Μεμονωμένο κύτταρο και ανοσία: Καλύτερη κατανόηση της ετερογένειας των ανοσοκυττάρων με την αλληλουχία ενός κυττάρου

Dec 15, 2023

Η ευαίσθητη ισορροπία της ανοσίας διαμεσολαβείται από συχνές συνομιλίες και περίπλοκες αλληλεπιδράσεις μεταξύ διαφόρων τύπων κυττάρων. Τα ανοσοκύτταρα είναι εξαιρετικά ετερογενή ως προς τους κυτταρικούς τύπους και την κατάσταση ενεργοποίησης. Οι μέθοδοι προσδιορισμού αλληλουχίας ιστών και χύδην κυττάρων συλλαμβάνουν τις συνολικές υπογραφές από μικτά δείγματα, με τις ανεπαίσθητες υπογραφές γονιδίων από σπάνιους αλλά λειτουργικά σημαντικούς τύπους κυττάρων που καλύπτονται από άφθονους κυτταρικούς πληθυσμούς.

Cistanche deserticola-improve immunity

cistanche tubulosa-βελτίωση του ανοσοποιητικού συστήματος

Επιπλέον, οι ενδοκυτταρικές και ενδοκυτταρικές επικοινωνίες που φέρουν βασικές ενδείξεις για τον πολλαπλασιασμό των κυττάρων του ανοσοποιητικού, τη διαφοροποίηση, την ωρίμανση, τη μετανάστευση και τη μετάβαση είναι δύσκολο να χαρακτηριστούν χρησιμοποιώντας παραδοσιακές μεθόδους. Το τρέχον ειδικό θέμα είχε ως στόχο να επικεντρωθεί στην ταχεία πρόοδο των μελετών που βασίζονται σε μονοκύτταρα σχετικά με τη λοιμώδη ανοσία, την ανοσολογία του καρκίνου, την έμφυτη ανοσία και τις διαταραχές του ανοσοποιητικού συστήματος, όπως φαίνεται στο Σχήμα 1.

Desert ginseng-Improve immunity (12)

Οφέλη του cistanche για τους άνδρες-ενισχύουν το ανοσοποιητικό σύστημα

Η αλληλουχία ενός κυττάρου έχει επιστημονικές επιπτώσεις στην κλινική και μεταφραστική ανακάλυψη. Την τελευταία δεκαετία, ο προσδιορισμός αλληλουχίας RNA μονοκυττάρου (scRNA-seq) έχει προκαλέσει μια πραγματική επανάσταση στην ανοσολογική έρευνα. Ως εργαλεία μοριακού προφίλ μονοκυττάρου, οι τεχνολογίες scRNA-seq παρέχουν καλύτερη κατανόηση της ετερογένειας που σχετίζεται με μεμονωμένα ανοσοκύτταρα και τις αποκρίσεις σε μοριακά επίπεδα υπό φυσιολογικές και παθολογικές συνθήκες.1 Οι μελέτες που βασίζονται σε αλληλουχία μονοκυττάρου έχουν εντοπίσει με επιτυχία νέα υποσύνολα ανοσοκυττάρων και αναπτυξιακές τροχιές.2 Οι μολυσματικές ασθένειες και οι καρκίνοι αποτελούν επείγουσα απειλή για την ανθρώπινη υγεία. Το πώς να μεταφράσουμε την κατανόησή μας για τον μοριακό μηχανισμό της ανοσολογικής ρύθμισης σε κλινικές θεραπείες παραμένει μια μεγάλη πρόκληση.

Desert ginseng-Improve immunity (15)

φυτικό κιστανάκι που ενισχύει το ανοσοποιητικό σύστημα

Κάντε κλικ εδώ για να δείτε τα προϊόντα Cistanche Enhance Immunity

【Ζητήστε περισσότερα】 Email:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

Με την τεχνολογία scRNA-seq, έχουν επιτευχθεί σημαντικές ανακαλύψεις. Για παράδειγμα, οι διακριτές οδοί ανοσοαπόκρισης μεταξύ των λοιμώξεων με τον ιό της γρίπης Α και του σοβαρού οξέος αναπνευστικού συνδρόμου κορωνοϊού-2 (SARS-CoV-2) αποκαλύφθηκαν σε ανάλυση ενός κυττάρου.3 Ο SARS-CoV{{ 7}}εξουδετερωτικά αντισώματα ταυτοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας scRNA-seq εμπλουτισμένων με αντιγόνο Β-λεμφοκυττάρων ασθενών με COVID-19.4 Κατασκευάστηκαν συστηματικά ο διασταυρούμενος ανοσοποιητικός άτλαντας και ο αναπτυξιακός ανοσοποιητικός άτλαντας των ανθρώπων.5,6 Το scRNA-seq Η τεχνολογία έχει αποδειχθεί ότι είναι ένα ισχυρό εργαλείο για την αποκάλυψη μηχανισμών ανοσολογικής διαφυγής σε ιστούς όγκου.7

FIGURE 1 The topic of single cell and immunity is mainly focused on immune system disorders, infectious immunity, cancer immunity, inflammatory immunity, virus-associated immunity, and innate immunity. Schematic diagrams were created with BioRender.com.


ΕΙΚΟΝΑ 1 Το θέμα του μονοκύτταρου και της ανοσίας επικεντρώνεται κυρίως στις διαταραχές του ανοσοποιητικού συστήματος, τη λοιμώδη ανοσία, την ανοσία κατά του καρκίνου, τη φλεγμονώδη ανοσία, την ανοσία που σχετίζεται με τον ιό και την έμφυτη ανοσία. Δημιουργήθηκαν σχηματικά διαγράμματα με το BioRender.com.

Desert ginseng-Improve immunity (16)

cistanche tubulosa-βελτίωση του ανοσοποιητικού συστήματος

Υπάρχει ταχεία πρόοδος στα εργαλεία ανάλυσης ενός κυττάρου. Αναπτύχθηκε μια μεγάλη ποικιλία ολοκληρωμένων διαδικτυακών βάσεων δεδομένων για την αποθήκευση και ανάλυση συνόλων δεδομένων μιας κυψέλης.8–13 Απαιτείται επειγόντως η καινοτομία περισσότερων εργαλείων βιοπληροφορικής για την ενοποίηση δεδομένων από μια ποικιλία τεχνολογιών και τύπων δεδομένων. Ένα κρίσιμο καθήκον είναι η τυποποίηση του σχολιασμού των ανοσοκυττάρων και η εκμετάλλευση του πλήρους φάσματος των τύπων δεδομένων. Αυτό θα επιτρέψει τη δυνατότητα συνεργασίας στην ανάλυση δεδομένων μεταξύ ακαδημαϊκού κόσμου, βιομηχανίας και κλινικών ιδρυμάτων. Έτσι, η συντονισμένη προσπάθεια από αυτό το ειδικό θέμα θα προωθήσει την κατανόησή μας για την ανοσολογική έρευνα και θεραπείες.

Desert ginseng-Improve immunity (23)

cistanche tubulosa-βελτίωση του ανοσοποιητικού συστήματος

ΒΙΒΛΙΟΓΡΑΦΙΚΕΣ ΑΝΑΦΟΡΕΣ

1. Giladi A, Amit I. Μονοκυτταρική γονιδιωματική: ένα σκαλοπάτι για μελλοντικές ανακαλύψεις ανοσολογίας. Κύτταρο. 2018;172(1):14-21. https://doi.org/ 10.1016/j.cell.2017.11.011

2. Papalexi E, Satija R. Μονοκυτταρική αλληλουχία RNA για τη διερεύνηση της ετερογένειας των ανοσοκυττάρων. Nat Rev Immunol. 2018; 18(1):35-45. https://doi.org/10.1038/nri.2017.76

3. Zhu L, Yang Ρ, Zhao Y, et αϊ. Η αλληλουχία μονοκυττάρου των περιφερειακών μονοπύρηνων κυττάρων αποκαλύπτει ξεχωριστά τοπία ανοσοαπόκρισης ασθενών με COVID-19 και γρίπη. Ασυλία, ανοσία. 2020;53(3):685- 696. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009. ε3.

4. Cao Y, Su B, Guo X, et αϊ. Ισχυρά εξουδετερωτικά αντισώματα κατά του SARS-CoV-2 που εντοπίζονται με προσδιορισμό αλληλουχίας μονοκυττάρου υψηλής απόδοσης των Β κυττάρων ασθενών που βρίσκονται σε ανάρρωση. Κύτταρο. 2020;182(1):73-84. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.025. ε16.

5. Suo C, Dann E, Goh I, et αϊ. Χαρτογράφηση του αναπτυσσόμενου ανθρώπινου ανοσοποιητικού συστήματος σε όλα τα όργανα. Επιστήμη. 2022;376(6597):eabo0510. https://doi.org/10.1126/science.abo0510

6. Domínguez Conde C, Xu C, Jarvis LB, et al. Η ανάλυση διασταυρούμενων ιστών ανοσοκυττάρων αποκαλύπτει ειδικά για τον ιστό χαρακτηριστικά στον άνθρωπο. Επιστήμη. 2022;376(6594):eabl5197. https://doi.org/10.1126/science.abl5197

7. Zhang Y, Wang D, Peng Μ, et αϊ. Αλληλουχία μονοκυτταρικού RNA στην έρευνα για τον καρκίνο. J Exp Clin Cancer Res. 2021; 40 (1): 81. https://doi. org/10.1186/s13046-021-01874-1

8. Chen D, Tan C, Ding P, et al. VThunter: μια βάση δεδομένων για τον έλεγχο μονοκυττάρων κυττάρων-στόχων ιών στο ζωικό βασίλειο. Nucleic Acids Res. 2022;50(D1):D934-D942. https://doi.org/10.1093/nar/ gkab894

9. Chen Y, Zhang X, Peng X, et αϊ. ΤΑΧΥΤΗΤΑ: μονοκύτταρος άτλαντας παν-ειδών υπό το πρίσμα της οικολογίας και της εξέλιξης για την ανάπτυξη και τις ασθένειες. Nucleic Acids Res. https://doi.org/10.1093/nar/gkac930. Δημοσιεύθηκε διαδικτυακά στις 28 Οκτωβρίου 2022:gkac930.

10. Han X, Wang R, Zhou Y, et αϊ. Χαρτογράφηση του άτλαντα κυττάρων ποντικιού με microwell-Seq. Κύτταρο. 2018;172(5):1091-1107. https://doi.org/10. 1016/j.cell.2018.02.001. ε17.

11. Chen D, Sun J, Zhu J, et αϊ. Άτλαντας ενός κυττάρου για 11 θηλαστικά, ερπετά και πτηνά που δεν είναι μοντέλα. Nat Commun. 2021; 12(1):7083. https://doi.org/10.1038/s{10}}

12. Han X, Zhou Ζ, Fei L, et αϊ. Κατασκευή τοπίου ανθρώπινων κυττάρων σε μονοκύτταρο επίπεδο. Φύση. 2020;581(7808):303-309. https:// doi.org/10.1038/s41586-020-2157-4

13. Ma P, Liu X, Xu Z, et al. Κοινό προφίλ της γονιδιακής έκφρασης και της προσβασιμότητας της χρωματίνης κατά την ανάπτυξη του αμφίοξου σε ανάλυση ενός κυττάρου. Cell Rep. 2022;39(12). https://doi.org/10. 1016/j.celrep.2022.110979

Μπορεί επίσης να σας αρέσει