεται από το R72 να μην σχετίζεται με τον κίνδυνο εμπύρετης ελονοσίας. Όπως αναφέρθηκε παραπάνω, αν και η παραλλαγή R72 μπορεί να προστατεύει τα ποντίκια από την πρόκληση λιποπολυσακχαρίτη [43], έχει επίσης αποδειχθεί ότι προκαλεί φλεγμονή στο πλαίσιο μιας δίαιτας υψηλής περιεκτικότητας σε λιπαρά [44] ή καρκίνου του μαστού [45] σε μελέτες σε ποντίκια. Έτσι, ο τρόπος με τον οποίο ο πολυμορφισμός R72 επηρεάζει τη φλεγμονώδη απόκριση μπορεί να εξαρτάται τόσο από τον τύπο όσο και από την οξύτητα της διαταραχής.

Πίνακας 1. Πιθανοί συγχυτικοί παράγοντες κινδύνου ελονοσίας και γονότυποι TP53

Figure 1. p53 Codon 47 and 72 polymorphisms and malaria risk in the Kalifabougou cohort during the 2011 malaria season. Kaplan-Meier curves of time to first febrile malaria episode (defined as >2500 parasites per microliter by blood smear and axillary temperature >37,5 βαθμοί ) (Α, Β) και χρόνος έως την πρώτη αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης (PCR) – επιβεβαιωμένη παρασιταιμία με Plasmodium falciparum (C, D), στρωματοποιημένη από τους ενδεικνυόμενους γονότυπους παραλλαγής p53. Για το C και το D, η ανάλυση περιελάμβανε μόνο άτομα που ξεκίνησαν την περίοδο της ελονοσίας αρνητικά για P. falciparum με PCR. Η σημασία προσδιορίστηκε από τους αναλογικούς κινδύνους Cox, χρησιμοποιώντας τη στατιστική δοκιμή Wald. Οι πίνακες δείχνουν τον αριθμό των ατόμων που διατρέχουν κίνδυνο τις αναφερόμενες ημέρες από την εγγραφή. Συντομογραφία: HR, αναλογία κινδύνου.

Πίνακας 2. Κατανομή Γονοτύπων TP53 μεταξύ παιδιών με διαφορική ευαισθησία Εμπύρετη ελονοσία μετά από αρχική παρασιταιμία Plasmodium falciparum

Εικόνα 2. Έκφραση ΤΡ53 από πολυμορφισμούς κωδικονίου 47 και 72. Έκφραση της TP53 από ενδεικνυόμενους πολυμορφισμούς του κωδικονίου p53 47 (Α) και 72 (Β) σε δείγματα ολικού αίματος από 80 παιδιά από το Μάλι στην υγιή, μη μολυσμένη αρχική τους γραμμή τον Μάιο του 2011, πριν από την εποχή της ελονοσίας [11]. Η σημασία προσδιορίστηκε χρησιμοποιώντας τη δοκιμή Wilcoxon (Α) ή την ανάλυση διακύμανσης (Β). Η γονιδιακή έκφραση αναφέρεται ως λογαριθμικές μετρήσεις ανά εκατομμύριο (CPM).

Η έλλειψη συσχέτισης μεταξύ των παραλλαγών του κωδικονίου 47 ή του κωδικονίου 72 και της προστασίας από την ελονοσία θα μπορούσε επίσης να εξηγηθεί από την έλλειψη επίδρασής τους στην έκφραση της ρ53 όπως φαίνεται στα δεδομένα μας (Εικόνα 2) και σε προηγούμενες μελέτες [27, 46]. Ένα βασικό εύρημα της προηγούμενης μελέτης της ομάδας μας ήταν ότι η έκφραση της ρ53 και οι κατάντη στόχοι της αυξήθηκαν σε παιδιά που προστατεύονταν από πρώιμο πυρετό κατά τη διάρκεια της περιστατικής παρασιταιμίας [11], υποδηλώνοντας ότι μπορεί να απαιτείται επαγωγή της έκφρασης της ρ53 για τον έλεγχο της φλεγμονής. Αν και η παραλλαγή S47 μειώνει την ικανότητα να επάγει απόπτωση σε σχέση με την P47, η έκφραση της πρωτεΐνης p53 εντός του κυττάρου εξακολουθεί να διατηρείται σε παρόμοια επίπεδα [27]. Αυτό, σε συνδυασμό με την παρατήρηση ότι κανένα από τα παιδιά της πιο προστατευμένης «άνοσης» ομάδας δεν έφερε την παραλλαγή S47, υποδηλώνει ότι η μείωση της απόπτωσης μέσω αυτού του πολυμορφισμού είναι απίθανος ο μηχανισμός με τον οποίο η ρ53 επηρεάζει τον ελονοσία. Ομοίως, ο πολυμορφισμός R72 είναι λειτουργικά σημαντικός, αλλά δεν οδηγεί απαραίτητα σε αυξημένη έκφραση p53 [25, 46]. Οι επιλεκτικές δυνάμεις μπορούν να αυξήσουν τη συχνότητα των ευνοούμενων αλληλόμορφων με την πάροδο του χρόνου. Το αλληλόμορφο S47 ήταν παρόν στο 6,3% των συμμετεχόντων που αξιολογήθηκαν, με το 1,1% να είναι ομόζυγο, δίνοντας συχνότητα αλληλόμορφου 3,7%, που είναι σύμφωνο με το 2%–4% που αναφέρθηκε προηγουμένως για Αφρικανούς από την υποσαχάρια Αφρική [28]. Αντίθετα, το αλληλόμορφο R72 ήταν παρόν στο 51,8% των συμμετεχόντων (19,2% ομόζυγοι), δίνοντας συχνότητα αλληλόμορφων 35,5% σε αυτόν τον πληθυσμό. Η επικράτηση του αλληλόμορφου P72 στην κοόρτη του Μάλι συνάδει με την αυξημένη συχνότητα αυτού του αλληλόμορφου σε γεωγραφικά πλάτη πιο κοντά στον ισημερινό, εύρημα που έχει αποδοθεί στη φυσική επιλογή [17].

Οφέλη cistanche για τους άνδρες-ενισχύουν το ανοσοποιητικό σύστημα

Είναι δελεαστικό να υποθέσουμε γιατί το αλληλόμορφο S47 διατηρείται σε τόσο χαμηλό ποσοστό μεταξύ των Αφρικανών. Δεδομένου ότι το S47 έχει μειωμένο αποπτωτικό δυναμικό σε σχέση με το P47 [27], η χαμηλή συχνότητα του αλληλόμορφου S47 θα μπορούσε να εξηγηθεί από το κόστος φυσικής κατάστασης που συνεπάγεται η συντήρησή του λόγω επιλεκτικών μειονεκτημάτων που δεν σχετίζονται με παθολογική φλεγμονή κατά την ελονοσία, όπως ο αυξημένος προεμμηνοπαυσιακός κίνδυνος καρκίνου του μαστού [47]. Ωστόσο, η παραλλαγή S47, περιορίζοντας την επαγόμενη από την αιμοζωίνη φλεγμονώδη απόκριση [30], θα μπορούσε να είναι προστατευτική έναντι της πιο σοβαρής ελονοσίας. Επειδή η τρέχουσα μελέτη αξιολόγησε μόνο την μη επιπλεγμένη ελονοσία P. falciparum, δεν εξέτασε εάν κάποιος από αυτούς τους πολυμορφισμούς συσχετίστηκε με μείωση του σοβαρού κινδύνου ελονοσίας. Αξίζει να σημειωθεί η μέτρια σημαντική συσχέτιση μεταξύ διπλής ετεροζυγωτίας (P47/S47 και P72/R72) και ασυμπτωματικής παρασιταιμίας P. falciparum κατά την εγγραφή του Μαΐου (Πίνακας 1). Σε περιοχές έντονης, εποχικής ελονοσίας, η χρόνια ασυμπτωματική μόλυνση από P. falciparum στο τέλος της ξηρής περιόδου αντανακλά υψηλότερη αθροιστική ανοσία κατά της ελονοσίας [48]. Επειδή αυτά τα 6 διπλά ετερόζυγα άτομα έχουν υψηλότερη διάμεση ηλικία σε σχέση με τις άλλες ομάδες, η υπερεκπροσώπηση της ασυμπτωματικής παρασιταιμίας σε αυτόν τον γονότυπο μπορεί να είναι απλώς μια τυχαία συνάρτηση προηγούμενης έκθεσης στην ελονοσία και όχι συνέπεια των πολυμορφισμών p53. Θα χρειαστούν πρόσθετες μελέτες κοόρτης των πολυμορφισμών του κωδικονίου 47 και 72 p53 και του κινδύνου ελονοσίας για να επιβεβαιωθεί η σημασία του διπλού ετεροζυγώτη γονότυπου. Πρέπει να σημειωθούν περισσότεροι περιορισμοί αυτής της μελέτης. Αν και η μελέτη μας είναι μία από τις μεγαλύτερες μελέτες για τους πολυμορφισμούς του p53 και τον κίνδυνο ελονοσίας μέχρι σήμερα, μόνο 7 από τους 631 συμμετέχοντες ήταν ομόζυγοι για το S47, περιορίζοντας την δύναμή μας να ανιχνεύσουμε συσχέτιση. Επιπλέον, αξιολογήσαμε μόνο τους πολυμορφισμούς του p53 εντός του εξονίου 4 και έτσι μπορεί να χάσαμε την επίδραση άλλων δυνητικά σχετικών μεταλλάξεων, συμπεριλαμβανομένων των μεταλλάξεων 3KR (K117R + K161R + K162R) που περιλαμβάνουν θέσεις ακετυλίωσης p53 [49]. Αξίζει να σημειωθεί, ότι αξιολογήσαμε το κωδικόνιο 117, το οποίο βρίσκεται στο εξόνιο 4 και βρήκαμε ότι υπάρχει μόνο λυσίνη. Επίσης, δεν αξιολογήσαμε πολυμορφισμούς σε μη κωδικοποιητικές περιοχές TP53 ή σε ρυθμιστές p53 που μπορεί να επηρεάσουν την p53 σε επίπεδο πρωτεΐνης, όπως το MDM2 [28, 50]. Οι προσεγγίσεις αλληλουχίας επόμενης γενιάς που αξιολογούν διεξοδικά τους πολυμορφισμούς σε μη μεταφρασμένες περιοχές 5' και 3', καθώς και σε όλες τις περιοχές κωδικοποίησης για ρυθμιστές TP53 και p53, θα μπορούσαν να αντιμετωπίσουν αυτούς τους περιορισμούς. Τέλος, δεν προσδιορίσαμε εάν οι γονότυποι p53 διέφεραν στην έκφρασή τους της p53 σε κυτταρικό επίπεδο, κάτι που μπορεί να παρείχε σημαντικές πληροφορίες σχετικά με το εάν ο πολυμορφισμός του κωδικονίου 47 και 72 θα μπορούσε να επηρεάσει τα ρυθμιζόμενα μονοπάτια p53-. Συνοπτικά, η τρέχουσα μελέτη παρέχει στοιχεία ότι ούτε οι παραλλαγές του κωδικονίου 47 ούτε οι παραλλαγές του κωδικονίου 72 της ρ53 είναι προστατευτικές έναντι της ελονοσίας, όπως μετράται με βάση το χρόνο έως την εμφάνιση παρασιταιμίας P. falciparum και της μη επιπλεγμένης εμπύρετης ελονοσίας. Δεδομένων των χαμηλότερων συχνοτήτων του αλληλόμορφου S47 σε αυτόν τον πληθυσμό, θα χρειαστούν μεγαλύτερες μελέτες για να επιβεβαιωθεί η έλλειψη συσχέτισης της παραλλαγής S47 με τον κίνδυνο ελονοσίας.

Εικόνα 3. Πολυμορφισμοί του κωδικονίου 47 και 72 p53 και κίνδυνος εμπύρετης ελονοσίας μετά από περιστατική παρασιταιμία. Ο Kaplan-Meier σχεδιάζει το χρόνο μέχρι την πρώτη εμπύρετη ελονοσία χρησιμοποιώντας την πρώτη λοίμωξη από την αλυσιδωτή αντίδραση πολυμεράσης που επιβεβαιώθηκε στο στάδιο αίματος με το Plasmodium falciparum ως τον χρόνο έναρξης που στρωματοποιήθηκε από πολυμορφισμούς παραλλαγής κωδικονίου p53 47 (Α) ή κωδικονίου 72 (Β). Η σημασία προσδιορίστηκε από τους αναλογικούς κινδύνους Cox χρησιμοποιώντας τη στατιστική δοκιμή Wald. Οι πίνακες δείχνουν τον αριθμό των ατόμων που διατρέχουν κίνδυνο την υποδεικνυόμενη ώρα από την εγγραφή τους. Συντομογραφία: HR, αναλογία κινδύνου.

Συμπληρωματικά Δεδομένα

Συμπληρωματικό υλικό είναι διαθέσιμο στο The Journal of Infectious Diseases στο διαδίκτυο. Αποτελούμενο από δεδομένα που παρέχονται από τους συγγραφείς προς όφελος του αναγνώστη, το αναρτημένο υλικό δεν υποβάλλεται σε επεξεργασία αντιγραφής και αποτελεί αποκλειστική ευθύνη των συγγραφέων, επομένως οι ερωτήσεις ή τα σχόλια θα πρέπει να απευθύνονται στον αντίστοιχο συγγραφέα.

Σημειώσεις

Ευχαριστίες. Θα θέλαμε να ευχαριστήσουμε τους συμμετέχοντες στη μελέτη και το ερευνητικό προσωπικό υποστήριξης στο Καλιφαμπούγκου και στο Μπαμακό του Μάλι. Είμαστε επίσης ευγνώμονες στους Shanping Li, Emily LaVerriere και Daniel E. Neafsey για την παροχή γονιδιωματικού υλικού και τεχνικής καθοδήγησης.

Συνεισφορές συγγραφέα. Η PDC και η TMT συνέλαβαν το έργο. Οι SD, KK, AO, BT, PDC και TMT σχεδίασαν την αρχική μελέτη κοόρτης και οι SD, KK, AO και BT την υλοποίησαν. Ο ELG πραγματοποίησε τα πειράματα. Οι JB, AU, ELG και TMT πραγματοποίησαν την ανάλυση δεδομένων. Το PDC συνεισέφερε πρόσθετους πόρους. Οι JB, PDC και TMT έγραψαν το χειρόγραφο. Όλοι οι συγγραφείς διάβασαν και ενέκριναν το χειρόγραφο.

Αποποίηση ευθυνών. Το περιεχόμενο είναι αποκλειστικά ευθύνη των συγγραφέων και δεν αντιπροσωπεύει απαραίτητα τις επίσημες απόψεις των Εθνικών Ινστιτούτων Υγείας.

Οικονομική υποστήριξη. Αυτή η εργασία υποστηρίχθηκε από το Εθνικό Ινστιτούτο Αλλεργιών και Λοιμωδών Νοσημάτων (NIAID) και τα Εθνικά Ινστιτούτα Υγείας (επιχορηγεί R01AI158719 και K08AI125682 στην TMT). Η μελέτη κοόρτης Καλιφαμπούγκου υποστηρίζεται από το Τμήμα Ενδοσχολικής Έρευνας του NIAID.

Πιθανές συγκρούσεις συμφερόντων. Όλοι οι συντάκτες: Δεν αναφέρθηκαν διενέξεις. Όλοι οι συγγραφείς έχουν υποβάλει το Έντυπο ICMJE για αποκάλυψη πιθανών συγκρούσεων συμφερόντων. Έχουν αποκαλυφθεί συγκρούσεις που οι συντάκτες θεωρούν σχετικές με το περιεχόμενο του χειρογράφου.

βιβλιογραφικές αναφορές

1. Sundararaman SA, Plenderleith LJ, Liu W, et al. Γονιδιώματα κρυπτικών ειδών χιμπατζή Plasmodium αποκαλύπτουν βασικά εξελικτικά γεγονότα που οδηγούν στην ανθρώπινη ελονοσία. Nat Commun 2016; 7:11078.

2. Kwiatkowski DP. Πώς η ελονοσία έχει επηρεάσει το ανθρώπινο γονιδίωμα και τι μπορεί να μας διδάξει η ανθρώπινη γενετική για την ελονοσία. Am J Hum Genet 2005; 77:171–92.

3. Allison AC. Προστασία που παρέχεται από το δρεπανοκυτταρικό χαρακτηριστικό έναντι της λοίμωξης από ελονοσία. Br Med J 1954; 1:290–4.

4. Lell Β, May J, Schmidt-Ott RJ, et al. Ο ρόλος των πολυμορφισμών των ερυθρών αιμοσφαιρίων στην αντίσταση και την ευαισθησία στην ελονοσία. Clin Infect Dis 1999; 28:794–9.

5. Lopera-Mesa TM, Doumbia S, Konate D, et al. Επίδραση των παραλλαγών των ερυθρών αιμοσφαιρίων στην παιδική ελονοσία στο Μάλι: μια προοπτική μελέτη κοόρτης. Lancet Haematol 2015; 2: e140–9.

6. Ravenhall Μ, Campino S, Sepulveda Ν, et al. Νέοι γενετικοί πολυμορφισμοί που σχετίζονται με σοβαρή ελονοσία και υπό εκλεκτική πίεση στη βορειοανατολική Τανζανία. PLoS Genet 2018; 14:e1007172.

7. Ndila CM, Uyoga S, Macharia AW, et al. Πολυμορφισμοί ανθρώπινου υποψηφίου γονιδίου και κίνδυνος σοβαρής ελονοσίας σε παιδιά στο Kilifi, Κένυα: μελέτη συσχέτισης περιπτώσεων ελέγχου. Lancet Haematol 2018; 5:e333-45.

8. Ebel ER, Uricchio LH, Petrov DA, Egan ES. Επανεξέταση της υπόθεσης της ελονοσίας: λογιστικοποίηση της πολυγονικότητας και της πλειοτροπίας. Trends Parasitol 2022; 38:290–301.

9. Γονιδιωματικό Επιδημιολογικό Δίκτυο Ελονοσίας. Πληροφορίες σχετικά με την ευαισθησία στην ελονοσία χρησιμοποιώντας δεδομένα σε όλο το γονιδίωμα σε 17,000 άτομα από την Αφρική, την Ασία και την Ωκεανία. Nat Commun 2019; 10:5732.

10. Kaushansky A, Ye AS, Austin LS, et al. Η καταστολή του ξενιστή p53 είναι κρίσιμη για τη μόλυνση στο ηπατικό στάδιο με Plasmodium. Cell Rep 2013; 3:630–7.

11. Tran TM, Guha R, Portugal S, et αϊ. Μια μοριακή υπογραφή στο αίμα αποκαλύπτει το ρόλο της ρ53 στη ρύθμιση της φλεγμονής που προκαλείται από την ελονοσία. Ανοσία 2019; 51:750–65.ε10.

12. Baugh EH, Ke H, Levine AJ, Bonneau RA, Chan CS. Γιατί υπάρχουν μεταλλάξεις hotspot στο γονίδιο TP53 σε ανθρώπινους καρκίνους; Cell Death Differ 2018; 25:154–60.

13. Hoyos D, Greenbaum B, Levine AJ. Οι γονότυποι και οι φαινότυποι των μεταλλάξεων με λάθος νόημα στον τομέα προλίνης της πρωτεΐνης p53. Cell Death Differ 2022; 29:938–45.

14. Harris Ν, Brill Ε, Shohat Ο, et αϊ. Μοριακή βάση για την ετερογένεια της ανθρώπινης πρωτεΐνης p53. ΜοΙ Cell Biol 1986; 6:4650–6.

15. Matlasewski GJ, Tuck S, Pim D, Lamb P, Schneider J, Crawford LV. Πολυμορφισμός πρωτογενούς δομής στο υπόλειμμα αμινοξέος 72 της ανθρώπινης ρ53. ΜοΙ Cell Biol 1987; 7: 961–3.

16. Katkoori VR, Jia X, Shanmugam C, et αϊ. Η προγνωστική σημασία του πολυμορφισμού του κωδικονίου 72 p53 διαφέρει ανάλογα με τη φυλή στο αδενοκαρκίνωμα του παχέος εντέρου. Clin Cancer Res 2009; 15: 2406–16.

17. Beckman G, Birgander R, Sjalander Α, et αϊ. Διατηρείται ο πολυμορφισμός p53 από τη φυσική επιλογή; Hum Hered 1994; 44:266–70.

18. Thomas M, Kalita A, Labrecque S, Pim D, Banks L, Matlasewski G. Δύο πολυμορφικές παραλλαγές της ρ53 άγριου τύπου διαφέρουν βιοχημικά και βιολογικά. ΜοΙ Cell Biol 1999; 19:1092–100. 19. Shi Η, Tan SJ, Zhong Η, et αϊ. Η χειμερινή θερμοκρασία και η υπεριώδης ακτινοβολία συνδέονται στενά με τις γενετικές αλλαγές στην οδό καταστολής του όγκου p53 στην Ανατολική Ασία. Am J Hum Genet 2009; 84:534–41.

20. McGregor JM, Harwood CA, Brooks L, et al. Σχέση μεταξύ του πολυμορφισμού του κωδικονίου 72 p53 και της ευαισθησίας σε ηλιακά εγκαύματα και καρκίνο του δέρματος. J Invest Dermatol 2002; 119: 84–90.

21. Nan H, Qureshi AA, Hunter DJ, Han J. Αλληλεπίδραση μεταξύ του πολυμορφισμού του κωδικονίου 72 p53 και των παραλλαγών του υποδοχέα μελανοκορτίνης 1 στην απόκριση στο μαύρισμα και στον κίνδυνο δερματικού μελανώματος. Br J Dermatol 2008; 159:314–21.

22. Cotignola J, Chou JF, Roy Ρ, et αϊ. Διερεύνηση της επίδρασης των πολυμορφισμών MDM2 SNP309 και TP53 Arg72Pro στην ηλικία εμφάνισης δερματικού μελανώματος. J Invest Dermatol 2012; 132:1471–8.

23. Liu T, Lei Z, Pan Z, et al. Γενετική συσχέτιση μεταξύ του πολυμορφισμού του κωδικονίου 72 p53 και του κινδύνου δερματικού ακανθοκυτταρικού καρκινώματος. Tumor Biol 2014; 35:3899–903.

24. Gloria-Bottini FMG, Saccucci P, Bottini E. P53 κωδικόνιο 72 και παλαιότερη νοσηρότητα ελονοσίας στη Σαρδηνία. Malar Chemoth Cont Elimination 2013; 2(1):107.

25. Dumont P, Leu JI, Della Pietra AC 3rd, George DL, Murphy M. Οι πολυμορφικές παραλλαγές του κωδικονίου 72 της ρ53 έχουν σημαντικά διαφορετικά αποπτωτικά δυναμικά. Nat Genet 2003; 33:357–65. 26. Felley-Bosco E, Weston A, Cawley HM, Bennett WP, Harris CC. Λειτουργικές μελέτες ενός πολυμορφισμού βλαστικής γραμμής στο κωδικόνιο 47 εντός του γονιδίου p53. Am J Hum Genet 1993; 53:752–9.

27. Li X, Dumont P, Della Pietra A, Shetler C, Murphy ME. Ο πολυμορφισμός του κωδικονίου 47 στο p53 είναι λειτουργικά σημαντικός. J Biol Chem 2005; 280:24245–51.

28. Barnoud T, Parris JLD, Murphy ME. Κοινές γενετικές παραλλαγές στην οδό TP53 και η επίδρασή τους στον καρκίνο. J Mol Cell Biol 2019; 11:578–85.

29. Jennis Μ, Kung CP, Basu S, et αϊ. Ένας αφρικανικός ειδικός πολυμορφισμός στο γονίδιο TP53 βλάπτει τη λειτουργία του καταστολέα όγκου p53 σε ένα μοντέλο ποντικού. Genes Dev 2016; 30: 918–30.

30. Singh KS, Leu JI, Barnoud Τ, et αϊ. Η αφρικανοκεντρική παραλλαγή TP53 αυξάνει τη συσσώρευση σιδήρου και την παθογένεση των βακτηρίων, αλλά βελτιώνει την απόκριση στην τοξίνη της ελονοσίας. Nat Commun 2020; 11:473.

31. Gai PP, Meese S, Bedu-Addo G, Gahutu JB, Mockenhaupt FP. Καμία συσχέτιση του πολυμορφισμού του κωδικονίου 72 p53 με την ελονοσία σε παιδιά από την Γκάνα και τα παιδιά της Ρουάντα. Am J Trop Med Hyg 2014; 90:1133–4.

32. Tran TM, Li S, Doumbo S, et αϊ. Μια εντατική μελέτη διαμήκους κοόρτης παιδιών και ενηλίκων από το Μάλι δεν αποκαλύπτει στοιχεία επίκτητης ανοσίας στη μόλυνση από Plasmodium falciparum. Clin Infect Dis 2013; 57:40–7.

33. LaVerriere Ε, Schwabl Ρ, Carrasquilla Μ, et αϊ. Σχεδιασμός και υλοποίηση πάνελ αλληλουχίας πολλαπλών αμπλικονίων για την εξυπηρέτηση της γονιδιωματικής επιδημιολογίας μολυσματικών ασθενειών: μελέτη περίπτωσης ελονοσίας. Mol Ecol Resour 2022; 22: 2285–303.

34. Kawaguchi Η, Ohno S, Araki Κ, et αϊ. p53 Πολυμορφισμός στον καρκίνο του οισοφάγου που σχετίζεται με τον ιό των ανθρώπινων θηλωμάτων. Cancer Res 2000; 60:2753-5.

35. Kun JF, Mordmuller Β, Perkins DJ, et αϊ. Συνθάση νιτρικού οξειδίου 2Lambaréné (G-954C), αυξημένη παραγωγή μονοξειδίου του αζώτου και προστασία από την ελονοσία. J Infect Dis 2001; 184:330–6.

36. Flori L, Delahaye NF, Iraqi FA, Hernandez-Valladares M, Fumoux F, Rihet P. TNF ως υποψήφιο γονίδιο ελονοσίας: διαλογή πολυμορφισμού και ανάλυση συσχέτισης με βάση την οικογένεια της ήπιας επίθεσης ελονοσίας και παρασιταιμίας στη Μπουρκίνα Φάσο. Genes Immun 2005; 6:472–80.

37. Fugtagbi G, Otu PS, Abdul-Rahman Μ, et al. Συσχέτιση των TNF-alpha, MBL2, NOS2 και G6PD με αποτελέσματα ελονοσίας σε άτομα στη Νότια Γκάνα. Genet Res (Camb) 2022; 2022:6686406.

38. Meyer CG, May J, Luty AJ, Lell B, Kremsner PG. Το TNFalpha-308A σχετίζεται με μικρότερα διαστήματα επαναμολύνσεων με Plasmodium falciparum. Tissue Antigens 2002; 59:287–92.

39. Cooks T, Harris CC, Oren M. Caught in the crossfire: p53 in inflamacion. Carcinogenesis 2014; 35:1680–90.

40. Coussens LM, Werb Z. Φλεγμονή και καρκίνος. Nature 2002; 420:860–7.

41. Madenspacher JH, Azzam KM, Gowdy KM, et αϊ. p53 Ενσωματώνει την άμυνα του ξενιστή και τη μοίρα των κυττάρων κατά τη διάρκεια της βακτηριακής πνευμονίας. J Exp Med 2013; 210:891–904.

42. Menendez D, Shatz M, Azzam K, Garantziotis S, Fessler MB, Resnick MA. Η οικογένεια γονιδίων υποδοχέων τύπου Toll είναι ενσωματωμένη στη βλάβη του ανθρώπινου DNA και στα δίκτυα p53. PLoS Genet 2011; 7: e1001360.

43. Frank AK, Leu JI, Zhou Y, et αϊ. Ο πολυμορφισμός του κωδικονίου 72 του p53 ρυθμίζει την αλληλεπίδραση με τον NF-κB και τη μετενεργοποίηση των γονιδίων που εμπλέκονται στην ανοσία και τη φλεγμονή. ΜοΙ Cell Biol 2011; 31:1201–13.

44. Kung CP, Leu JI, Basu S, et αϊ. Ο πολυμορφισμός P72R του p53 προδιαθέτει σε παχυσαρκία και μεταβολική δυσλειτουργία. Cell Rep 2016; 14:2413–25.

45. Gunaratna RT, Santos Α, Luo L, et αϊ. Ο δυναμικός ρόλος του πολυμορφισμού μονονουκλεοτιδίου κωδικονίου 72 p53 στην ογκογένεση του μαστού σε ένα εξανθρωπισμένο μοντέλο ποντικού. Oncogene 2019; 38:3535–50.

46. ​​Kim BY, Lee SY, Chung SK. Διαφορική μεταγραφική ρύθμιση του πολυμορφικού κωδικονίου p53 72 σε μεταβολικές οδούς. Int J Mol Sci 2021; 22:10793.

47. Murphy ME, Liu S, Yao S, et al. Ένα λειτουργικά σημαντικό SNP στην TP53 και τον κίνδυνο καρκίνου του μαστού σε Αφροαμερικανές γυναίκες. NPJ Breast Cancer 2017; 3:5.

48. Portugal S, Tran TM, Ongoiba Α, et al. Η θεραπεία της χρόνιας ασυμπτωματικής λοίμωξης από Plasmodium falciparum δεν αυξάνει τον κίνδυνο κλινικής ελονοσίας κατά την επαναμόλυνση. Clin Infect Dis 2017; 64:645–53.

49. Li T, Kon N, Jiang L, et αϊ. Καταστολή όγκου απουσία p53-διαμεσολαβούμενης από τη διακοπή του κυτταρικού κύκλου, την απόπτωση και τη γήρανση. Cell 2012; 149:1269–83.

50. Grochola LF, Zeron-Medina J, Meriaux S, Bond GL. Πολυμορφισμοί ενός νουκλεοτιδίου στο μονοπάτι σηματοδότησης p53. Cold Spring Harb Perspect Biol 2010; 2:a001032.