Διερεύνηση του μηχανισμού δράσης των ολικών γλυκοσιδών Cistanche στη φλεγμονώδη νόσο του εντέρου με βάση τη φαρμακολογία δικτύου και τα πειράματα σε ζώα Ⅲ

3 Αποτελέσματα και ανάλυση

3.1 Ανάλυση στόχων ολικών γλυκοσιδών Cistanche tubulosa και στόχων ασθενειών

Εισαγάγετε τα αρχεία τρισδιάστατης δομής τουενεργά συστατικάστη βάση δεδομένων PharmMapper για να λάβετε τα αντίστοιχα σημεία στόχου που αντιστοιχούν σε διαφορετικά συστατικά. Η βάση δεδομένων UniProt χρησιμοποιήθηκε για τη λήψη του ονόματος πρωτεΐνης και του ονόματος γονιδίου που αντιστοιχούν σε κάθε στόχο. Συνδυάζοντας τα σημεία στόχου που αντιστοιχούν στα επτά συστατικά, ελήφθησαν συνολικά 354 στόχοι. Στη βάση δεδομένων GeneCards, πραγματοποιήθηκαν αναζήτηση σχετικά γονιδίων χρησιμοποιώντας τη λέξη-κλειδί "φλεγμονώδης νόσος του εντέρου" και τα αποτελέσματα αναζήτησης ταξινομήθηκαν και τελικά ελήφθησαν 7851 στόχοι. Χρησιμοποιήστε συμβάντα για να σχεδιάσετε ένα διάγραμμα Venn στο διαδίκτυο για να λάβετε τη διασταύρωση των στόχων του ενεργού συστατικού του Cistanche tubulosa και των σημείων στόχου του IBD. Όπως φαίνεται στο Σχήμα 1, 254 στόχοι του δραστικού συστατικού τουCistanche tubulosaπου έχουν προστατευτική επίδραση στην ΙΦΝΕ.

Εικ.2 Διάγραμμα PPI-δικτύου κοινών στόχων

Εικ.5 Δίκτυο εξαρτημάτων-στόχου-διαδρομής

Εικ. 7 Οι ολικοί γλυκοσίδες του Cistanche tubulosa ρυθμίζουν προς τα κάτω το mRNA των μονοπατιών σηματοδότησης TGF- και mTOR σε ποντικούς IBD

3.4 Οι ολικές γλυκοσίδες Cistanche tubulosa βελτιώνουν τη βαθμολογία DAI που προκαλείται από το DSS

Τα αποτελέσματα των εξετάσεων έδειξαν ότι, εκτός από την ομάδα CZ, οι άλλες τρεις ομάδες είχαν διάφορους βαθμούς απώλειας βάρους και κρυφό αίμα στα κόπρανα (Εικόνα 6). Μεταξύ αυτών, η ομάδα ελέγχου DSS είχε τον υψηλότερο ρυθμό απώλειας σωματικού βάρους, το πιο σοβαρό αίμα στα κόπρανα, το υψηλότερο DAI και εμφανή αιμορραγία από τα κόπρανα την 6η ημέρα. Μετά την παρέμβαση των ολικών γλυκοσιδών Cistanche tubulosa, η βαθμολογία DAI μειώθηκε σταδιακά και η κατάσταση του κρυφού αίματος σταδιακά μειώθηκε. Η ομάδα HZ είχε τον χαμηλότερο ρυθμό απώλειας σωματικού βάρους και τη χαμηλότερη ποσότητα κρυμμένου αίματος στα κόπρανα. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι ολικές γλυκοσίδες του Cistanche tubulosa βελτίωσαν τις φυσιολογικές αποκρίσεις που προκαλούνται από τη φλεγμονώδη νόσο του εντέρου.

ΣΥΜΠΛΗΡΩΜΑ CISTANCHE ΓΙΑ ΤΗΝ ΘΕΡΑΠΕΙΑ IBD PHGS75% ECH 30% ACT 12%

3.5 Οι ολικές γλυκοσίδες Cistanche tubulosa ρυθμίζουν προς τα κάτω την IBD

Η έκφραση των μονοπατιών σηματοδότησης mTOR και TGF- σε σπλήνα ποντικού Τα μονοπάτια σηματοδότησης mTOR και TGF- είναι δύο σημαντικά μονοπάτια σηματοδότησης που ενεργοποιούν φλεγμονώδεις αποκρίσεις. Η έκφραση του mTOR και του TGF- στον ιστό της σπλήνας των ποντικών ανιχνεύθηκε με qRT-PCR. Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι η έκφραση mRNA του mTOR και του TGF- στα ποντίκια της ομάδας ελέγχου DSS ήταν σημαντικά αυξημένη σε σύγκριση με αυτή των κανονικών ποντικών. Σε σύγκριση με τα ποντίκια ελέγχου DSS, σε σύγκριση με το Cistanche tubulosa, η έκφραση του mTOR και του TGF- σε ποντίκια μειώθηκε σημαντικά μετά την παρέμβαση του Cistanche tubulosa. Μεταξύ αυτών, η ομάδα υψηλής δόσης είχε την πιο σημαντική μείωση και το επίπεδο έκφρασης ήταν βασικά συνεπές με αυτό της φυσιολογικής ομάδας (Εικόνα 7). Τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι ολικοί γλυκοσίδες του Cistanche tubulosa μείωσαν την έκφραση των οδών σηματοδότησης mTOR και TGF.

Εικ. 8 Χάρτης θερμότητας της PICRUSt2-λειτουργικής ομαδοποίησης αφθονίας

3.6 Ανάλυση λειτουργικού σχολιασμού PICRUSt2

Το PICRUSt2 είναι ένα εργαλείο βιοπληροφορικής για την πρόβλεψη της μεταγονιδιωματικής λειτουργίας που βασίζεται σε βιολογικές πληροφορίες 16S rRNA, δέντρου ASV και γονιδίων ASV στη βάση δεδομένων Greengene. Επιλεγμένη βάση δεδομένων COG χρησιμοποιήθηκε για λειτουργική πρόβλεψη και τα αποτελέσματα έδειξαν ότι οι λειτουργίες της εντερικής χλωρίδας περιλαμβάνουν κυρίως επεξεργασία RNA. δομή και δυναμική χρωματίνης. Έλεγχος κυτταρικού κύκλου, κυτταρική διαίρεση, τμηματοποίηση χρωμοσωμάτων. μηχανισμός άμυνας; Βιογένεση σηματοδότησης κυτταρικού τοιχώματος/κυτταρικής μεμβράνης/φακέλλου. κύτταρα Έχει περισσότερες από 20 λειτουργίες όπως εξωκυτταρική δομή. ενδοκυτταρική μεταφορά, έκκριση και μεταφορά κυστιδίων. παραγωγή και μετατροπή ενέργειας· μεταφορά και μεταβολισμό υδατανθράκων. Επιλέξτε τα κορυφαία 15 πιο άφθονα χαρακτηριστικά και τις πληροφορίες για την αφθονία τους σε κάθε δείγμαΈνας χάρτης θερμότητας (Εικόνα 8) σχεδιάζεται για τις πληροφορίες και συγκεντρώνεται από διαφορετικά λειτουργικά επίπεδα.

Σε σύγκριση με την ομάδα CZ, τα ποντίκια της ομάδας ελέγχου DZ είχαν COG1132 (σύστημα μεταφοράς πολλαπλών φαρμάκων τύπου ABC), COG0745 (ρυθμιστής απόκρισης δέσμευσης DNA), COG1131 (σύστημα μεταφοράς πολλαπλών φαρμάκων τύπου ABC), COG1961 (τοποειδική ανασυνδυάση DNA που σχετίζεται με ο Pin ιμβερτάσης DNA), COG0438 (εμπλεκόμενη γλυκοζυλοτρανσφεράσηστη βιοσύνθεση κυτταρικού τοιχώματος), COG0534 (Na +-οδηγούμενηαντλία εκροής πολλαπλών φαρμάκων), COG0642 (κινάση ιστιδίνης μεταγωγής σήματος), COG1595 (υπομονάδα σίγμα εξειδικευμένης RNA πολυμεράσης κατευθυνόμενης), COG0463 (Ενδονουκλεάση), COG4974 (Ειδική τοποθεσία ανασυνδυάσης XerD), COG22C-typeC που περιέχει πρωτεΐνες), COG1136 (σύστημα εξαγωγής λιποπρωτεϊνών τύπου ABC), και COG1309 (DNA-binding transcriptional regulator) ανωμαλίες της λειτουργικής γονιδιακής έκφρασης. Αυτά τα γονίδια εμπλέκονται κυρίως σε: V: αμυντικό μηχανισμό. T: μηχανισμός μεταγωγής σήματος. M: κυτταρικό τοίχωμα/κυτταρική μεμβράνη/βιογένεση φακέλου. I: μεταφορά λιπιδίων και μεταβολισμός. Κ: μεταγραφή; L: αντιγραφή, ανασυνδυασμός και επισκευή.

Αφού σε αυτές τις έξι λειτουργίες δόθηκαν ολικοί γλυκοσίδες του Cistanche tubulosa, η έκφραση αυτών των διαφορετικών φυσιολογικών λειτουργιών ήταν κοντά σε αυτές της φυσιολογικής ομάδας. Σε σύγκριση με τα ποντίκια στις ομάδες CZ και DZ, τα ποντίκια στην ομάδα HZ είχαν υψηλή έκφραση των γονιδίων COG1028 (οικογένεια αλκοολικής αφυδρογονάσης βραχείας αλυσίδας) και COG0451 (νουκλεοσίδη-φωσφορική-σακχαροεπιμεράση). Αυτά τα δύο γονίδια σχετίζονται με το I: μεταφορά λιπιδίων και μεταβολισμός. Και Μ: Οι λειτουργίες βιογένεσης κυτταρικού τοιχώματος/κυτταρικής μεμβράνης/φύλλου συνδέονται στενά. Ως εκ τούτου, εικάζεται ότι οι ολικές γλυκοσίδες Cistanche tubulosa μπορεί να ρυθμίζουν τη βλάβη των ποντικών IBD ρυθμίζοντας τον μεταβολισμό των λιπιδίων, το μεταβολισμό της γλυκόζης και τους σχετικούς μηχανισμούς μεταγωγής αμυντικού σήματος σε ποντίκια.