Πολυπαραγοντική Seroproiling Disects The Contribution of Pre-Existing Human Coronaviruses Responses to SARS-CoV-2 Immunity (Μέρος 2)
Jun 15, 2022
Για περισσότερες πληροφορίες, παρακαλώ επικοινωνήστεdavid.wan@wecistanche.com
Ανάλυση του χρονικός αντίσωμα δυναμική με ABCORA ser-oprofiεδώδιμος ιχθύς του βορρά. Σταυρός-τμηματικόςανάλυση του αντιδραστικότητα αντισωμάτων μετά τον SARS-CoV-2διάγνωση από RT-PCR (N = 369) καιμετά την έναρξη τουσυμπτώματα (N = 333) υπογραμμίστηκε ο χωρητικότητα του ABCORA ser- oprofiεπιδιώκουν την ανατομή της έναρξης, της κορύφωσης και της εξάντλησης του SARS-CoV-2 αντίσωμα απαντήσεις (Σύκο. 5a, β, Συμπληρωματικό Σχ. 11). Σε άτομα με a γνωστός ημερομηνία του fiπρώτον Διάγνωση SARS-CoV-2 RT-PCR ή έναρξη συμπτωμάτων, ανιχνεύει το ABCORA 2.3εκδ νωρίς ορομετατροπή-Σιών σε 98 τοις εκατό (48του 49) και100 τοις εκατό (9του 9) του τα άτομα στα πλαίσια7 ημέρες μετά την RT-PCR και την έναρξη των συμπτωμάτων, αντίστοιχα. εκτός IgM και Η αντιδραστικότητα IgA, οι αποκρίσεις IgG ήταν εύκολα ανιχνεύσιμες σε ABCORA 2.0 μετά από μερικές ημέρες μόλυνσης (ΣυμπληρωματικόντάριΣύκο. 11a).
Διαχρονική αξιολόγηση μιας κοόρτηςτου αναρρωνύων ασθενείς πάνωπρος την 11 μήνες μετά τη μόλυνση (251 μετρήσεις σε 120 ασθενείς) τονίζεταιοχρονικόςδυναμικήτου SARS-CoV-2 δεσμευτικά αντισώματα. Υπολογίσαμε τη φθορά οf δεσμευτικός αντιδραστικότητα απασχολώντας aεξουσία-νόμος μεικτό μοντέλο και προσδιόρισε ένα σημαντικό reduδράση σε RBD, S1, και N σε όλα Ig υποτύπους (Σύκο. 5b) μεημιζωές κυμαίνεται από 67 προς την 404 ημέρες, με τους τίτλους IgG N να αποσυντίθενται ταχύτερος,σεγραμμήμεπροηγούμενος Αναφορές10. τα μισα-ζειτουο ουδέτεροςiεπίλυση σχετικό IgG απαντήσεις προς την RBD και S1 ήταν 125 και 404 ημέρες, αντίστοιχα. Περιέργως, η κινητική της εξουδετέρωσης αντισώματα έκανε δεν καθρέφτης ο φθορά ποσοστά παρατηρείται για δέσιμο αντισώματα. Η δραστηριότητα εξουδετέρωσης μειώθηκε συνολικάll στο a βραδύτερητιμή, με a τα μισα-διάρκεια ζωής 991 ημερών (Εικ.5ντο). Αυτό οφειλόταν εν μέρει σε αμικτόςαντιδραστικότηταπρότυπομεμερικοίτα άτομαεπίδειξηένααυξάνουν σε εξουδετέρωση δραστηριότητα Θέση θετικός SARS-CoV-2 RT- PCR5, ενώ η δραστηριότητα εξουδετέρωσης σε άλλους μειώθηκε γρήγορα (Συμπληρωματικός Εικ. 11γ).
Υπάρχοντα του HCV ασυλία, ανοσία επί SARS-CoV-2 απόκτηση. Προς την
επιτρέπουν τη διερεύνηση των αλληλεξαρτήσεων μεταξύ των προϋπαρχόντωνng immενότητα προς την HCoV και SARS-CoV-2 μόλυνση, εμείς αναπτυγμένος οABCORA χάντρα αντιγόνο πίνακας προς την περιλαμβάνω S1 πρωτεΐνες του όλα κυκλοφορούν τέσσερα HCoVs (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1,HCV-OC43) (Υπσυμπληρωματική Σύκο. 12a). Σύμφωνα με προς την τουχωρητικότητα προς την οθόνη αντισώματα προς την five κορωνοϊοί, εμείς ορίζεται ο προσδιορισμός ABCORA 5.0 και εκπαιδευμένο και επικυρώθηκε το επί ο ίδιοκοόρτες όπως και ABCORA 2.0 (Σύκο. 1). Για να επιτρέπεται η άμεση σύγκριση με ABCORA 2.0 καιοχρήση των μοντέλων πρόβλεψης εξουδετέρωσης, εμείςμεταχειρισμένος ο κατώφλι-/Ρυθμίσεις ανάλυσης βάσει SOC του ABCORA 2.0 επίσης Για ABCORA 5.0. Με βάση επί ABCORA 5.0 μετρήσεις του εκπαίδευση κοόρτες I–III, εμείς επινοήθηκε δύο τυχαίος δάσος-βασισμένη ανάλυση μοντέλα. ΑΓΚΥΡΑ 5.4 περιλαμβάνεται μόνο ο 12 SARS-CoV-2 παραμέτρους και το ABCORA 5.5 περιλαμβάνειd σεπρόσθεση ο S1 HCoV Μετρήσεις προσθέτωντας έως 24 παραμέτρους συνολικά. Σε αναλογία μεABCORA 2.3, ενσωμάτωση του HCV αντιδραστικότητα σε ο μοντέλοήταν επωφελής. ΑΓΚΥΡΑ 5.5 παρείχε την υψηλότερη ευαισθησία καιspecifiπόλη μεταξύ ο ανάλυση αλγόριθμους ανιχνευμένο ABCORA 5.0 (Συμπληρωματικός Εικ. 12β, Συμπληρωματικός Πίνακας 10).
Αλληλεξαρτήσεις μεταξύαντίσωμα αντιδραστικότητα προς την ο τέσσερις HCoV και SARS-CoV-2 καθρέφτης τι εμείς προηγουμένως παρατηρήθηκε
Για HKU1 με a ιδιαίτερα υψηλός συσχέτιση του IgM αντιδραστικότητα του
SARS-CoV-2 και HCoVs σε προ-πανδημία άτομα, ιδιαίτερα σεεκείνοιμεπρόσφατος HCV μόλυνση (ΣυμπληρωματικόςΕικ. 13). Οι λοιμώξεις από HCV είναι συχνές αλλά υπόκεινται σε εποχικότητακαιοεπικράτηση του άτομο HCV λοιμώξεις ευστοχεί41,42. Στη γραμμή με αυτό, ο επιπολασμός των αποκρίσεων HCV μετρήθηκε με ABCORA 5.0 σε τοπικός αίμα δωρητές σε Ιανουάριος 2019 (N = 285), Ενδέχεται 2019 (N=288) και τον Ιανουάριο του 2020 (N=252) διαφοροποιήθηκανπολύ (Σύκο. 6). Προς την επιτρέπω a χρόνος-ελεγχόμενη σύγκριση HCV αντιδραστικότητα μεταξύ SARS-CoV-2-μολυσμένος και υγιείς δότες, εμείς προβλήθηκε αίμα δωρητές από Ενδέχεται 2020 (N = 672), πότε SARS-CoV-2 επικράτηση ήταν εκτιμάται κάτω από 2 τοις εκατό στη Ζυρίχη, Ελβετία43, με ABCORA 2.{{0}}/5.0 και εξαιρούνται όλα τα δείγματα με SARS-CoV-2 αντιδραστικότητα. ο υπολειπόμενο Ενδέχεται 2020κοόρτη (N=653)σχηματίστηκε a πανδημία, υγιής δότης έλεγχος ομάδα. Με ενδιαφέρο,Τα πρότυπα αντιδραστικότητας του HCV το 2019 και το 2020 διαφέρουνέριξε ουσιαστικά όπως και αξιολογηθεί με ένας-τρόπος ANOVA, με τον Ιανουάριο του 2020 να δείχνει τηνσυγκριτικά χαμηλότερο και Ενδέχεται 2020 ο ύψιστος IgA και IgGαντιδραστικόςity, οι οποίες ενδέχεται υποδεικνύω a αργότερα επίθεση του ένα HCV επιδημία το 2020 σε σύγκριση με το 2019 (t-test του Μαΐου 2020 έναντι άλλων ομάδες sπώς λες σε Σύκο. 6).
Το πιο συναρπαστικό είναι ότι μια χρονικά αντιστοιχισμένη ανάλυση comφλούδι Ενδέχεται2020 υγιείς δότες με θετικούς ασθενείς SARS-CoV-2-lεκδσε έναπριλ, Ενδέχεται, και Ιούνιος 2020 (N = 65) αποκάλυψε signifiανυπόμονα πιο χαμηλαHCV αντιδραστικότητα σε SARS-CoV-2 θετικός ασθενείς (Σύκο. 7a). Αυτό πρότυπο ήταν επίσης εμφανές πότε εμείς επέκτεινε την ανάλυση ώστε να συμπεριλάβει ογεμάτοςσώμα στρατούτου SARS-CoV-2 μετρήθηκαν μολυσμένα άτομαμε ABCORA 5.0 (N=389, δείγμα από τον Μάρτιο του 2020 έωςΦεβρουάριος 2021, Συμπληρωματικός Σύκο. 14). Συνολικά, αυτά τα αποτελέσματα σεdicated ότι προ-υπάρχον απρόσβλητος απαντήσεις προς την HCoVs ενδέχεται προς την a κάποιου βαθμού προστασία από τη μόλυνση SARS-CoV-2iεπί.


Κάντε κλικ εδώ για να μάθετε περισσότερα για το Cistanche
Σύκο. 5 Παρακολούθηση χρονικός εξέλιξη του αντίσωμα απαντήσεις. ένα ABCORA 2.3 ορισμός του οροθετικότητα σε δωρητές με θετικός RT-PCR επιβεβαιωμένος SARS- μόλυνση από CoV-2 και γνωστή ημερομηνία RT-PCR (N = 369). Οροθετικότητα εκτίμησησχετικά με πλάσμα αίματος δειγματοληψία χρόνος σημείομετά τη διάγνωση είναι απεικονίζεται. Γκρί σκιασμένη περιοχή καλύτερες στιγμές ο πρώτα επτά ημέρες Από θετικός RT-PCR ανίχνευση. bΕξουσία-νόμος μοντέλο, με χρόνος Από RT-PCR όπως και σταθερός αποτέλεσμα και ατομικό ως τυχαίο αποτέλεσμα, εκτιμώντας ο φθορά του δραστηριότητα δέσμευσης αντισωμάτων με βάση μετρήσεις ABCORA 2.0 σε 1–4 διαμήκη χρονικά σημεία σε 120 άτομα συνολικά251 μέτροnts. Μωβ γραμμές ανταποκρίνομαι προς την ο του μοντέλου εκτίμηση καιμωβ-σκιασμένος περιοχές προς την ο95 τοις εκατόαυτοπεποίθηση διαστήματα. Αντίσωμα τα μισα-ζει (t1/2 σε μέρες) από σημαντικός μοντέλα είναι απεικονίζεται. Σημασία ήταν αξιολογηθεί χρησιμοποιώντας Ο Σάτερθγουέιτ προσέγγιση Για a δύο-πλευρικά t-δοκιμή επί ο κλίση Παράμετροι. γ Εξουσία-νόμος μοντέλο, με χρόνος Από RT-PCR όπως και σταθερός αποτέλεσμα και άτομο όπως και a τυχαίος αποτέλεσμα, εκτιμώντας ο φθορά του εξουδετερώνοντας χωρητικότητα επί 251Μετρήσεις από 120 τα άτομα. Μόνο τα άτομα με NT50 > 100στο δικα τους πρώτα μέτρηση ήταν μεταχειρισμένος προς την εκτίμηση ο τα μισα-ΖΩΗ. ο μωβ η γραμμή αντιστοιχεί προς την ο μοντέλο εκτίμηση και ο μωβ σκιασμένος περιοχή προς την ο95 τοις εκατόαυτοπεποίθηση διαστήματα. Σημασία ήταν αξιολογηθεί χρησιμοποιώντας Προσέγγιση Satterthwaite Για a δύο-πλευρικά t-δοκιμή επί ο κλίση Παράμετροι.


Σύκο. 6 Εποχής και Ετήσιο flπροσαγωγή σε HCV αντιδραστικότητα. Αντιδραστικότητα προς την ο άνθρωπος κορωνοϊοί (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43)ήταν σε συγκριση με ABCORA 5.0. Αντιδραστικότητα σε υγιής αίμα δωρητές από 2019 και 2020 ήταν σε συγκριση. Προ-πανδημία δείγματα περιλαμβάνεται: Ιανουάριος 2019 (N = 285), Ενδέχεται 2019 (N = 288), Ιανουάριος 2020 (N = 252). Δείγματα από Ενδέχεται 2020 (N = 672) ήταν συγκεντρωμένος στη διάρκεια ο πανδημία σε Ελβετία. Μόνο δείγματα χωρίς SARS-CoV-2 ειδικός αντιδραστικότητα όπως και ορίζεται με ABCORA ήταν περιλαμβάνεται (N = 653). αστέρια ανταποκρίνομαι προς την επίπεδα του σημασία του δύο-πλάγιος τ-δοκιμές συγκρίνοντας ο υποδεικνύεται ομάδες. Επίπεδα του σημασία είναι διορθώθηκε με ο Bonferroni μέθοδος Για πολλαπλούς δοκιμές και υποδεικνύεται όπως και ακολουθεί: *p< 0.05/36, **p < 0.01/36,="">p< 0.001/36.Κουτιά εκπροσωπώ ο ΕΠΟΜΕΝΟ: διάμεσος με ο Μέσης γραμμή, ανώτερος και πιο χαμηλα τεταρτημόρια με ο κουτί όρια, 1.5x μεσοτεταρτημόριο σειρές με ο φαβορίτα, και ακραίες τιμές με σημεία.
Υπάρχοντα του HCV ασυλία, ανοσία σε SARS-CoV-2 μόλυνση. Προς την
διερευνήσουμε περαιτέρω τις αλληλεξαρτήσεις με την ανοσία του HCVxtερευνηθεί αν HCV απαντήσεις είναι συνδεδεμένο στην εξέλιξητου SARS-CoV-2 αντισώματα. Προς την Αυτό Τέλος, αναλύσαμε τα αντισώματααποκρίσεις στο πλάσμα 204 ατόμων που έλαβαν δείγμα μεσε 60 ημέρες μετά τον SARS-CoV-2διάγνωση χρησιμοποιώντας ένα μοντέλο γραμμικής παλινδρόμησης προσαρμοσμένο για την ηλικία, το φύλο και τον χρόνο από τη θετική RT-PCR και HCVαντιδραστικότητα. Προς την στρωματίζω HCoV αντιδραστικότητα σε υψηλός και χαμηλός Δραστηριότητα HCoV, διάμεσοςημερολόγιο MFI-ΕΧΘΡΟΣ ήταν defined Για καθε HCV καιαντίσωματάξη. LogMFI-FOE υψηλότερο από το αντίστοιχοδιάμεσος για τουλάχιστονt τρία HCoVs (HKU1, OC43, NL63, ή 229E) σε μια συγκεκριμένηc Ig τάξη ήταν κατατάσσονται όπως και έχοντας υψηλός HCV δραστηριότηταεντός αυτής της τάξης. Πρώτον, μόνο αντιδράσεις μεταξύ του ίδιου αντιbόντιτάξη were εξερευνηθεί σε ο μοντέλο (i.e., HCV IgG υψηλός επί SARS- CoV-2 IgG). Παρατηρήσαμε εξαιρέσειςllyισχυρόςαλληλεξαρτήσεις Για IgA και IgM απαντήσεις στον SARS-CoV-2, ο οποίοςόλαήτανsignifiανυπόμοναπιο ψηλάσετα άτομαμευψηλός HCVαντιδραστικότητα (Σύκο. 7b). Αυτό υποδηλώνει έντονα ότι προϋπάρχον HCV μπορεί να παρέχει ανοσίαe ένα πλεονέκτημα σε βάση SARS-CoV-2 απαντήσεις.Αλληλεξαρτήσεις μεταξύ HCV IgG και SARS- CoV-2 ειδικές IgG παρατηρήθηκαν μόνο για την απόκριση S2. Παραδόξως, υποστηρίζοντας αυτό το εύρημα, ο HCV S2 helper απαντήσειςήταν πρόσφατα βρέθηκαν προς την ώθηση SARS-CoV-2 ασυλία, ανοσία, σειδιαιτερος Δραστηριότητα αντισωμάτων S231. Για να διερευνήσετε εάν το SARS-CoV-2 IgG μπορείχτίζω επί πρόσφατος HCV IgA και IgM απαντήσεις εμείς Επόμενο ανιχνευμένοεάν τα HCV IgM και IgA συνδέονται με το eleαποτιμήθηκε SARS-CoV-2 specific IgGεπίπεδα.Αν και δεν ήταν εμφανές αποτέλεσμα για το IgM, εμείς παρατήρησε ένα σημάδιifiκλίση σχέση του υψηλός HCV IgA δραστηριότητα επίόλατέσσεριςμετρημένος SARS-CoV-2 απαντήσεις (Σύκο. 7c, d). Αυτό προτείνει έντοναότιπρόσφατος HCV μόλυνση έχειa benefiσιαλ επίδραση στην αύξηση της απόκρισης αντισωμάτων SARS-CoV-2ses.
Σε ο Επόμενο ανάλυση, εμείς ανιχνευμένο αν προ-υπάρχον HCV ασυλία, ανοσίαέχει ένα αντίκτυπο στη σοβαρότητα της νόσου στον COVID- 19. Για το σκοπό αυτό, εμείςανιχνευμένο HCoV ασυλία, ανοσία σε 80 νοσηλεύονται και μη νοσηλεύονταιτα άτομα μολυσμένος Για λιγότερο από 30 ημέρες (Εικ.8ένα). Έλεγχος για ηλικία και φύλο, διαπιστώσαμε ότι τα άτομα με γειαgh προ-υπάρχον Η αντιδραστικότητα του HCV ήταν σημαντικήμυρμηγκιάπιο χαμηλα DDSπρος τηναπαιτώνοσηλεία σε νοσοκομείο (υλικοτεχνική υποστήριξηοπισθοδρόμηση Ή = 0.16, 95 τοις εκατό CI (0.04, 0.67), Εικ.8β, Συμπληρωματικό Σχ. 15). Μια περαιτέρω στρώσηifiκατιόν τουpασθενείς με αν αυτοί απαιτείται θεραπευτική αγωγή στο ένα ΜΕΘ έδειξε a μείωσε την πιθανότητα ότι ο ασθενήςts με υψηλός HCoV απάντηση απαιτούμενες τιμές νοσηλεία σε νοσοκομείο με εντατικός Φροντίδα (τακτικός οπισθοδρόμησηΉ {{0}}.36, 95 τοις εκατό CI (0. 13, 0,96), Εικ.8β, ΣυμπληρωματικόFig. 15). Ετσι, τα άτομα με υψηλός HCoV επίπεδα είχε a 64 τοις εκατό μείωσε τις πιθανότητες της απαίτησης νοσηλείας σύμφωνα με ήδείπνο τάξη ανάλυση παλινδρόμησης συγκρίνοντας νοσηλευόμενος σε τακτικός θαλάμους, σε ΜΕΘ, καιμη νοσηλεύωd τα άτομα (Σύκο. 8a, b). Συλλογικά, αυτά τα Οι παρατηρήσεις υποδηλώνουν έντονα διασταυρούμενη προστατευτική δράσηof HCVανοσία στη διαμόρφωση της ανοσολογικής άμυνας κατά του SARS-CoV-2.



Σύκο. 7 Υπάρχοντα του προ-υπάρχον HCV ασυλία, ανοσία στη διάρκεια SARS-CoV-2 απόκτηση. a χρόνος-ταίριαξε σύγκριση του ABCORA 5.0 αντιδραστικότητα Για SARS-CoV-2και HCoVs σε υγιής και SARS-CoV-2 μολυσμένος τα άτομα. Υγιής δωρητές ήταν δειγματοληψία σε Ενδέχεται 2020 (N = 653; μπλε). Πλάσμα αίματος από SARS-CoV-2 μολυσμένο άτομοs ήταν συγκεντρωμένος μεταξύ Απρίλιος–Ιούνιος 2020 (N = 65; το κόκκινο). Βλέπω Συμπληρωματικός Σύκο. 14 Γιαέναανάλυση του ο γεμάτος SARS-CoV-2 θετικός σώμα στρατού(N = 389). Γκρί κουτιά υποδεικνύω αξίες πάνω από ο άτομο ΝΧΙ-ΕΧΘΡΟΣ Τομή-offs Για SARS-CoV-2 ειδικός απαντήσεις Για καθε αντιγόνο. αστέρια ανταποκρίνομαι σε επίπεδα του σημασία του δύο-πλευρικά t-δοκιμές συγκρίνοντας αρνητικός εναντίον θετικός ασθενείς. Επίπεδα του σημασία είναι διορθώθηκε με ο Bonferroni μέθοδος για πολλαπλές δοκιμές και υποδεικνύεται όπως και ακολουθεί: *p< 0.05/12, **p< 0.01/12, ***p< 0.001/12 (IgG HKU1: p = 0.66, IgG OC43: p = 0.45, IgG NL63: p=3.3 × 10−04, IgG 229E: p = 1.6 × 10−05, IgA HKU1: p=1.8 × 10−03, IgA OC43: p=1.3 × 10−05, IgA NL63: p=1.4 × 10−07, IgA 229E: p=3.0 × 10−05, IgM HKU1: σελ = 3.3 × 10−08, IgM OC43: p = 4.3 × 10−03, IgM NL63: p = 1.1 × 10−07, IgM 229E: p = 2.7 × 10−02). Κουτιά εκπροσωπώ ο ΕΠΟΜΕΝΟ: διάμεσος με το κέντρο γραμμή, ανώτερος και πιο χαμηλα τεταρτημόρια με ο κουτί όρια, 1.5x μεσοτεταρτημόριο σειρές με ο φαβορίτα, και ακραίες τιμές με σημεία. b Γραμμικός οπισθοδρόμηση μοντέλα που δείχνουν ο σχέση μεταξύ SARS-CoV-2 και HCV σήματα σε 204 SARS-CoV-2 θετικός ασθενείς με γνωστός ημερομηνίες του πρώτον θετικός RT-Ανίχνευση PCR. επιρροές στα πλαίσια ο ίδιο αντίσωμα τάξη είναι ερευνηθεί. ο μοντέλα ήταν προσαρμοσμένη επί ηλικία (spline με 3 βαθμούς του ελευθερία), γένος, καιρό από τότε θετικός RT-PCR (spline με 3 βαθμούς του ελευθερία), και επίπεδο του HCoV αντιδραστικότητα. Δείγματα είναι σχεδιασμένο προς την λιμάνι υψηλός HCV αντιδραστικότητα αν αυτοί εκπομπή ABCORA 5.0 HCVημερολόγιο MFI-ΕΧΘΡΟΣ αξίες πιο ψηλά από ο αντίστοιχος διάμεσος σε στο ελάχιστα 3 HCoV Μετρήσεις (HKU1, OC43, NL63, ή 229E). Οι καμπύλες αντιστοιχούν προς την ο του μοντέλου εκτίμηση και σκιασμένος περιοχές προς την ο95 τοις εκατόαυτοπεποίθηση διαστήματα. p-αξίες ήταν λαμβάνεται με τρέξιμο a δύο-πλευρικά Μαθητης σχολειου t-δοκιμή στο παράμετρος που σχετίζονται με HCV αντιδραστικότητα σε ο γραμμικός οπισθοδρόμηση. c Γραμμικός οπισθοδρόμηση μοντέλο επίδειξη ο σχέση μεταξύ SARS-CoV-2 IgG και HCV IgA σήματα. Καμπύλες ανταποκρίνομαι προς την ο του μοντέλου εκτίμηση και σκιασμένος περιοχές προς την ο95 τοις εκατόαυτοπεποίθηση διαστήματα. p-αξίες ήταν λαμβάνεται με τρέξιμο ένα δύο-πλευρικά Μαθητης σχολειου t-δοκιμή επί ο παράμετρος που σχετίζονται με HCV αντιδραστικότητα σε ο γραμμικός οπισθοδρόμηση. d Γραμμικός οπισθοδρόμηση μοντέλο επίδειξη ο σχέσημεταξύ των σημάτων SARS-CoV-2 IgG και HCV IgM. Οι καμπύλες αντιστοιχούν στην εκτίμηση του μοντέλου και οι σκιασμένες περιοχές στα διαστήματα εμπιστοσύνης 95 τοις εκατό. p-τιμήήταν λαμβάνεται με τρέξιμο a δύο-πλευρικά Μαθητης σχολειου t-δοκιμή επί ο παράμετρος που σχετίζονται με HCV αντιδραστικότητα σε ο γραμμικός οπισθοδρόμηση.
Συζητώιόν
Defiμίσθωση του SARS-CoV-2 ασυλία, ανοσία μετά τον εμβολιασμό καιη μόλυνση είναι άμεσης σημασίας44–46. Αποκρυπτογράφηση αντισώμασυσχετίζεταιτου SARS-CoV-2 ΠΡΟΣΤΑΣΙΑκαιπαρακολούθηση εμβόλιο η ανταπόκριση είναι δύσκολες εργασίες μπροστά. Το μέγεθος ακαι μακροζωία του προστατευτικός αντίσωμα απαντήσεις προς την φυσικός μόλυνση και διαφορετικός εμβόλια χρειάζομαι προς την είναι εξετάστηκε προς την καταλαβαίνουνΠαράμετροι ότι σχήμα προστατευτικός απαντήσεις και καθοδηγούν τις αποφάσεις σχετικά με τον επανεμβολιασμό σε άτομα που δεν ανταποκρίνονται και την ανοσοποίησηnαγμυθιστόρημα που προκύπτουν SARS-παραλλαγές CoV-247. Ομοίως, η δημιουργία σημαίνει να ορολογικά διάκριση μεταξύ de novo μόλυνσης, reμόλυνση,και εμβόλιο απαντήσεις, δικα τους αντοχή και αποτυχίες θα παραμένειcrάτυπη Για κλινικός διάγνωση.
Εδώ εμείς επιδεικνύω ο υψηλός χρησιμότητα του πολυ-παράμετρος ser- ωφελώντας την αντιμετώπιση βασικών θεμάτων στο δefining SARS-CoV-2 ασυλία, ανοσία. Ταυτόχρονοςανίχνευσητου αποκρίσεις αντισωμάτων σε α εύροςτου SARS-CoV-2 αντιγόνακαιδιαφορετικός Igτάξειςμε ABCORA seroprofiεδώδιμος ιχθύς του βορράπαρείχε μια ολοκληρωμένη εικόνα του ορολογική κατάσταση SARS-CoV-2 σε μία μόνο εξέταση, η οποία περίπουn είναι χρήσιμο για την κλινική διάγνωση για τον προσδιορισμό της παρουσίαςof επαναμόλυνση, defineεπαναμόλυνση, καιαπαντώπρος τηνεμβολιασμός. Υπολογιστικήπρίπλασμαεπίσηςεπιτρέπεταιπροβλέποντας πλάσμα neu-πραγματοποίηση χωρητικότητα από ABCORA Αποτελέσματα, που επιτρέπει aπεριεκτικός εκτίμηση του SARS-CoV-2 αντίσωμα δυναμική και τα δικά τους αλληλεπίδραση μεHCV απαντήσεις. Εμείς μελετημένος δύο ABCORA χημική δοκιμήεκδόσεις ουστο και τα δυο μετρημένος HCV αντιδραστικότητα παραλληλα ο 12 SARS-CoV-2 Παράμετροι.Το ANCORA 2 περιελάμβανε το αντιγόνο S1 τουHKU1. ΑΓΚΥΡΑ 5 περιλαμβάνεται S1 του όλα τέσσερις κυκλοφορούν HCV.Ιδιαίτερα, υπολογιστική μοντέλα ότι περιλαμβάνεται ο HCVΜετρήσεις επιτρέπεται a πιο ψηλά ακρίβεια σε καθοριστικό SARS-CoV- 2 οροθετικότητα, υψηλήφωτισμός αλληλεξαρτήσεις μεταξύ HCoVκαι SARS-Αποκρίσεις CoV-2 που πρέπει να επιλυθούν.
Εγγραφή αντιδραστικότητα κατά όλα τέσσερις HCoVs σε SARS-CoV-2μη μολυσμένα καιμολυσμένοςτα άτομαεμείςπαρατηρήθηκεενδιαφέρουσαενώσεις. Uμολυσμένατα άτομαεκτεθειμένοςπιο ψηλά HCVαντιδραστικότητα σε σύγκριση με μολυσμένα άτομα που υποδηλώνουνaσυνεισφορά του HCV ασυλία, ανοσία προς την νωρίς άμυνα κατά SARS-CoV- 2. Η ανοσία του HCV μπορεί επίσης να έχει θετικές επιπτώσεις στον SARS-CoV-2μόλυνση. Σε συμφωνία με άλλα Αναφορές, εμείς διάσημος aδιασταυρούμενη σίτιση του SARS-CoV-2 και αποκρίσεις HCV σε λοίμωξη SARS-CoV-231,48 με τα άτομα με υψηλός HCV αντιδραστικότητα ανάπτυξη-ανοίγοντας πιο ψηλά SARS-CoV-2 αντίσωμα επίπεδα. Πλέον ιδιαίτερα, προϋπάρχον HCV ασυλία, ανοσία είχε ένα επίπτωση επί νόσος αυστηρότητα στο δικό μας σώμα στρατού. SARS-CoV-2 μολυσμένος τα άτομα με χαμηλός Αντιδραστικότητα HCV είχε a πιο ψηλά πιθανότητα του απαιτώντας νοσηλεία σε νοσοκομείο.
Ενώμαςμελέτημόνο μετρημένες αποκρίσεις αντισωμάτων, αδυνητικόςπροστατευτικόςαποτέλεσματου HCoVανοσία κατά του SARS-CoV-2 απόκτηση πρέπει δεν είναι προβλήθηκεόπως καιπεριορισμένος προς την δραστηριότητα αντισωμάτων. Αντισώματα και η κυτταρική ανοσία μπορεί να είναι και τα δύο σχετικάκαι ενεργά σε συναυλίες31,49–51. Εναλλακτικά, απόκριση αντισωμάτωνsesmεξασφάλισε σε ο παρόν μελέτη ενδέχεται μόνο έγγραφο πρόσφατος HCV μόλυνσηn και παραδίδω a αναπληρωτής μέτρηση του άλλα προστατευτικόςHCV απαντήσεις. ο Σύνδεσμος μεταξύ πιο ψηλά HCV και SARS-CoV-2 αντιδραστικότητα σε μολυσμένα άτομα είναι ιδιαίτερα ενδιαφέρουσα. Ο πιο δυνατός υπάρχοντα ήταν δει Για IgM και IgA HCoV απαντήσεις, sugκύηση ότι πρόσφατος HCV ασυλία, ανοσία παρέχει ένα νωρίς ώθηση προς την Ανάπτυξη αντισωμάτων SARS-CoV-2ent. ΑνΑυτόείναιλόγωπρος την διασταυρούμενες αντιδράσεις Β κυττάρων στις οποίεςο SARS-CoV-2ασυλία, ανοσία κατασκευάζει επί και ωριμάζει ή αν σταυρός-αντιδραστικός T βοηθόςδραστηριότητεςπαίζωκυρίαρχο ρόλο όπως προτείνεται31 θα είναι σπουδαίος προς την αποφασίζω σε Εμπρός-ερχομός σπουδές. ο ακριβής ρόλος και timing του HCoVαπαντήσειςεπηρεάζοντας SARS-CoV-2 αντίσωμααπαντήσεις επίσης παραμένει προς την είναι defined. Νωρίς χαμηλός-αφfinity Αποκρίσεις HCoV ενδέχεται έχω a θετικός επίπτωση επί ο ανάπτυξη του SARS-CoV-2 ανοσία σχηματίζοντας μια ανοσολογική μνήμη στην οποία προς την χτίζω, ενώ αμπλίfiκατιόν του μη-προστατευτικόςδιασταυρούμενης αντίδρασηςHCV anτισώματα σύμφωνα με προς την ο αντιγονικό αμαρτία αρχή ενδέχεται έχω αρνητικές επιπτώσεις30.
Παρόλοσχέσημελέτες όπως η δική μας δεν μπορούν επίσημα define αιτιότητα, ο επιπτώσεις του μας τα ευρήματα είναι προφανή: Προηγούμεναασυλία, ανοσία προς την HCV ενδέχεται προστατεύω προς την μερικοί έκταση κατά SARS-CoV-2 απόκτηση, καιενδέχεται προμηθεύω a ώθηση προς την ο ανάπτυξη του SARS-CoV-2 specific ασυλία, ανοσία και με Αυτό πιο χαμηλα ο κίνδυνος Γιααυστηρόςνοσηλεία σε νοσοκομείο. A μετριόφρωνπροστατευτική δράση του HCoVασυλία, ανοσία θα είναι a εύλογος εξήγηση Για ο υψηλόςποσοστότου ασύμπντοματικός και ήπιος SARS-CoV-2 λοιμώξεις52,53. Ακόμη και περισσότερο ενδιαφέρουσες είναι οι μελλοντικές προοπτικές. Όπως οι άλλοι και εμείςέχω απεικονίζεται, SARS-CoV-2 και HCV ασυλία, ανοσία προς την μόλυνση είναισυχνά δεν μακρύς-διαρκής (Σύκο. 5, Συμπληρωματικός Σύκο. 11)5,54, περιορισμόςότι SARS-CoV-2 εμβόλιαΕλπίζωπρος τηνκαταβάλλω. Πρέπει SARS-CoV-2 απαντήσειςσεστροφήπρομηθεύωένα βαθμό άμυνας κατά του HCV μόλυνση, ευρύς ΠΡΟΣΤΑΣΙΑ κατά κορωνοϊοί μπορεί να είναι στο rκαθε.


Σύκο. 8 Επίπτωση του HCoV ασυλία, ανοσία επί COVID-19 αυστηρότητα. a Σχέση του νοσηλεία σε νοσοκομείο κατάσταση (δεν νοσηλευόμενος (N = 16); νοσηλευόμενος δεν σε ΜΕΘ(N = 42); νοσηλευόμενος σε ΜΕΘ (N = 22)) και υψηλός ή χαμηλός IgG HCoV αντιδραστικότητα. Ορθογώνιο παραλληλόγραμμο μεγέθη ανταποκρίνομαι προς την ο ποσοστό του περιλαμβάνεται ασθενείς. b Επιρροή του HCoV αντιδραστικότητα (χαμηλός/υψηλός) επί ο νοσηλεία σε νοσοκομείο κατάσταση σε a υποσύνολο του N = 80 ασθενείς, όπως και εκτιμάται με πιθανότητα αναλογίες, σε ένα τακτικός οπισθοδρόμηση (με επίπεδα = δεν νοσηλευόμενος (N = 16); νοσηλευόμενος δεν σε ΜΕΘ (N = 42); νοσηλευόμενος σε ΜΕΘ (N = 22)) και a υλικοτεχνική υποστήριξη οπισθοδρόμηση (αναφορά = δεν νοσηλευόμενος(N = 16); εναντίον όλα νοσηλευόμενος (N = 64)). Δεδομένα είναι παρουσιάζεται όπως και παράμετρος εκτίμηση και του95 τοις εκατόαυτοπεποίθηση διάστημα. Επίπεδο του σημασία του την παράμετρο είναι λαμβάνεται με a δύο-πλευρικά t-δοκιμή (p-αξία είναι εκτεθειμένος αν <>σε διαφορετική περίπτωση υποδεικνύεται όπως και n.s.).
Μουthods
Ο άνθρωπος δείγμα. Ορρός και συλλέχθηκαν δείγματα πλάσματος πριν και μετά την εμφάνιση του
SARS-CoV-2 σεΕλβετία (προ καιμετά τον Φεβρουάριο 2020, αντίστοιχα) ήτανπεριλαμβάνεται. Οχι υπομονετικος εγγραφή ήταν διεξαχθεί Για ο παρόν μελέτη. Ολαπειράματα που εμπλέκουν δείγματα από ο άνθρωπος δωρητές ήταν διεξαχθεί με την έγκριση του τις απαντήσειςικανός τοπικός ηθική επιτροπή (Kantonale Ethikkommission) Ζυρίχη,
Ελβετία (BASEC Αρ 2020-01327, 2020-00363; 2021-00437; 2020-00787), από ο προμήθειες του ο Δήλωση του Χέλσινκι και ο Καλή κλινική Πρακτική Κατευθυντήριες γραμμές του η Διεθνής Διάσκεψη για την Εναρμόνιση. Δείγματα ήταν λαμβάνεται από οι ακόλουθες πηγές: (i) Αιμοδοσία Ζυρίχηςυπηρεσίαes (ZHBDS): Ανώνυμη υγιής ενήλικας πλάσμα αίματος από προ-πανδημία χρόνοςσημεία (Ιανουάριος 2019, Ενδέχεται 2019,και τον Ιανουάριο του 2020) και από το πρώτο κύμα του πανδημία στη Ζυρίχη, Ελβετία (Ενδέχεται 2020) ήταν υπό την προϋπόθεση με ο ZHBDS εσωτερικός αποθετήριο ορού και μειονεκτήματαent Για Αυτό μελέτη ήταν παραιτήθηκε με ο ηθική επιτροπή(BASEC 2021-00437). (ii) Ανώνυμη υπολείμματα δειγμάτων από τα συνήθη διαγνωστικά στο ο Ινστιτούτο του Ιατρικός Ιολογία, Πανεπιστήμιο του Ζυρίχη, ο Πανεπιστημιακά παιδιά Νοσοκομείο Ζυρίχη, και ο Καντονική Νοσοκομείο Winterthur (BASEC Αρ2020-01327, 2021-00437). Ελήφθη γραπτή ενημερωμένη συγκατάθεση από όλους τους συμμετέχοντεςτου οποίου το δείγμα was λαμβάνονται στη διάρκεια ο πανδημία στο ο Πανεπιστήμιο ΝοσοκομείοΖυρίχη (BASEC 2020-01327). Για πανδημικά δείγματα από άλλα νοσοκομείαd προπανδημία δείγματα συγκατάθεση ήταν παραιτήθηκε με ο ηθική επιτροπή. (iii) Υγειονομική περίθαλψηεργαζόμενοι με RT-PCR επιβεβαιωμένη μόλυνση από SARS-CoV-2ιόν συμμετέχοντας σε a μελέτη στο Πανεπιστήμιο Νοσοκομείο Ζυρίχη (BASEC 2020-00363). Γραπτός προειδοποίητος συναίνεση ήταν λαμβάνεται από όλα συμμετέχοντες. (iv) Αρσενικός πλάσμα αίματος δωρητές συμμετέχοντας σε ένα SARS-CoV-2 πλάσμα αίματος θεραπεία μελέτη που πραγματοποιήθηκε στο Πανεπιστημιακό Νοσοκομείο της Ζυρίχης(CPT-ZHP, Ελβετολόγος 2020TpP1004; ΒΑΣΙΚΟΣ 2020-00787). Γραπτή ενημέρωσηΗ συγκατάθεση για την έρευνα ελήφθη από όλους τους συμμετέχοντες. Ταυτός αναφοράς του όλα ο άνθρωπος και Πάτιnt δεδομένασυμμορφώνεται μεοΣΤΡΟΜΠ δήλωση. Προ-πανδημία (SARS- CoV-2 αρνητικόve, N = 825) και ενάντιοςfirmed SARS-CoV-2 θετικός δείγματα (N = 389)ήταν διαιρεμένος σε εκπαίδευση και επικύρωση κοόρτες (Συμπληρωματικός Τραπέζι 3). Διαθέσιμα δημογραφικά στοιχεία daτα επί γένος, ηλικία, χρόνος Από θετικός RT-PCR καιsσύμπτωμα επίθεση, και νοσηλεία σε νοσοκομείο κατάσταση είναι έχουν αναφερθεί σε Συμπληρωματικός Τραπέζι 11.ο SARS-CoV-2 εκπαίδευση σώμα στρατού (N = 175) περιελάμβανε το πλάσμα που συλλέχθηκε κατά τη διάρκειαλοίμωξη (N=114) και ανάρρωση (N=61). Ανά δonor μόνο ένας δειγματοληψία χρόνοςσημείο συμπεριλήφθηκε, λονέμφραγμα δείγματα του δωρητές περιλαμβάνεται σε ο εκπαίδευση κοόρτη ήταν δεν περιλαμβάνεται σε ο επικύρωση κοόρτη για να εξακριβωθεί η ανεξαρτησία όταναξιολογώντας ο ευαισθησία και την ιδιαιτερότητα των διαφορετικών διαγνωστικών μεθόδων. ο SARS-CoV-2 επικύρωση σώμα στρατού (N = 214), αποτελούνται πλάσμα αίματος συγκεντρωμένος κατά τη διάρκεια της μόλυνσης (N = 90, ένα χρονικό σημείο δειγματοληψίας ανά δότη) και ανάρρωση
(N = 124, 79 ανάρρωση ασθενείς με 1–4 διαμήκη δείγματα). Πολλαπλός χρόνοςσημεία του αναρρωνύων ασθενείς ήταν περιλαμβάνεται σε ο σύνολο δεδομένων επικύρωσης για την αποτύπωση α ευρύ φάσμα waning αντίσωμα τίτλους. Μια διατομή ανάλυση ήταν με βάση επίδείγματα με γνωστός χρόνος Από θετικός RT-PCR (N = 369) ή γνωστός χρόνος από το σύμπτωμα επίθεση (N = 333), και οι δύο, συμπεριλαμβανομένων των παρατηρήσεων της διαχρονικής ανάλυσης.Και τα δύο, χρόνος από τη θετική RT-PCR και χρόνοςΑπό επίθεση ήταν γνωστός Για330 δείγματα, με διάμεσο χρόνο τρεις daναι μεταξύ σύμπτωμα επίθεση και RT-PCR(1αγ–3rdτεταρτημόριο: 1–7 ημέρες). Βασίστηκε η διαμήκης ανάλυση της αντιδραστικότητας αντισωμάτων σε 251 παρατηρήσεις από 120 ανάρρωσησεντ ασθενείς με γνωστός χρόνος Από θετικός RT-PCR και χρόνος από την έναρξη των συμπτωμάτων. Εξουδετέρωση was μετρημένος επί 467 SARS-CoV-2 RT-PCRθετικός δείγματα (N = 369 με γνωστός χρόνος Από θετικό RT-PCR, N = 333 με γνωστός χρόνος Από σύμπτωμα επίθεση).
Αξιολογήσαμε περαιτέρω τη διασταυρούμενη αντιδραστικότητα ABCORA 2.0 και 5.0 στα αριστερά.t-πάνω από πλάσμα αίματοςαπό διαγνωστικά ρουτίνας σε μια ομάδα ελέγχου προπανδημίας wιθ τεκμηριωμένη, πρόσφατο HCV μόλυνση (Εκπαίδευση II, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E (N = 9)). Κυκλοφορεί HCV είναι συνήθως μόνο προβλήθηκε Για σενοσηλευόμενοι, σοβαρές λοιμώξεις του αναπνευστικού και ανοσοκατεσταλμένοι τα άτομαπου υποβάλλονται συνήθως σε έναν αδερφόΕνα δ διαλογής Για αναπνευστικός λοιμώξεις. Ως εκ τούτου, σε αυτός ο ασθενής ομάδα, και τα δυο μειωμένος αντίσωμα αντιδραστικότητα λόγω προς την απρόσβλητος συμβιβαστική ήαυξημένο HCV αντο σώμα αντιδραστικότητα λόγω προς την πρόσφατος ή επαναλαμβανόμενες HCV μόλυνση ενδέχεταισυμβούν. Όπως αυτή η ομάδα είναι διάγνωσηστατικά σχετικό εμείς λαμβάνονται υπόψη το συνετός προς την συμπεριλάβετε αυτό σώμα στρατού όπως και Εκπαίδευση II δεδομένα σειρά προς την επαληθεύω αν σταυρός-αντιδραστικότητα με SARS-CoV-2 σεABCORA λαμβάνει χώρα σε αυτή τη ρύθμιση. Τα δεδομένα Training II δεν συμπεριλήφθηκαν στο όριο defiμίσθωση προς την δεν πάνω από-εκπροσωπώ τα άτομα με σοβαρή ασθένεια. Αυτό έχει μολυνθεί με HCVομάδα εκτεθειμένος Συνολικά πιο χαμηλα αντιδραστικότητα με SARS-CoV-2 από το πλάσμα απόυγιής ενήλικες αλλά σημαντικά έδειξε όχι ένδειξη του διασταυρούμενη αντιδραστικότητα (Εικ.1a, b). Πανδημικό δείγμαles από Ανώνυμος αίμα δωρητές με άγνωστος SARS-CoV-2κατάσταση συγκεντρωμένος σε Ενδέχεται 2020 (N = 672) ήταν δεν περιλαμβάνεται σε εκπαίδευση και επικύρωση κοόρτες.
Αντιδραστήρια και κυτταρικές σειρές. His-tγερασμένος SARS-CoV-2-συμπληρωματικός αντιγόνα (αισθητήριο νεύρο
τομέας δέσμευσης (RBD), υπομονάδα S1 (S1), υπομονάδα S2 (S2), nuclηοκαψίδιο πρωτεΐνη (N)) και S1 του tαυτός τέσσερις κυκλοφορούν HCoVs (HKU1, OC43, NL63, 229E) ήταν αγοράστηκε από την Sino Biological Europe GmbH, Έσμπορν, Γερμανία (ΣυμπληρωματικόςΤραπέζι 12). Πηγές, προδιαγραφές και συγκέντρωση αντισωμάτων ανίχνευσης και ελέγχου και οροί που χρησιμοποιούνται για ABCORA και δοκιμές εξουδετέρωσηςts είναι παρατίθενται σε Συμπληρωματικός πίνακας 13. 293-Τα κύτταρα ελήφθησαν από την American Type Culture Collection(ATCC CRL- 11268)55. HT1080/ΑΣΣΟΣ2cl. 14 κύτταρα33 ήταν ευγενώς παρέχεται από τον Π.Bieniasz, Ροκφέλερ Πανεπιστήμιο, NY. Και τα δυο κύτταρο γραμμές ήταν καλλιεργημένος σε DMEMπεριέχειng10 τοις εκατόFCS.
Σχέδιο του πολλαπλός χάντρα χημική δοκιμή ABCORA 2.0. Εμείς καθιερωμένος δύο χάντρα-με βάσηπολυπλεξία SARS-CoV-2 ανοσοδοκιμασίες (ABCORA 2.0 και ABCORA 5.0) ότιπεριελάμβανε μια σειρά από SARS-CoV-2 και HCoV αντιγόνα (Σίνο Βιολογικός ΕυρώπηGmbH, Eschborn, Γερμανία, Συμπληρωματικός Πίνακας 12). Τέσσερα αντιγόνα SARS-CoV-2ns- RBD, S1, S2, και N - ήταν περιλαμβάνεται σε και τα δυο ABCORA 2.0 και ABCORA 5.0.ΑΓΚΥΡΑ 2.0 περιλαμβάνεται σε πρόσθεση S1 του HCV-HKU1, καιABCORA 5.0 περιλαμβάνεται S1του όλα κυκλοφορούν HCoVs (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43). Σε σύντομος, άτομο MagPlex περιδέραιο (Luminex Εταιρεία, Όστιν, TX) με uniqουε φθορίζων χάντρα περιφέρειες ήταν εκλεκτός Για καθε αντιγόνο, περιδέραιο ήτανσυζευγμένα και μίγματα σφαιριδίων συζευγμένων με αντιγόνοsήτανεπωάζονται με υπομονετικος πλάσμα αίματος σε a 96-Καλά πλάκα σειρά-πάνω. οΔιάμεσος Φθορίζων Ενταση (ΝΧΙ) του πλάσμα δεσμευμένο με χάντρεςαντιβωδίες ήταν μετρημένος αξιοποιώντας a FlexMap 3D αναγνώστης (Luminex Εταιρεία,Όστιν, TX). Εμείς σχεδιασμένο ο χημική δοκιμή προς την fulfill ο ΕΠΟΜΕΝΟ κριτήρια: (i) υψηλός Ταχύτητα-cifiπόλη, ευαισθησία, και αναπαραγωγιμότητα, (ii) εύκαμπτος πολλαπλός σχέδιο ότι επιτρέπει την ευθεία πρόσθεση και/ή μεταβολή του αντιγόνα; (iii) πλατύς δυναμικός εύρος; (iv) προαιρετικός ποσοτικάfiκατιόν του αντίσωμα απαντήσεις; (v) προαιρετικός εγγραφή τουαντίσωμααποκρίσεις σε HCoV και (vi) χρήση στο routine διαγνωστικά και έρευνα.
Επιλέξαμε ένα στερικό προσανατολισμός πιάνω μέσω αντι-Του αντισώματα προς την εξασφαλίζω a εμφάνιση ομογενούς αντιγόνου. Επομένως, το καρβοξυλιωμένο ΜagPlex περιδέραιο (Luminex
Εταιρεία, Όστιν, TX) ήταν συζευγμένο με αντι-Του αντίσωμα (Σίνο Βιολογικός
Ευρώπη GmbH, Έσμπορν,Γερμανία, Συμπληρωματικός Πίνακας 13) και στη συνέχεια συζευγμένη με το His-taggedαντιγόνα χρησιμοποιώντας Bio-Plex Αμίνη σύζευξη (Bio-Rad ΕργαστήριαAG, Cressier, Switzerland) σύμφωνα με το iοδηγίες και όπως καιπεριγράφεται56.
Η τιτλοδότηση ορού/πλάσματος θεωρείται γενικά το πιο ακριβές strategy προς τηνretriπαραμονή ποσοτικός πληροφορίες επί αντίσωμα αντιδραστικότητα. Ωστόσο, σε διαγνωστικός χρήσηδοκιμές ιδανικά πρέπει παραδίδω (ημι)-ποσοτικός πληροφορίες από a ενιαίος ορόςδιάλυση προς την άδεια επαρκή απόδοση. Οι τελικές συνθήκες της ανάλυσης κάλυψαν α 2-log εύρος MFI σε όλους τους ανιχνευμένους συνδυασμούς αντιγόνου-Ig (Συμπληρωματικό Σχήμα 1).Επικύρωση ο εγκυρότητα του χρησιμοποιώντας a μονόκλινο πλάσμα αίματος διάλυση, εμείς ενάντιοςfirmed ότι πλάσμα αίματοςαπό SARS-CoV-2 θετικός ασθενείς και προ-πανδημία SARS-CoV-2αρνητικόςδείγματα πλάσματος δείχνουν βέλτιστη δόση-απόκριση καμπύλες πάνω από a πλατύς πλάσμα αίματος διάλυσηεύρος (Συμπληρωματικός Σύκο. 1f). Σημαντικό, a 1/100 διάλυση του πλάσμα αίματος ήταν σε όλαπεριπτώσεις Κλείσε στο μέγιστο σήμα, υπογραμμίζοντας ότι το αυξανόμενο πλάσμαη συγκέντρωση δεν θα αύξανε την ένταση του σήματος, αλλά θα διακινδύνευεεεε μειώνεταισινεφροί λόγω προς την προζώνη υπάρχοντα (Συμπληρωματικός Σύκο. 1f).
Μέγιστη αντι-Του αντίσωμα φόρτωση ήταν επιτεύχθηκε στο 5 µg αντίσωμα ανά εκατομμύριοχάντρες (Συμπλεισόδου Σύκο. 1c) και μεταχειρισμένος όπως και a πρότυπο σύζευξη κατάσταση. Σε ο finalπρωτόκολλο,Επωάστηκαν με πέντε εκατομμύρια μαγνητικά σφαιρίδια συζευγμένα με αντίσωμα anti-His Του-με ετικέτα αντιγόνα αραιωμένο σε PBS σε συγκέντρωση 320 ηΜ.Δευτερεύοντα αντισώματα επισημασμένα με φυκοερυθρίνη (PE) ειδικά για IgG, IgA, ή IgM ήτανχρησιμοποιείται ως αντισώματα ανίχνευσης (ΣυμπληρωματικόΤραπέζι 13). Ποιότητα έλεγχος του οαντιγόνο loading ήταν εκτελούνται με επώαση ο περιδέραιο με μονοκλωνικήαντισώματα που στοχεύουν τον αντίστοιχο CoV-dπροήλθε αντιγόνο όπως και λεπτομερής σεΣυμπληρωματικός Πίνακας 12. Η ανάλυση διεξήχθη εξυπνάδαh ο FlexMap 3D αναγνώστης(Luminex Corporation, Όστιν, TX) με ο απόκτηση του στο ελάχιστα 50 περιδέραιο ανάπεριοχή σφαιριδίων. Αποτελέσματα ασχετικά με έχει καταγραφεί όπως και ΝΧΙ ανά χάντρα περιοχή.
Επιβλήθηκαν διάφορα μέτρα ελέγχουσυμμαχημένος προς την διαπιστώνωμεταξύ και ενδο-χημική δοκιμήεκτέλεση. Για να διαπιστωθεί χαμηλή ανάλυση προςχημική δοκιμή μεταβλητότητα, μεγάλο παρτίδες τουμεμονωμένο αντιγόνο φορτωμένο βάδειες ήταν έτοιμος και παγωμένος σε κλάσματα μέχρι μεταχειρισμένος στο-20 βαθμόςC προς την καταστρατηγώοφθορά του ο αντιγόνο-συζευγμένο χάντρες (Συμπληρωματικό Σχ. 1). Μεμονωμένα συζευγμένα σφαιρίδια αναμίχθηκαν την ημέρα της δοκιμής σε yield ο απαιτείται αντιγόνοκοκτέιλ με χάντρες. Τα κοκτέιλ περιείχαν 60 χάντρες σελεεε χάντρα περιοχή ανά µl. Σε πρόσθεση προς τηνοι περιοχές SARS-CoV-2 και HCV σφαιρίδια, κάθε κοκτέιλ περιλάμβανε ένα κενόy περιοχή σφαιριδίων (όχι αντιγόνο συζευγμένο) προς την έλεγχος Για unspecific δεσμευτικός. Ποιότητα έλεγχο και επικύρωση διαδικασίες Για ο FlexMap 3D όργανο ήταν Ολοκληρώθηκε επί καθε ημέρα αποπείραμα λογπαραγγελία προς τηνοκατασκευαστής's οδηγίες. ο μεταβλητότητα του ο χημική δοκιμήήταν αναλύονται όπως και ακολουθεί56: πλάσμα αίματος δείγματα από 20 RT-PCR ενάντιοςfirmed SARS-CoV- 2 μολυσμένοι ασθενείς συγκεντρώθηκαν και εξετάστηκαν over a εύρος του επτά αραιώσεις σε 31 διαφορετικά τεπαναλήψεις εκτελούνται επί 10 διαφορετικός ημέρες (Συμπληρωματικός Σύκο. 2). Απέναντιόλα αντιγόνα και Ig τάξεις, σήματα ήταν έκτακτος πάνω από ο δοκιμή περίοδος του 25ημέρες μετά σύζευξη σφαιριδίων. Συντελεστές διακύμανσης (CV) του σήματος δέσμευσης κατά μήκος tεπαναλήψειςτου συνδυασμού 12 αντιγόνου-Ig κατηγορίαςέθνη αποδείχθηκαν χαμηλός (εύρος: 0.010–0. 128, διάμεσος 0.059, Συμπληρωματικό Σχ. 3γ, δ, Συμπληρωματικοί Πίνακες 1, 2). Αυθημερόν και καθημερινόμεταβλητότητα pπεριπλανήθηκε χαμηλός και συγκρίσιμος (Συμπληρωματικός Σύκο. 3e, f). Παρακάτω a 1/ 100 πλάσμα αίματος συγκέντρωση, βιογραφικό αυξήθηκε εμφανώς (Συμπληρωματικός Εικ. 3δ), ορίζοντας το 1/100 ως την υψηλότερη συγκέντρωσηεπί (χαμηλότερο πλάσμα αίματος διάλυση) προς την είναι δοκιμασμένο σε ο χημική δοκιμή. Μια αραίωση πλάσματος 1/100 ορίστηκε έτσι ως η βασικήδιάλυση Για διαλογής πλάσμα αίματος σε ABCORA 2.0 πότε a ποιοτική (δηλαδή, παρουσία ή απουσία SARS-CoV- 2ειδικά αντισώματα) ή ημιποσοτική (δηλαδή, ένταση σήματος MFI) είναιrαπαιτούνται.
Όλες οι μετρήσεις της ABCORA ήταν deκαρφωμένος από μονόκλινο Μετρήσεις εκτόςδηλώνεται διαφορετικά. Για τη μέτρηση του SARS-CoV-2c αντισώματα σε υπομονετικος πλάσμα αίματος,αδρανοποιημένο από τη θερμότητα πλάσμα αίματος (1 h στο56 μοίρεςC) ήταν αραιωμένο 1/100 σε PBS-BSA1 τοις εκατόεκτόςδηλώνεται διαφορετικά. 50 μl αραιωμένοεκδ πλάσμα αίματος ήταν επωάζονται με 50 µl του ο ABCORAαντιγόνο χάντρα κοκτέιλ Για 30 λεπτά στο δωμάτιο θερμοκρασία σε 96-καλά πιάτα, πλυμένα τρεις φορές με PBS-BSA 1 τοις εκατό, και επωάστηκαν σε ξεχωριστές αντιδράσεις wiη φυκοερυθρίνη (Π.Ε)-με την ένδειξη ανιχνευτής αντισώματα Για IgG, IgA ή IgM στο a fiεθνική συγκέντρωση του 1/500 σε PBS-BSA 1 τοις εκατό . Αυτή η αραίωση ορίστηκε προηγουμένως απότιτλοδότηση των αντισωμάτων του ανιχνευτή για την απόδοση βέλτιστων σημάτων MFI. Μετά από 45 μinutes τουεπώαση σε θερμοκρασία δωματίου, τα σφαιρίδια πλύθηκαν τρεις φορές με PBS-BSA1 τοις εκατόκαι αναλύονται σε 96-Καλά πιάτα στον αναγνώστη FlexMap 3D (Luminex Corporation, Austin, TX). A ελάχιστο του 50 χάντρα διαβάζει ανά αντιγόνο ήταν επίκτητος.
Για έλεγχο για γνήσιο διασταυρούμενο αντίσωμαες, καθε πλάσμα αίματος δείγμα ήταναξιολογείται με beads χωρίς αντιγόνο (αδειάζω χάντρα έλεγχος) σε συνδυασμός οι οποίεςκάθε ανιχνευτής ααντισώμα. Για ανάλυση, ακατέργαστος ΝΧΙ αξίες ήταν μεταμορφώθηκε προς την ΝΧΙ-ΕΧΘΡΟΣ προς την σωστός Για Ιστορικό δεσμευτικός.Καθορίσαμε τη μέση κενή χάντρα MFI-FOE για IgG, IgA και IgM υγιών δοτών πριν από την πανδημία (N=1016) και set το νόημα ΝΧΙ-ΕΧΘΡΟΣσυν4x τυπική απόκλιση ως κατώφλι για τον έλεγχο κενού σφαιριδίου.Σε απόλυτος επίπεδα, αυτά τα κατώτατα όρια ανήλθε προς την ΝΧΙ-FOE 41,58 (IgG), 55,91 (IgA), και 269,47 (IgM).Mδιευκολύνσεις Για οι οποίες ο αδειάζω χάντρα έλεγχος έχει καταγραφεί αξίες above Αυτό κατώφλι ήταν λαμβάνονται υπόψη Μη έγκυρο και αλλεπάλληλος.
Κάθε πλάκα φρέατος ανάλυσης Luminex 96-ρυθμίστηκε σε contaσε ο ίδιο σειρά τουέλεγχος δείγματα, και συγκεκριμένα 7 κατα συρροη 4-πτυχή αραιώσεις ενός θετικού μάρτυρα SARS-CoV-2δότης πισίνα (N = 20 δωρητές, εκκίνηση διάλυση 1/100, Συμπληρωματικός Σύκο. 1f) και μια προ-πανδημία υγιής δότης πισίνα (διάλυση 1/100, N =20 δωρητές, ΣυμπληρωματικόΕικ. 1στ). Αυτοί οι θετικοί και αρνητικοί έλεγχοι επιτρέπουν τον έλεγχο της απόδοσης της ανάλυσηςnceσε ανεξάρτητες μετρήσεις και επιπλέον ενεργοποιήστεαναδρομικόςτυποποίηση έναντι εξωτερικών ελέγχων εάν χρειάζεταιded.
Ορισμός του SARS-CoV-2 οροθετικότητα σε ABCORA 2.0 και ABCORA 5.0. Προς τηνδιάκριση του SARS-CoV-2-ειδικού από τα διασταυρούμενα αντιδρώντα αντισώματα,efined ΝΧΙ- Όρια FOE για καθένα από τα 12 αντιγόνα SARS-CoV-2 και συνδυασμό κατηγορίας Igs με βάση τα αντισώματα του πλάσματος ρεδραστηριότητα σε εκπαίδευση κοόρτες (Συμπληρωματικός Πίνακες 3 και 4). Αυτά περιελάμβαναν υγιή δότη πριν από την πανδημία pλάσμα (Εκπαίδευση I, N = 573),δωρητές με πρόσφατος HCV μόλυνση (Εκπαίδευση II, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E (N=9)) και δότες με επιβεβαιωμένη μόλυνση SARS-CoV-2 (Εκπαίδευση III, N = 175). κατώφλια ήταν σειρά προς την σμικροποιώψευδώς θετικάενώ εξασφαλίζοντας ευαισθησία Για SARS-CoV-2ανίχνευση αντισωμάτων και για να φτάσει σε ένασυνολική ιδιαιτερότητα παραπάνωe99 τοις εκατόκαι περιλαμβάνεται επίπεδα Για σύνορο-γραμμή αντιδραστικότητα Για IgGRBD,IgG S1, και IgG N προς την επιτρέπω επίσης μετριόφρων αντίσωμα αντιδραστικότητα προς την αυτά τα αντιγόνα to είναι εξετάστηκε. ΝΧΙ-ΕΧΘΡΟΣ διαβάζει του άτομο δείγματα ήταν μεταμορφώθηκε σετιμές διακοπής σήματος υπεράνω (SOC) (MFI-FOE/κατώφλι). SOC vαλουμίνια είναι μεταχειρισμένος Γιαγαϊδούριατραγουδώ θετικός αντιδραστικότητα Για καθε άτομο αντιγόνο-αντίσωμα τάξη συνδυασμός, με SOC > 1 που δηλώνει θετική αντιδραστικότητα και SOC < 1 που δηλώνει αρνητική αντιδραστικότητα.Πότε σύνθεση άτομο κατώτατα όρια, το πρέπει είναι λαμβάνονται υπόψη ότι Για καθε του ο 12 ανιχνευμένο δραστηριότητες μπορεί να εμφανιστούν διασταυρούμενες αντιδράσεις. Με 12 επιμέρους παραμέτρους SOC καταγράφηκε, συνολική ταχύτηταcifiπόλη θα μείωση αν όποιος θετικός SOC ανεξάρτητα suffices προς την τιμή a δείγμα Συνολικά όπως και SARS-CoV-2 αντίσωμα θετικός. Προς την εξηγώ μέσω παραδείγματος:Υποθέτοντας ανεξάρτητες αποκρίσεις, ακόμη και μια υψηλή ειδικότητα 99 τοις εκατό για κάθε αντιγόνο θα προσθέσει to μια συνολική χαμηλή εξειδίκευση 88 τοις εκατό σε ολόκληρη την ανάλυση. Απαιτήσαμε λοιπόν γιαr SARS-CoV-2 θετικός κλήση σε ABCORA 2.0 a ελάχιστο του δύο specifiπόλεις προς την φθάνωδραστηριότητα πάνω απόοκατώφλι. Οι συνδυασμένες τιμές SOC που χρησιμοποιούνται για τον καθορισμό του συνόλουη οροκατάσταση ενός δεδομένου δείγματος περιγράφεται λεπτομερώς στον Συμπληρωματικό Πίνακα 5. Για IgG RBD, S1, και N,για την οποία καταγράψαμε επίσης δραστηριότητα SOC συνοριακής γραμμής, επιτρέψαμε ασυνδυασμός 1 αντιδραστικότητας αντιγόνου SOC > 1, η δεύτερη αντιδραστικότητα SOC > οριακή. ο final κατώφλι και θετικός κλήση κριτήρια επιτρέπεται Για ΔΙΑΦΟΡΕΤΙΚΟΤΗΤΑ-διάκριση της μερικής (νωρίς ορομετατροπή με μόνο IgM και IgA απαντήσεις) προς την γεμάτος ser- μετατροπή (συμπluding IgG απαντήσεις) (Συμπληρωματικός Τραπέζι 5). Σε πρόσθεση, τα κριτήρια δηλώνουν δείγματα με ασθενή αντιδραστικότητα ή/και απροσδιόριστη αντιδραστικότητα(Συμπληρωματικός Πίνακας 5).
Για να διευκολυνθεί η σύγκριση μεταξύeen ABCORA 2.0 και ABCORA 5.0 ο ίδιοκατώφλι χρησιμοποιήθηκαν αποκοπές για το ABCORA 5.0. Επιλέξαμε να μην δημιουργήσουμε συγκεκριμένη αποκοπήκατώφλια για αντιδραστικότητα αντισωμάτων HCV ως αn ακριβής defiμίσθωση του a αρνητικόςη ανταπόκριση είναι πολύπλοκη λόγω της εκτεταμένης έκθεσης σε HCoV και συνδιασπάσιμοςδιασταυρούμενη αντίδραση αντισωμάτωντιμιότητα μεταξύ τους. HCV απαντήσεις ήταν ωστόσο περιλαμβάνεται στο statistical αναλύσεις όπως και ΝΧΙ-ΕΧΘΡΟΣ αξίες.
Ορισμός του SARS-CoV-2 οροθετικότητα χρησιμοποιώντας υλικοτεχνική υποστήριξη οπισθοδρόμηση ταξινόμηση.
Classifiκατιόν του οροθετικό εναντίον οροαρνητικός δείγματα σε ABCORA 2. 1 πραγματοποιήθηκεχρησιμοποιώνταςυλικοτεχνική υποστήριξη οπισθοδρόμηση. ο πανομοιότυπο εκπαίδευση και επικύρωση δεδομένα μεταχειρισμένος Για ο εγκατάσταση του ABCORA 2.0 ήταν μεταχειρισμένος. Οπως και ο ABCORA 2.0 δεσμευτικές αντιδράσεις είχαν υψηλή συσχέτιση, συμπεριλάβαμε τις ακόλουθες μεταβλητές στο μοντέλο (Συμπληρωματικό Σύκο. 6a): ο σημαίνω αξία όλων των αποκρίσεων IgG MFI-FOE (RBD, S1, S2, N), το σημαίνω αξία του οι αποκρίσεις IgA MFI-FOE έναντι των RBD, S1 και S2 και η μέση τιμή τιμή των αποκρίσεων IgM MFI FOE έναντι RBD, S1 και S2. Απόκριση IgA και IgMs προς Ν εξαιρέθηκαν καθώς δεν ομαδοποιούνταν με τις άλλες αποκρίσεις του ίδιου Ig τάξη (Συμπληρωματικός Σύκο. 6α). Η λογιστική παλινδρόμηση χρησιμοποιήθηκε για την εκτίμηση και την πρόβλεψη την πιθανότητα ενός δεδομένου δείγματοςe προς την είναι θετικός (p) όπως και περιγράφεται σε εξίσωση (1).
Παράγμέτρα 0, G, A, και M ήταν εκτιμάται επί ο εκπαίδευση σύνολο δεδομένων. A δείγμα Στη συνέχεια ορίστηκε ως θετικό εάν η προβλεπόμενη πιθανότητα να είναι θετική ήταν μεγαλύτερηa κατώφλι c/. Αυτό το όριο ορίστηκε για να ληφθεί μια ειδικότητα τουλάχιστον 0.99 και μέγιστη ευαισθησία στο σύνολο δεδομένων εκπαίδευσης (ομοίως to c Για ο τυχαίος δάσος). Σεπερίληψη, σε ABCORA 2. 1, κάθε νέο δείγμα ορίζεται ως οροθετικό εάν η πιθανότητα του ότι είναι οροθετικό όπως εκτιμάται από την λογιστική παλινδρόμηση είναι πάνω από το c/. Αναλύουμε εμείςre εκτελείται σε έκδοση Rn 3.6.3. Ορισμός του SARS-CoV-2 οροθετικότητα χρησιμοποιώντας τυχαίος δάσος ταξινόμηση. Ταξινόμηση οροθετικών versus οροαρνητικός δείγματα σεοσυμφραζόμενα του ΑΓΚΥΡΑ 2.0 και ABCORA 5.0 ήταν reaλυσσασμένος χρησιμοποιώντας a τυχαίος δάσος πλησιάζω ΕΠΟΜΕΝΟ οβασική ρύθμιση του random δάση όπως και περιγράφεται σε57. ο τυχαίος δάσος εαυτό ήταν χτισμένο ενός συνόλου 1000 δέντρων ταξινόμησης που χρησιμοποιούν αποκρίσεις MFI-FOE (IgA, IgG,καιIgM έναντι RBD, S1, S2,N). ο πιθανότητα του a δείγμα να εισαι θετικός όπως και προ- που υπαγορεύεται από το τυχαίο δάσος είναι ο μέσος όρος του pπιθανότητες πάνω από όλα 1000 δέντρα. Τέλος, ορίζεται ένα δείγμαned όπως και θετικός αν του πιθανότητα του να εισαι θετικός είναι πάνω από a threshold c, οι οποίες είναι defined όπως και προς την αποκτώ a specifiπόλη του στο ελάχιστα 0.99 και a μέγιστος ευαισθησία στο τρένοing σύνολο δεδομένων. Σε περίληψη, όποιος νέος δείγμα είναι defined όπως καιοροθετικό εάν its πιθανότητα του να εισαι οροθετικό όπως και εκτιμάται με ο τυχαίοςδάσος είναι πάνω από το θρoshold c. Εμείς διεξαχθεί a σειρά του τυχαίος δάσος αναλύσεις που έλαβε υπόψη είτε μόνο απαντήσεις SARS-CoV-2 ή SARS-CoV-2 και HCV απαντήσεις σε ABCORA 2.0 και ABCORA 5.0: ABCORA 2.2 και ABCORA 2.3 ήτανεκπαιδευμένο και μεταχειρισμένος Για προφητεία επί ABCORA 2.0 δεδομένα και περιλαμβάνεται μόνο SARS- CoV-2 απαντήσεις ή SARS-Αποκρίσεις CoV-2 και HKU1, αντίστοιχα. ΑΓΚΥΡΑ 5.4 (μόνο απαντήσεις SARS-CoV-2) και ABCORA 5.5 (SARS-CoV-2 και HCVαπαντήσεις) ήταν εκπαιδευμένο επί ABCORA 5.0 δεδομένα. Λεπτομέρειες σχετικά με τη συμπερίληψη δεδομένων για το σχετικός μοντέλα είναι παρατίθενται σε Συμπληρωματικός Τραπέζι 3 και Συμπληρωματικός Τραπέζι 10. Οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν στην έκδοση R 3.6.3 χρησιμοποιώντας packages randomForest και δασοφύλακας58–61.
Για να διασφαλίσουμε την ευρωστία των ευρημάτων μας, πραγματοποιήσαμε ένα seευαισθησία ανάλυση με τυχαιοποίηση τα σύνολα δεδομένων εκπαίδευσης και επικύρωσης χρησιμοποιώντας διασταυρούμενη επικύρωση 5-πτυχώνμέθοδος. Και τα δύο σεττου θετικός και αρνητικά δείγματα ήταν διαιρεμένος σε five ίσοςεξαρτήματα και εμείς defined ότι τρόπος five επικύρωση σκηνικά (που αποτελείται του ο i-ου σειρά τουθετικά καιο i-ου σειρά του αρνητικά, i = 1.5). ο υπόλοιπο του ο δεδομένα ήταν μεταχειρισμένος Γιαεκπαίδευση ο ABCORA 2.3 τυχαίο δάσος. Για κάθε σύνολο επικύρωσης, η ειδικότητα καιευαισθησία του ο τυχαίος δάσος ήταν υπολογιστεί επί ο εκπαίδευση, επικύρωση, και εκπαίδευσησυνεπικύρωση σκηνικά (Συμπληρωματικός Πίνακας 6).
Επικύρωση και επαλήθευση χρησιμοποιώντας εξωτερικός ελέγχους. Εμείς μεταχειρισμένος ο Αντι-SARS- Πίνακας επαλήθευσης CoV-2 για ορολογικές δοκιμασίες (ΝIBSC κώδικας: 20/B770, NIBSC) προς τηνεπαληθεύστε την απόδοση της δοκιμής ABCORA 2.0 και ABCORA 2.3. Ορρόςsάφθονεςτου ο verifiκατιόν πίνακας μετρημένος με ABCORA 2.0/2.3 όπως περιγράφεται και τα αποτελέσματασε σύγκριση με τα αποτελέσματα εμπορικά διαθέσιμων αναλύσεων που αναφέρθηκαν από το NIBSC (32 και Συμπληρωματικός Πίνακας 7). Μυρίζουμεαυτήν verifiεκδ ο ευαισθησία του ο ABCORA 2 δοκιμή σε ανίχνευση SARS-CoV-2 μόλυνση σε μια άμεση σύγκριση με το εμπορικόδοκιμές. Αντιβόντι κατάσταση του πλάσμα αίματος από SARS-CoV-2 θετικός τα άτομα (N = 171) αναλύθηκεd με ο ΕΠΟΜΕΝΟ δοκιμή συστήματα: Περιλαμβάνεται δοκιμή συστήματα στοχευμένες ο N πρωτεΐνη (Elecsys® Αντι-SARS-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH)), η περιοχή RBD του ο S πρωτεΐνη (Elecsys® Αντι-SARS-CoV-2 Δοκιμασία S (Roche Diagnostics GmbH)),και ο S1 υπομονάδα (EUROIMMUN Αντι-SARS-CoV-2 ELISA (IgG)) (ΣυμπληρωματικόΠίνακας 8). Όλες οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σύμφωνα μεο κατασκευαστής'οδηγίες σε ο διαγνωστικά μονάδα του ο Ινστιτούτο του Ιατρικός Ιολογία, Πανεπιστήμιο του Ζυρίχη, Ελβετία.
SARS-CoV-2 δεσμευτικός αντίσωμα τίτλους. Προς την define δεσμευτικός αντίσωμα τίτλους, οκτώ
κατα συρροη 4-πτυχή αραιώσεις εκκίνηση με a 1/25 διάλυση του πλάσμα αίματος ήταν έτοιμος και μετρήθηκε σε ABCORA 2.0.Για την εξαγωγή ποσοτικών πληροφοριών, διορθώθηκαν οι τιμές των ΝΧΙ Για Ιστορικό δραστηριότητα (ΝΧΙ-αδειάζω χάντρα έλεγχος) και εμείς defined η περιοχή υπό ο ΝΧΙ καμπύλη (AUC) σε όλη τη σειρά αραιώσεων για κάθε αντιγόνο-Igσυνδυασμός. Ως δεύτερη ποσοτική ανάγνωση, υπολογίσαμε 50 τοις εκατό αποτελεσματικό τίτλοσυγκεντρώσεις (EC50) χρησιμοποιώντας a υλικοτεχνική καμπύλη τεσσάρων παραμέτρων (y=Κάτω συν (Επάνω-Κάτω)/(1 συν 10^((logEC50-X) * HillSlope))).
Ποσοτικοποίηση του SARS-CoV-2 S1 και RBD δραστηριότητα. Εμείς μεταχειρισμένος δύο προσεγγίσεις προς τηντυποποιώ SARS-CoV-2 S1 και RBD δραστηριότητα. ο fiπρώτον βασίστηκε στο S1/RBD ειδικό αντίσωμα CR3022 (38 και Συμπληρωματικός Πίνακας 13). Σειριακές αραιώσεις IgG, IgA, και IgM εκδόσεις του CR3022χρησιμοποιήθηκαν για τη δημιουργία τυπικών καμπυλών σε RBD και Επικάλυψη S1d περιδέραιο. ο γραμμικός εύρος του ο πρότυπο και δείγμα διάλυση καμπύλες ήτανμεταχειρισμένος Για ποσοτικοποίηση. Εμείς fitted a τέσσερις-παράμετρος υλικοτεχνική υποστήριξη καμπύλη (y = Κάτω μέροςσυν (Μπλουζα-Κάτω μέρος)/(1 συν10^((logEC50-X) * HillSlope))) (Συμπληρωματικός Σύκο. 7b)
μέσωh οι οποίες ΝΧΙ αξίες του μετρημένος δείγματα είναι παρεμβολή σε aαντίστοιχοςσυγκέντρωση τουαντίσωμα (µg/ml). Εμείς μεταχειρισμένος Αυτό πλησιάζω προς την ποσοτικοποιώ ο συγκέντρωση της αντιδραστικότητας αντισώματος RBD και S1 στον θετικό έλεγχο δότηκαιχρησιμοποιήθηκαν τιτλοδοτήσεις της δεξαμενής δωρητών που περιλαμβάνονται σε καθεμίαABCORA πλάκα προς την υπολογίζω οS1 και RBD συνσκηνή του πλάσμα αίματος δείγματασχετικά με το. Εμείς μεταχειρισμένος ο ίδιο στρατηγικήσε συνδυασμός με ο Ο ΟΠΟΙΟΣ Διεθνές Πρότυπο Αντι-SARS-CoV-2 Immu-
σφαιρίνη (NIBSC 20/13632) προς την αναβάλλω IU/ml περιεχόμενο του ο εσωτερικός ABCORAθετικός δότης πισίνα και ο άτομο δείγμα δοκιμασμένο (Συμπληρωματικός Σύκο. 7). οΟ ΟΠΟΙΟΣ Διεθνές Πρότυπο αποτελείται του a πισίνα του πλάσμα αίματος από τα άτομα με επιβεβαιωμένη μόλυνση από SARS-CoV-2. Περιεκτικότητα σε RBD και S1 του θετικού δότη ABCORA πισίνα ποσοτικάfiεκδ μέσω ο πολυκλωνικό Ο ΟΠΟΙΟΣ πρότυπο ήταν υψηλά παρόμοιος στα πλαίσιακάθε τάξη Ig (Συμπληρωματικός Σύκο. 7b). Σε αντίθεση, RBD αξίες εκτιμάται με οmAbCR3022 ήταν a παράγοντας 2.4–3.9 πιο χαμηλα από ο αντίστοιχος S1 αξίες, προτείνονταςμια συγγένεια διαφέρειce του CR3022 Για ο δύο αντιγόνα (Συμπληρωματικό Σχ. 7b).
Χρονικός εξέλιξη του SARS-CoV-2 δεσμευτικός αντίσωμα απάντηση. Αντίσωμα
μετρήθηκε η δέσμευση 140 ανάρρων ασθενώνd κατά μήκος σε274 μετρήσειςμε ABCORA 2.0, συμπεριλαμβανομένουg 251 Μετρήσεις από 120 ασθενείς με γνωστός χρόνος από το pθετικός RT-PCR. Εμείς υποτίθεται ο αντισώματα (αναλύονται όπως καιημερολόγιο MFI-ΕΧΘΡΟΣ) ήταν φθίνουσα με χρόνος από 21 ημέρες μετά θετικός RT-PCR και εκτιμάται ο φθορά χρησιμοποιώντας a μικτό μοντέλο ισχύος-νόμου με τυχαία επίδραση στοαναχαιτίζω62. Ως μέτρο χρόνουres ημέρες Θέση fiπρώτον θετικός RT-PCR αποτέλεσμα (Σύκο. 5b) ήημέρες μετά την εμφάνιση των συμπτωμάτωνoms (Συμπληρωματικός Σύκο. 11b) ήταν απασχολούνται. τα μισα-ζει (t1/2, σε ημέρες) του signifiκλίση απόκριση με αρνητικές διασπάσεις υπολογίστηκαν με βάση ο σχετικός εκτιμώμενες παραμέτρους αποσύνθεσης. Οι αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν σε έκδοση R 3.6.3 χρησιμοποιώντας πακέτα lme4 και lmerTest63.
SARS-CoV-2 ψευδής-εξουδετέρωση χημική δοκιμή. SARS-CoV-2 πλάσμα αίματος εξουδετέρωση
η δραστηριότητα ορίστηκε χρησιμοποιώντας ένα ψευδο-βασισμένο στον HIVιός Σύστημα όπως και περιγράφεται33. οenv-αδρανοποιημένο HIV- 1 δημοσιογράφος κατασκευάσουμε HIV- 1NL4-3 ΔEnv-NanoLuc (HIV- 1Nanoluc) και HT1080/ACE2cl. 14 κελιά παρασχέθηκαν ευγενικά από τον P. Bieniasz, Ροκφέλr Πανεπιστήμιο, NY, ΗΠΑ. Προς την δημιουργώ a SARS-CoV-2 ακίδα έκφρασηπλασμίδιο (P_CoV2_Γουχάν), a κωδικόνιο-βελτιστοποιημένη C τερματικό κολοβός (AA 1255- 1273) γονίδιο που κωδικοποιεί ακίδα του strain Γουχάν-Hu- 1 (GenBank ένταξη όχι. MN908947) wόπως και συντίθεται (GeneArt, Thermo Ψαράς Scientific, Waltham, MA) και κλωνοποιημένος σε pcDNA.3. 1. Ιοί που εκφράζουν ψευδότυπο SARS-CoV-2ήταν γενσβηστεί με συν-διαμόλυνση 293-T κύτταρα με a μίγμα του HIV- 1Nanoluc, P_CoV2_Wuhan και PEI Max (Polysciences EΕυρώπη GmbH, Hirschberg, Γερμανία). Μετά 48 h ιός, υπερκείμενα φιλτραρίστηκαν (0.2 μm) και αποθηκεύτηκαν σε κλάσματα σε −80 βαθμούς μέχρι τη χρήση. Μολυσματικότητα του virμας αποθέματα όπως και μετρημένος με μόλυνση του HT1080/ ACE2cl. 14 κύτταρα. Για αυτό το 384-πηγαδάκι καλλιέργειας προτρέφαγε με πολυ-L-Λυσίνη ήταν σπαρμένος με HT1080/ΑΣΣΟΣ2cl. 14 (2200 κύτταρα/φρεάτιο) μία ημέρα πριν από τον προσδιορισμό. Κύτταραήταν μολυσμένος με τιτλοδοτημένος ιός αποθέματα και NanoLuc λουσιφεράση δραστηριότητα σε κύτταρολύματαήτανμετρημένος 48 h μετά τη μόλυνση χρησιμοποιώντας το σύστημα ανάλυσης Nano-Glo Luciferase (Promega, Fitchburg, WI). Για αυτό, τα κύτταρα πλύθηκαν μία φορά με wiου PBS, ουπερκείμενο
αφαιρέθηκεεκδ και κύτταρα ήταν λυμένο με 20 µl/Καλά του Λουσιφεράση Κύτταρο Λύσης αντιδραστήριο
(Promega, Fitchburg, WI) Για 15 ελάχ υπό συνεχής κλονισμός στο δωμάτιοθερμοκρασία. 20 μl 1/50 αραιωμένου ρυθμιστικού διαλύματος NanoGlo wπριν προστέθηκε και NanoLuc λουσιφεράσηδραστηριότητα (συγγενής φως μονάδες, RLU) ήταν μετρημένος μετά 5 ελάχ επώαση στο θερμοκρασία δωματίου επί a Πέρκιν Έλμερ Αναγνώστης EnVision. Η εισαγωγή του SARS-CoV-2 ψευδο-ιούς για εξουδετέρωσηn αναλύσεις ήταν προσαρμοσμένη προς την απόδοση παραγωγής ιός μολυσματικότητααντίστοιχοςσε 5– 10 × 106 RLU (αντιστοιχεί σε 100-250-πάσο πάνω από το backgroundτιμές RLU) απουσία αναστολέων. Για τη μέτρηση της δραστηριότητας εξουδετέρωσης του πλάσματοςy έξι σειριακές 4-πλάσιες αραιώσεις εκκίνησης πλάσματοςg στο a 1/25 διάλυση ήταν έτοιμος. 20 µl του ο αραιωμένο πλάσμα αίματος και 20 µl τουοιός ήταν προεπώαση για 1 ώρα στους 37 βαθμούς και μετά 30 μl του μίγματος ιού/πλάσματος ήταν trανατέθηκε προς την 384-Καλά πιάτα σπαρμένος μεHT1080/ACE2cl. 14 κύτταρα σε όγκο 30 μl. Αυτό είχε ως αποτέλεσμα μια τελική συγκέντρωση του πλάσματος έναρξης αρχρησιμοποίηση του 1/100. Πλάσμα αίματος εξουδετέρωση τίτλους προκαλώντας50 τοις εκατό, 80 τοις εκατό,και90 τοις εκατόμείωση σε ιογενής μολυσματικότητα (NT50, NT80, και NT90,αντίστοιχα) σε σύγκριση προς την ελέγχους χωρίς πλάσμα αίματος ήταν υπολογίζεται με fitting μια σιγμοειδής δόση-απόκριση καμπύλη (μεταβλητός κλίση) στα δεδομένα RLU, χρησιμοποιώντας το GraphPad Prism μεπεριορισμούς (κάτω μέρος = 0, μπλουζα = 100). Αν50 τοις εκατόαναχαίτηση ήταν δεν επιτεύχθηκε στο οχαμηλότερο σlάσμα διάλυση του 1/100, a 'πιο λιγο από' αξία ήταν έχει καταγραφεί. Ολα Μετρήσεις διεξήχθησαν εις διπλούνtes.
Πρόβλεψη εξουδετέρωση με βάση επί ABCORA δεσμευτικός δραστηριότητα. Προς την συγκρίνω ο
ικανότητα του SARS-CoV-2 δεσμευτικός δραστηριότητα μετρημένος σε ABCORA 2.0 προς την προλέγω η εξουδετέρωση κατάσταση, εμείς μετρημένος εξουδετέρωση δραστηριότητα προς την Γουχάν-Hu- 1 σεSARS-CoV-2 θετικός τα άτομα (N = 467) και classifiεκδ τα άτομα όπως και υψηλόςεξουδετερωτές (ΝT50 > 250,N = 332) και χαμηλός εξουδετερωτές (NT50 < 250,N = 135). Σιx διαφορετικός classifiκατιόν μοντέλα ήταν σχεδιασμένο προς την αναθέτω τα άτομα προς την ο υψηλός ή χαμηλής κατηγορίας εξουδετερωτών, με βάση τα μοτίβα σύνδεσης ABCORA2.0 we εγκαθιστώ-
λυγισμένος δύο αμετάβλητο υλικοτεχνική υποστήριξη οπισθοδρόμηση (ULR) μοντέλα ότι περιλαμβάνεται μέσος όρος ΝΧΙ-
ΕΧΘΡΟΣ ακίδα αντιδραστικότητα αντιγόνου S1 και μέση ακτίνα αντιγόνου MFI-FOE RBD τιμητικά, αντίστοιχα. Τα S1 και RBD επιλέχθηκαν λόγω αυτώνr ύψιστος συσχέτιση μεNT50 (r = 0.82 και r = 0.80 Για ο σύνολο ακίδα αντιδραστικότητα του S1 και RBDαντίστοιχα, Συμπληρωματικός Σύκο. 9). Σε πρόσθεση προς τηναυτό το δύο ULR, ιδρύσαμε α πολυμεταβλητό μοντέλο λογιστικής παλινδρόμησης που περιλαμβάνει και τους δύο μέσους όρους S1και RBD αντιδραστικότητα (MFI). We περαιτέρω επινοήθηκε τρία μοντέλα ότι λαμβάνονται υπόψη όλα 12 SARS-CoV-2 δεσμευτική παραμαιτέρων έχει καταγραφεί με ABCORA 2.0. Δύο πολυμεταβλητή υλικοτεχνική υποστήριξηοπισθοδρόμησηΤα μοντέλα βασίστηκαν σε ένα κύριο συστατικό πρωκτικόύσις του όλα δεσμευτικός δραστηριότητεςκαι περιλαμβάνεται ο fiπρώτον δύο (αντίστοιχα τέσσερις) ΔΙΕΥΘΥΝΤΡΙΑ σχολειου συστατικά, οι οποίεςεξήγησε60 τοις εκατό (αντίστοιχα75 τοις εκατό) της διακύμανσης στα δεδομένα. Συμπεριλάβαμε επίσης σε Το μοντέλο μας συγκρίνει μια ταξινόμηση με βάση ένα τυχαίο foυπόλοιπο ανάλυση που ενσωμάτωσε όλα 12 SARS-Μεταβλητές δεσμευτικής δραστηριότητας CoV-2.
Και για τα έξι μοντέλα, η απόδοση αξιολογήθηκε σε 100 σετ διασταυρούμενης επικύρωσης:κάθε σετ ήταν χτίστηκε με τυχαία δειγματοληψία χωρίς αντικατάσταση μεταξύ των 467Μετρήσεις διαθέσιμος. 80 τοις εκατό του συνόλου δεδομένων χρησιμοποιήθηκε για την εκπαίδευση του μοντέλου (N=374).Προφητεία της κατάστασης εξουδετέρωσης πραγματοποιήθηκε στο άλλο 20 τοις εκατό (N=93) καισυγκρίνωd προς την ο αληθής NT50 αξία και εξουδετέρωση κατάσταση, χρησιμοποιώντας a roc καμπύλη. οπεριοχή υπό ο καμπύλη (AUC) ήταν υπολογίζεται και για τα έξι μοντέλα σε κάθε διασταυρούμενη επικύρωση τρέξιμο. ο Bayesian πληροφορίες κριτήριο (BIC) ήταν υπολογιστεί Για όλα fiveλογιστικές παλινδρομήσεις σε κάθε διασταυρούμενη επικύρωσηιόν τρέξιμο.
Προς την αυξάνουν ο χρησιμότητα του ο ULR-S1 προφητεία μοντέλο Για κλινικός διαγνωστικάεπινοήσαμεa modifiεκδ εξουδετέρωση προφητεία μοντέλο ULR-S1-SOC με βάση επί οτιμή διακοπής σήματος (SOC).s έχουν αναφερθεί Για ABCORA 2.0. ο ULR-S1-SOCυπολογίζει ο πιθανότητα του NT50 > 250 με βάση το άθροισμα των τιμών S1 SOC γιαIgG, IgA, και IgM όπως και υποδεικνύεται σε Εξ. (2).
expða συν b * log 10ðsumS1SOCÞÞ PðNT50>250Þ =
Πνεύμαh εκτιμάται αξίες: a = −2.6447 και b = 3.5353.
Αναλύθηκαν οι εκτιμήσεις ULR-S1-SOC για την πιθανότητα NT50 > 100εκδ σεαναλογία (Υπσυμπληρωματική Τραπέζι 9 και Συμπληρωματικός Σύκο. 10).
Σχέση μεταξύ HCoVs και SARS-CoV-2 αντιδραστικότητα. Προς την εξερευνώ ο
συσχέτιση μεταξύ των HCoV και των αντιδράσεων SARS-CoV-2, ορίσαμε μιαw Απόκριση HCoV μεταβλητός (HCV υψηλός/χαμηλός) για κάθε κατηγορία αντισωμάτων (IgG, IgA, IgM) ως εξής: a υπομονετικος είχε υψηλός HCV Ig αντιδραστικότητα Για a δεδομένος αντίσωμα τάξη αν τουΜετρήσεις ήταν πιο ψηλά από ο διάμεσος πληθυσμός σε τουλάχιστον τρεις από τους τέσσερις μετρήσεις HCoV (HKU1, OC43,NL63, 229E). Προς την εκτιμώαλληλεξαρτήσεις μεταξύ HCoV και απαντήσεις SARS-CoV-2, στη συνέχεια συμπεριλάβαμε τις HCV απάντηση μεταβλητός σε a γραμμικός οπισθοδρόμηση μοντέλο του SARS-CoV-2αντιδραστικότητα σε την ίδια κατηγορία αντισωμάτων. Τα μοντέλα γραμμικής παλινδρόμησης εκτιμήθηκαν σε ένα υποet τουSARS-CoV-2 θετικοί ασθενείς (N=204), που μετρήθηκαν στο ABCORA 5.0 λιγότερο από 60 ημέρες από τη θετική RT-PCR. Επιλέχθηκε ο περιορισμός στις 60 ημέρεςπρος την επιτρέπουν τη μοντελοποίησητουο αποτέλεσμα του χρόνος με σφήνες. Αυτόπερίοδος περιορισμός περαιτέρωεγγυημένη μια ισορροπία μεταξύ των φύλων, όπως ήταν όλοι οι δότες ανάρρωσης με μεγαλύτερη παρακολούθηση μαμάles στρατολογήθηκαν Για a πλάσμα αίματος θεραπεία μελέτη (CPT-ZHP, Ελβετολόγος 2020TpP1004). Οπισθοχώρησηιόν αναλύσεις ήταν προσαρμοσμένη επί χρόνος (ημέρες Θέση θετικός RT-PCR ή επίθεση του συμπτώματα; όπως και a spline με 3 βαθμούς του ελευθερία),ηλικία (ως σφήνα με 3 μοίρες του ελευθερία), και γένος.
Μεταξύ των 204 ασθενών έναςαναλυθεί Για αλληλεξαρτήσεις, πληροφορίες Σχετικά μενοσηλεία σε νοσοκομείο κατάσταση (δεν νοσηλευόμενος, νοσηλευόμενος δεν σε ΜΕΘ, νοσηλευόμενος στη ΜΕΘ) ήταν γνωστό για 160 από αυτά. Για 80 ασθενείς είχαμε δείγματα που ήτανσυλλέχθηκαν λιγότερο από 30 ημέρες από τη διάγνωση του SARS-CoV-2 με θετικό RT-PCRεπιτρέποντας μια εκτίμηση του HCV επίπεδα Κλείσε προς την SARS-CoV-2 απόκτηση. Εμείς εκτελέσαμε ένα πρόσθετος ανάλυση επί Αυτό υποσύνολο του ασθενείς χρησιμοποιώντας τακτικόςπαλινδρόμηση και υλικοτεχνική παλινδρόμησηιόν προς την προλέγω ο νοσηλεία σε νοσοκομείο κατάσταση σε συνάρτηση επί υψηλός ή χαμηλός IgG HCoV αντιδραστικότητα, προσαρμοσμένη επί ηλικία (όπως και a spline με 3 βαθμούς του ελευθερία) και το φύλο. Ελέγξαμε το fήοευρωστία του ο αποτέλεσμα σε a ευαισθησίαανάλυση με προσαρμογή εγκαίρως από θετικήe RT-PCR σε πρόσθεση προς την ηλικία και γένος (Συμπληρωματικός Σύκο. 15).
Στατιστικός ανάλυση. Οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν στο R (έκδοση 3.6.3).
Φιγούρες ήταν έκανε χρησιμοποιώντας ο ggplot2 πακέτο64. Όταν περιλαμβάνονται, τα κουτιά αντιπροσωπεύουν το φολχαμηλώνοντας: διάμεσος με ο Μέσης γραμμή, ανώτερος και πιο χαμηλα τεταρτημόρια με ο όρια κουτιών, 1.5x μεσοτεταρτημόριο σειρές με ο φαβορίτα, και ακραίες τιμές με σημεία. Θερμότητα- χάρτες ήταν έκανε χρησιμοποιώντας ο ComplexHeatmap πακέτο65.Η σημασία του Spearman κατάταξη correδεσμεύσεις ήταν αξιολογηθεί διά μέσου ασυμπτωτικός t προσέγγιση. Διαφορές σε σημαίνωs μεταξύ δύο ομάδες με ανεξάρτητος μέτρα ήταν δοκιμασμένο χρησιμοποιώντας δύο-πλευρικά t-tests. Όταν ισχύει, mαπέραντος δοκιμές ήταν προσαρμοσμένη χρησιμοποιώντας Bonferroni διόρθωση για πολλαπλές συγκρίσεις. Α επάνωe-τρόπος ANOVA με 3 βαθμούς του ελευθερία ήταν μεταχειρισμένος σε πρόσθεση προς την δύο-ουρά t-tests στο Σχ.6 για την παροχή πληροφοριών σχετικά με τη συνολική έναντι της ομάδας σύγκριση. Κατά την ανάλυση συνόλων δεδομένων περιλαμβάνειng αλλεπάλληλος Μετρήσεις του οτα ίδια άτομα (Εικ.3α, Εικ.5β, Εικ.5c, Supσυμπληρωματική Σύκο. 8a, Συμπληρωματικός Σύκο. 11β), χρησιμοποιήσαμε γραμμικά και μικτά μοντέλα νόμου ισχύος με το χρόνο από θετικό RT-PCR ή χρόνος Από σύμπτωμα επίθεση (συνεχής ή δυάδικος μεταβλητός) όπως και fiεφέ xedκαι άτομο όπως και a τυχαίος αποτέλεσμα. Σε ο υπόθεση του Σύκο.5γ και συμπληρωματικό Σχ. 11γ, η φθίνουσα κλίση των τίτλων εξουδετέρωσης εκτιμήθηκε με τα μειονεκτήματαireding μόνο άτομα με εξουδετέρωση τίτλους πάνω από ο ανίχνευση επίπεδα (NT50 >100) στοτην πρώτη τους μέτρηση. Για όλα τα γραμμικά μικτά μοντέλα, μια προσέγγιση Satterthwaiteationγια μια διπλής όψης t-test χρησιμοποιήθηκε για να προσδιοριστεί εάν η εκτιμώμενη κλίση ήταν σημαντικήy διαφορετικό από το 0. Επιπλέον, λήφθηκαν χρόνοι ημιζωής from ο φθορά τιμή εκτιμάται επί ο κούτσουρο είτε των MFI-FOEs (Εικ.5β, Συμπληρωματικό Σχ. 11β) ή NT50 (Εικ.5c,Συμπληρωματικός Σύκο.11γ) ως εξής: t1/2=t0 * exp(log10(2)/rate), με
t0=21 ημέρες από τη θέσηθετική RT-PCR ή Από σύμπτωμα επίθεση. Σε Σύκο. 7b, c, γραμμικόςπαλινδρομήσεις ήταν μεταχειρισμένος προς την εκτίμηση ο σχέση μεταξύ HCV και SARS-CoV-2 αντιδραστικότηταs: a Μαθητης σχολειου t-δοκιμή με a δύο-πλευρικά υπόθεση ήταν μεταχειρισμένος προς την εκτιμώ αν Αυτόσχέση ήταν signifiανυπόμονα διαφορετικό από το 0.
Αναφορά περίληψη. Περαιτέρω πληροφορίες επί έρευνα σχέδιο είναι διαθέσιμος σε ο Φύση
Reseαψίδα Αναφορά Περίληψη συνδεδεμένο προς την Αυτό άρθρο.






