Διερεύνηση της αιτιώδους σχέσης μεταξύ της κατάθλιψης που σχετίζεται με το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα από την προοπτική «όλων της στασιμότητας Qi και της κατάθλιψης που σχετίζεται με τον πνεύμονα» και της πρόβλεψης της παρέμβασης Παραδοσιακή κινεζική ιατρική

Περίληψη:Στόχος Να διερευνηθεί η γενετική αιτιώδης σχέση μεταξύαδενοκαρκίνωμα πνεύμονα(LUAD) καιμείζονα καταθλιπτική διαταραχή (MDD)μέσω της Μεντελικής ανάλυσης τυχαιοποίησης (MR), βασισμένη στη θεωρία του "όλα τα τσι στασιμότητα και κατάθλιψη που σχετίζονται με τους πνεύμονες", και προβλέψτε πιθανά παραδοσιακά κινέζικα φάρμακα για την παρέμβαση της κατάθλιψης που σχετίζεται με το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα (LAD). Μέθοδοι Τα σύνολα δεδομένων συσχέτισης μελετών γονιδιώματος (GWAS) για LUAD και MDD ελήφθησαν από τη βάση δεδομένων OpenGWAS του IEU. Η ανάλυση μαγνητικής τομογραφίας και η αξιολόγηση ευρωστίας διεξήχθησαν κυρίως χρησιμοποιώντας το πακέτο λογισμικού TwoSampleMR κοντά στο γένος IV. Πραγματοποιήθηκε ανάλυση λειτουργικού εμπλουτισμού με βάση τα IVNG και οι βάσεις δεδομένων CTD και ITCM χρησιμοποιήθηκαν για την πρόβλεψη των σχετικών χημικών συστατικών και των πιθανών παρεμβάσεων της παραδοσιακής κινεζικής ιατρικής (V2.3.9) για στατιστική ανάλυση της προκαταρκτικής ανάλυσης του TCM Η σταθμισμένη μέθοδος διακύμανσης (= 0.002 05, P=0.018 99) πρότεινε μια ασθενή θετική αιτιώδη επίδραση μεταξύ LUAD και MDD δεν έδειξε σημαντική ετερογένεια ή οριζόντια πλειοτροπία, επιβεβαιώνοντας την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων με την πιο συχνή χολινεργική συναπτική οδό Σε πέντε κύριες ομάδες Τα τέσσερα τσι (ιδιότητες θερμοκρασίας) όλων των πιθανών επεμβάσεων TCM ήταν κυρίως ζεστά και κρύα αιμορραγία, αποτοξίνωση και κάθαρση της ζέστης και της υγρασίας Οι κλασικές συνταγές που αντιστοιχούν στις 15 πιο συχνές TCM περιελάμβαναν Mahuang (Ephedrae Herba), Zhizi (Gardeniae Fructus), Yiyiren (Coicis Semen), Pugongying (Taraxaci Herba) και.Roucongrong (Cistanches Herba), με παρόμοιες κλασικές συνταγές να είναι οι φόρμουλες που βασίζονται στο Mahuang, Huaihua Powder (槐花散), Huanglian Jiedu Decoction (黄连解毒汤), Weijing Decoction (苇茎汤), Wuwei Xiaodu Drink (5咳殥殥咳)川煎), αφέψημα Huagan (化肝煎) και αφέψημα Sangxing (桑杏汤). Συμπέρασμα Με βάση τη θεωρία "όλη η στασιμότητα του τσι και η κατάθλιψη σχετίζονται με τον πνεύμονα", βρέθηκε μια ασθενής θετική γενετική αιτιολογική επίδραση μεταξύ LUAD και MDD. Το LUAD μπορεί να προάγει την ανάπτυξη της MDD επηρεάζοντας τη μετάδοση του νευρικού σήματος και τους ρυθμιστικούς μηχανισμούς, ιδιαίτερα μέσω της χολινεργικής οδού. Επιπλέον, συνδυάζοντας την ιατρική θεωρία "Κατάσταση στόχου" και τα προβλεπόμενα αποτελέσματα TCM, αυτή η μελέτη διερεύνησε πιθανές θεραπείες TCM για LAD, με στόχο να παρέχει αναφορές για τη θεραπεία TCM ασθενών με LAD για τη βελτίωση των συνολικών θεραπευτικών αποτελεσμάτων και της ψυχικής υγείας των ασθενών με LUAD.

Λέξεις κλειδιά: κατάθλιψη που σχετίζεται με το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα; Μεντελική τυχαιοποίηση; Πρόβλεψη της παραδοσιακής κινεζικής ιατρικής. στόχος-κατάσταση? Τύποι με βάση το Mahuang. Σκόνη Huaihua; Αφέψημα Huanglian Jiedu; Αφέψημα Weijing; Ποτό Wuwei Xiaodu; Αφέψημα Jichuan; Αφέψημα Huagan; Αφέψημα Sangxing; Ephedrae Herba; Gardeniae Fructus; Coicis Semen; Taraxaci Herba;Cistanches Herba

 

 

 

Υψηλού επιπέδου φυτική φόρμουλα Cistanche για τη θεραπεία της κατάθλιψης που σχετίζεται με το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα

Whatsapp μας για περισσότερες λεπτομέρειες

 

 

Το αδενοκαρκίνωμα του πνεύμονα (LUAD) είναι ο πιο κοινός υποτύπος καρκίνου του πνεύμονα παγκοσμίως. Αν και υπάρχουν σημαντικές περιφερειακές διαφορές, η συχνότητα εμφάνισης LUAD είναι υψηλότερη τόσο στους άνδρες όσο και στις γυναίκες στην Ανατολική Ασία [1]. Η ψυχολογική επιβάρυνση που σχετίζεται με κακοήθεις όγκους, ιδιαίτερα η εμφάνιση μείζονος καταθλιπτικής διαταραχής (MDD) στους ασθενείς, θέτει σημαντικές προκλήσεις για την ατομική υγεία. Αυτό όχι μόνο επηρεάζει την ποιότητα ζωής τους αλλά επηρεάζει αρνητικά και την αποτελεσματικότητα της θεραπείας της νόσου [2]. Ως εκ τούτου, η έγκαιρη αναγνώριση και θεραπεία της MDD έχει μεγάλη σημασία για τη βελτίωση της συνολικής πρόγνωσης των ασθενών με κακοήθεις όγκους.

Η Παραδοσιακή Κινεζική Ιατρική (TCM) έχει μια θεωρία που δηλώνει, «Όλες οι μορφές στασιμότητας και καταπίεσης τσι ανήκουν στους πνεύμονες», οδηγώντας στην υπόθεση ότι η εμφάνιση MDD σε ασθενείς με LUAD μπορεί να σχετίζεται με δυσλειτουργία στις λειτουργίες διασποράς και καθόδου του πνεύμονα. Μελέτες έχουν επιβεβαιώσει μια αμφίδρομη σχέση μεταξύ κακοήθων όγκων και MDD. Για παράδειγμα, υπάρχει μια γενετική συσχέτιση μεταξύ της MDD και ενός αυξημένου κινδύνου καρκίνου του πνεύμονα [3], και η συχνότητα εμφάνισης της MDD είναι υψηλότερη σε ασθενείς με καρκίνο του πνεύμονα σε σύγκριση με μη καρκινικούς πληθυσμούς [4]. Ωστόσο, το εάν το LUAD, ως υποτύπος καρκίνου του πνεύμονα, έχει γενετική βάση για την εμφάνιση του MDD δεν έχει διευκρινιστεί πλήρως.

Αυτή η μελέτη είναι η πρώτη που χρησιμοποιεί ανάλυση δύο δειγμάτων Mendelian randomization (MR) για να διερευνήσει τη γενετική αιτιώδη σχέση μεταξύ LUAD και MDD. Με τον εντοπισμό οργανικών μεταβλητών κοντινών γονιδίων (IVNGs) και τη διεξαγωγή αναλύσεων εμπλουτισμού, η μελέτη στοχεύει να αποσαφηνίσει τους πιθανούς παθογόνους μηχανισμούς που βρίσκονται κάτω από τη συσχέτιση μεταξύ LUAD και MDD. Επιπλέον, με βάση τα IVNG και τις δημόσιες βάσεις δεδομένων, η μελέτη προβλέπει πιθανές ενώσεις και κινεζικά φαρμακευτικά βότανα για παρέμβαση στην κατάθλιψη που σχετίζεται με το LUAD (LAD). Συνδυάζοντας αυτές τις προβλέψεις με ιατρική «στοχευμένη στο κράτος» [5], η μελέτη διερευνά προσεγγίσεις TCM για τη θεραπεία της LAD, με στόχο την επίτευξη ακριβούς στοχευμένης θεραπείας υπό την καθοδήγηση θεμελιωδών θεωριών TCM και διαφοροποίησης και θεραπείας συνδρόμου. Αυτό παρέχει καινοτόμες ιδέες και μεθόδους για παρεμβάσεις που βασίζονται σε TCM για το LAD, προωθώντας την κληρονομικότητα, την καινοτομία και τον εκσυγχρονισμό του TCM.

1 Υλικά και Μέθοδοι

1.1 Σχεδιασμός Μελέτης

Πρώτον, χρησιμοποιήθηκε ανάλυση MR δύο δειγμάτων για την αξιολόγηση της γενετικής αιτιώδους επίδρασης μεταξύ LUAD και MDD. Στη συνέχεια ελήφθησαν τα IVNG και η ανάλυση εμπλουτισμού χρησιμοποιώντας γονιδιακή οντολογία (GO) και την Εγκυκλοπαίδεια Γονιδίων και Γονιδιωμάτων του Κιότο (KEGG) διεξήχθη για να αποκαλύψει τους πιθανούς παθογόνους μηχανισμούς της LAD. Επιπλέον, οι ενώσεις και τα κινέζικα φαρμακευτικά βότανα που σχετίζονται με το LAD προβλέφθηκαν με βάση τα IVNGs. Τέλος, η πλατφόρμα Ancient and Modern Medical Records Cloud (V2.3.9) (https://www.yiankb.com/) χρησιμοποιήθηκε για στατιστική ανάλυση, ανάλυση ομαδοποίησης και ταυτοποίηση παρόμοιων κλασικών συνταγών για τα προβλεπόμενα κινεζικά φαρμακευτικά βότανα. Αυτό παρείχε νέες ιδέες και μεθόδους για παρεμβάσεις που βασίζονται στο TCM στο LAD. Η ροή εργασιών της έρευνας φαίνεται στο Σχήμα 1.

 

1.2 Ανάλυση MR

1.2.1 Απόκτηση Συνόλων Δεδομένων Γονιδιωματικών Μελετών Συσχέτισης (GWAS).

Τα σύνολα δεδομένων GWAS για LUAD και MDD ελήφθησαν χρησιμοποιώντας το πακέτο TwoSampleMR από τη βάση δεδομένων OpenGWAS του IEU (https://gwas.mrcieu.ac.uk/). Το σύνολο δεδομένων LUAD GWAS (ieu-a-965) και το σύνολο δεδομένων MDD (ebi-a-GCST90038650) χρησιμοποιήθηκαν για την εξαγωγή μεταβλητών οργάνων που σχετίζονται με το LUAD και τις πληροφορίες επίδρασής τους στο σύνολο δεδομένων ebi-a-GCST90038650 για αιτιώδη συναγωγή στην ανάλυση MR.

Το σύνολο δεδομένων ieu-a-965 περιλαμβάνει 3.442 περιπτώσεις LUAD και 14.894 υγιείς μάρτυρες, συνολικά 18.336 άτομα. Το σύνολο δεδομένων ebi-a-GCST90038650 αποτελείται από συνοπτικά δεδομένα GWAS από ευρωπαϊκούς πληθυσμούς, που δημοσιεύθηκαν από τους Dönertaş et al. [6] σεΓήρανση της Φύσηςτο 2021.

1.2.2 Επιλογή οργάνων μεταβλητών

Οι μελέτες μαγνητικής τομογραφίας πρέπει να ικανοποιούν τρεις βασικές υποθέσεις:

Οι όργανες μεταβλητές (IV) πρέπει να συσχετίζονται σημαντικά με τον παράγοντα έκθεσης.

Τα ενδοφλέβια δεν πρέπει να σχετίζονται με κανέναν συγχυτικό παράγοντα.

Τα IV πρέπει να επηρεάζουν το αποτέλεσμα μόνο μέσω του παράγοντα έκθεσης.

Σε αυτή τη μελέτη, οι πληροφορίες για τον πολυμορφισμό ενός νουκλεοτιδίου (SNP) ανακτήθηκαν από τον Κατάλογο GWAS (https://gwas.mrcieu.ac.uk/) και τα SNP που σχετίζονται με πιθανούς συγχυτικούς παράγοντες (π.χ. σχιζοφρένεια, διπολική διαταραχή, επεισόδια μανίας, μετατραυματικό στρες, διαταραχή μετατραυματικού στρες, διαταραχή MD σε ηλικία, υπερηλικία αϋπνία κ.λπ.) αποκλείστηκαν. Τα ακόλουθα βήματα εκτελέστηκαν χρησιμοποιώντας το πακέτο TwoSampleMR:

Επιλέγοντας SNP που σχετίζονται στενά με τις εργαλειακές μεταβλητές: Ένα όριο επιλογής τουPΕφαρμόστηκε < 1,0×10-5. ΑυτόP-Το όριο τιμής χρησιμοποιείται συνήθως σε μελέτες GWAS για να διασφαλιστεί ότι τα επιλεγμένα SNPs έχουν επαρκή στατιστική σημασία με το χαρακτηριστικό, μειώνοντας έτσι το ψευδώς θετικό ποσοστό και διασφαλίζοντας την αξιοπιστία των IV [7].

Αφαίρεση της ανισορροπίας σύνδεσης: Οι παράμετροι ορίστηκαν ωςr²= 0.001 καιkb= 10.000. Αυτά τα όρια διασφαλίζουν την ανεξαρτησία των επιλεγμένων SNP εντός του γονιδιώματος, αποφεύγοντας την υπερβολική συσχέτιση μεταξύ των IV λόγω ισχυρής ανισορροπίας σύνδεσης, βελτιώνοντας έτσι την εγκυρότητα των IVs [8].

Εξαιρουμένων των SNP με συχνότητα ελάσσονος αλληλόμορφου (MAF) < 0,01: Τοmaf_thresholdΗ παράμετρος εφαρμόστηκε για τον αποκλεισμό σπάνιων SNP, διασφαλίζοντας ότι τα επιλεγμένα SNP έχουν καλύτερη στατιστική ισχύ και βιολογική αντιπροσωπευτικότητα, σύμφωνα με τα πρότυπα επιλογής για κοινές παραλλαγές [9].

Εξαιρούνται τα παλινδρομικά SNP: Αυτό το βήμα αποφεύγει την προκατάληψη ανάλυσης που προκαλείται από παλινδρομικές ακολουθίες, βελτιώνοντας περαιτέρω την ακρίβεια των αποτελεσμάτων [10].

1.2.3 Στατιστική Ανάλυση

Αυτή η μελέτη χρησιμοποίησε κυρίως τη μέθοδο αντίστροφης διακύμανσης με στάθμιση (IVW) για την αξιολόγηση γενετικών αιτιακών επιδράσεων, ενώ οι μέθοδοι MR-Egger, Simple Mode, Weighted Median και Weighted Mode χρησιμοποιήθηκαν για την αξιολόγηση της ευρωστίας των αποτελεσμάτων IVW. Η πιθανή αιτιώδης σχέση μεταξύ LUAD και MDD παρουσιάστηκε χρησιμοποιώντας αναλογίες πιθανοτήτων (OR) και διαστήματα εμπιστοσύνης 95% (CI).

Οι δοκιμές ετερογένειας διεξήχθησαν χρησιμοποιώντας τις μεθόδους MR-Egger και IVW για την αξιολόγηση της ετερογένειας μεταξύ των IV. Εάν εντοπιστεί ισχυρή ετερογένεια (Q_pval< 0,05), χρησιμοποιήθηκε ένα μοντέλο τυχαίων επιδράσεων για να ληφθούν πιο ισχυρές εκτιμήσεις επιδράσεων. Η οριζόντια πλειοτροπία των SNPs και η σταθερότητα των αποτελεσμάτων IVW αξιολογήθηκαν με τη χρήση της δοκιμής τομής MR-Egger και της μεθόδου αφήνοντας ένα έξω, αντίστοιχα. ΕΝΑP< 0,05 θεωρήθηκε στατιστικά σημαντικό. Όλες οι στατιστικές αναλύσεις πραγματοποιήθηκαν χρησιμοποιώντας την έκδοση R 4.4.2.

1.3 Ανάλυση Λειτουργικού Εμπλουτισμού Βασισμένη σε IVNG

Οι πληροφορίες θέσης και αλληλουχίας χρωμοσωμάτων των SNP ερωτήθηκαν στη βάση δεδομένων Ensembl (https://www.ensembl.org/) χρησιμοποιώντας αναγνωριστικά SNP. Στη συνέχεια, το εργαλείο BioMart χρησιμοποιήθηκε για την αναγνώριση όλων των οργανικών μεταβλητών κοντινών γονιδίων (IVNGs) εντός ±200 kb από αυτά τα SNP. Η ανάλυση λειτουργικού εμπλουτισμού των IVNGs διεξήχθη χρησιμοποιώντας τοclusterProfilerπακέτο [11], με τα αποτελέσματα εμπλουτισμού να απεικονίζονται χρησιμοποιώντας τοggplot2πακέτο. Τα διαγράμματα βασικών μονοπατιών ελήφθησαν από τη βάση δεδομένων KEGG (https://www.kegg.jp/).

 

1.4 Πρόβλεψη και στατιστική ανάλυση των πιθανών κινεζικών φαρμακευτικών βοτάνων

Τα IVNG υποβλήθηκαν στη βάση δεδομένων συγκριτικής τοξικογονιδιωματικής (CTD, https://ctdbase.org/) για τον εντοπισμό ενώσεων που ρυθμίζουν αυτά τα γονίδια. Οι ενώσεις φιλτραρίστηκαν για εκείνες που σχετίζονται με τον άνθρωπο (Homo sapiens) και υποστηρίζεται από Μεγαλύτερο ή ίσο με 2 IVNG ή Μεγαλύτερο ή ίσο με 2 δημοσιεύσεις. Στη συνέχεια ανακτήθηκαν σχετικά κινεζικά φαρμακευτικά βότανα χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων ITCM (http://itcm.biotcm.net/) [12].

Τα κινεζικά φαρμακευτικά βότανα που περιέχουν τις ίδιες ενώσεις ομαδοποιήθηκαν [13-15]. Εάν ένα μεμονωμένο βότανο περιείχε πολλές ενώσεις που προσδιορίστηκαν σε αυτή τη μελέτη, θα μπορούσε να εμφανιστεί σε πολλές ομάδες. Τα ομαδοποιημένα βότανα μεταφορτώθηκαν στην πλατφόρμα Ancient and Modern Medical Records Cloud (V2.3.9, https://www.yiankb.com/) για επεξεργασία τυποποίησης (π.χ., το "Perilla" ενοποιήθηκε ως "Perilla leaf", "Artemisia" ως "Liu Ji Nu", "Flat Plantain" ως "Plantago Herb" κ.λπ.). Στη συνέχεια διεξήχθη ανάλυση συστάδων, στατιστική ανάλυση των ιδιοτήτων των βοτάνων και του μεσημβρινού τροπισμού και ανάλυση αποτελεσματικότητας. Τα βότανα υψηλής συχνότητας αναλύθηκαν περαιτέρω στην ενότητα αναγνώρισης κλασικής συνταγής για τον εντοπισμό παρόμοιων κλασικών συνταγών.

Οι ενώσεις με τα αντίστοιχα πιθανά κινέζικα φαρμακευτικά βότανα, τα σχετικά IVNGs τους και οι τυποποιημένες πληροφορίες πιθανών βοτάνων μεταφορτώθηκαν στο Cytoscape (V3.10.3) για να κατασκευαστεί ένα δίκτυο χαρτογράφησης "IVNG-compound-herb".

 

2 Αποτελέσματα

2.1 Αποτελέσματα ανάλυσης αιτιώδους επίδρασης μεταξύ LUAD και MDD

Το σύνολο δεδομένων LUAD GWAS (ieu-a-965) περιείχε συνολικά 8.881.354 SNP και 12 SNP διατηρήθηκαν ως μεταβλητές οργάνων μετά τον έλεγχο για επακόλουθη ανάλυση MR. Πληροφορίες για τις μεταβλητές οργάνου φαίνονται στον Πίνακα 1.

Τα αποτελέσματα της μεθόδου IVW έδειξαν ότι η τιμή ήταν 0,00205 (θετική) και στατιστικά σημαντική (P< 0,05), υποδηλώνοντας μια πιθανή ασθενή θετική αιτιολογική επίδραση μεταξύ του LUAD και της εμφάνισης MDD. Ωστόσο, άλλες μέθοδοι ανάλυσης μαγνητικής τομογραφίας δεν έδειξαν στατιστική σημασία (P> 0,05). Λεπτομερή αποτελέσματα ανάλυσης MR παρέχονται στον Πίνακα 2 και στο Σχήμα 2.

 

Ο Πίνακας 2 Αναλύει τα αποτελέσματα της Μεντελικής τυχοποίησης

Μέθοδος	SNPs		SE	P
Κύριος Έγκερ	12	0.00233	0.00195	0.26045
Σταθμισμένη διάμεσος	12	0.00219	0.00190	0.42978
IVW	12	0.00205	0.00087	0.01899*
Απλή λειτουργία	12	0.00171	0.00181	0.92606
Σταθμισμένη λειτουργία	12	0.00074	0.00103	0.58903

Σημείωμα: P< 0,05 θεωρείται στατιστικά σημαντικό.

 

2.2 Ανάλυση ευρωστίας Αποτελέσματα ανάλυσης MR

Τα αποτελέσματα της δοκιμής ετερογένειας δεν έδειξαν σημαντική ετερογένεια μεταξύ των μεταβλητών οργάνων χρησιμοποιώντας και τις δύο μεθόδους MR Egger και IVW (P> 0,05), υποδεικνύοντας σταθερές επιδράσεις των μεταβλητών οργάνων στην εμφάνιση MDD. Αυτό υποστηρίζει την αξιοπιστία των αποτελεσμάτων της ανάλυσης MR (Πίνακας 3).

Ο όρος αναχαίτισης MR Egger (P= 0.8761) δεν έδειξε σημαντική οριζόντια πλειοτροπία, υποδηλώνοντας ότι οι επιδράσεις των όργανων μεταβλητών στην εμφάνιση MDD μεσολαβούνταν κυρίως μέσω της άμεσης αιτιώδους οδού του LUAD και όχι άλλων συγχυτικών επιδράσεων (Egger intercept=-0,00056, τυπικό σφάλμα=0.00352,P = 0.8761).

Τα αποτελέσματα της μεθόδου αφαίρεσης ενός εκτός έδειξαν ότι καμία από τις εργαλειακές μεταβλητές δεν προκάλεσε σημαντική αλλαγή στη συνολική αιτιακή επίδραση και η κατεύθυνση του αποτελέσματος παρέμεινε σταθερή. Αυτό αντανακλά την ευρωστία και την εγκυρότητα των μεταβλητών οργάνων (Εικόνα 3).

Η γραφική παράσταση της χοάνης αποκάλυψε ότι τα σημεία δεδομένων ήταν γενικά συμμετρικά, συνεπή με την έλλειψη σημαντικής ετερογένειας και οριζόντιας πλειοτροπίας, επικυρώνοντας περαιτέρω τον ορθολογισμό της επιλογής της όργανης μεταβλητής και την ευρωστία της εκτίμησης της αιτιώδους επίδρασης (Εικόνα 4).

 

 

Εικ. 2 Εκτιμήσεις αιτιώδους επίδρασης της εμφάνισης LUAD και MDD χρησιμοποιώντας διαφορετικές μεθόδους MR

 

 

2.3 Αποτελέσματα Ανάλυσης Λειτουργικού Εμπλουτισμού των IVNG

Με βάση τις χρωμοσωμικές αλληλουχίες και τους τόπους των 12 SNPs, αναγνωρίστηκαν 120 IVNG από τη βάση δεδομένων Ensembl. Η ανάλυση λειτουργικού εμπλουτισμού αυτών των IVNG αποκάλυψε τα ακόλουθα αποτελέσματα:

Λειτουργικός εμπλουτισμός GO: Τα IVNG εμπλουτίστηκαν κυρίως σε βιολογικές διεργασίες όπως η απόκριση στη νικοτίνη, η χολινεργική συναπτική μετάδοση και η μεταφορά νευροδιαβιβαστών. Συσχετίστηκαν επίσης με κυτταρικά συστατικά όπως σύμπλοκα υποδοχέα σηματοδότησης μεμβράνης πλάσματος, την κυτταροπλασματική πλευρά της μεμβράνης και μετασυναπτική μεμβράνη. Όσον αφορά τις μοριακές λειτουργίες, εμπλουτίστηκαν σε δραστηριότητες όπως η δραστικότητα συμφορέα, η δευτερογενής ενεργός διαμεμβρανική δραστηριότητα μεταφορέα, η παθητική διαμεμβρανική δραστηριότητα μεταφορέα και η δραστηριότητα καναλιού (Εικόνα 5-Α).

Εμπλουτισμός διαδρομής KEGG: Τα εμπλουτισμένα μονοπάτια σχετίζονταν κυρίως με χολινεργικά μονοπάτια σηματοδότησης (Εικόνα 5-Α, Β).

Οι εμπλουτισμένες λειτουργίες GO και οι οδοί KEGG συνδέθηκαν κυρίως με τα ακόλουθα IVNG:
CHRNA3 (χολινεργικός υποδοχέας νικοτινικό άλφα 3), CHRNA5, CHRNB4, EEF1A2 (παράγοντας επιμήκυνσης 1 άλφα 2), KCNQ2 (υποοικογένεια καναλιού με πύλη καλίου Q μέλος 2), LIME1 (Lck αλληλεπιδρούσα πρωτεΐνη μεμβράνης G 1), PIK3C (φωσφατιδυλινοσιτόλη-4,5-διφωσφορική 3-κινάση καταλυτική υπομονάδα γάμμα), PTK6 (πρωτεΐνη κινάση τυροσίνης 6), SLC12A7 (οικογένεια φορέα διαλυμένης ουσίας 12 μέλη 7), SLC6A18, SLC6A19, SLC6Src (σχετική μεμεμβρανάση LRMS, SRMSrckine σχετιζόμενη με την πρωτεϊνική δράση). TRAF3 (παράγοντας 3 που σχετίζεται με τον υποδοχέα TNF) (Εικόνα 5-Β).

 

2.4 Πρόβλεψη και στατιστική ανάλυση των πιθανών κινεζικών φαρμακευτικών βοτάνων

Τα IVNG υποβλήθηκαν στη βάση δεδομένων CTD για την ανάκτηση σχετικών ενώσεων, αποδίδοντας 1.023 ενώσεις μετά την αφαίρεση των διπλών, συμπεριλαμβανομένων εκπροσώπων όπως το ρετινοϊκό οξύ, η ροτενόνη, η ρεσβερατρόλη, το ασκορβικό οξύ, η καμπτοθεκίνη και το κιτρικό οξύ. Περαιτέρω φιλτράρισμα μείωσε τη λίστα σε 170 ενώσεις. Χρησιμοποιώντας τη βάση δεδομένων ITCM, 41 από αυτές τις ενώσεις χαρτογραφήθηκαν σε αντίστοιχα κινέζικα φαρμακευτικά βότανα.

Τα βότανα που εντοπίστηκαν ομαδοποιήθηκαν και μεταφορτώθηκαν στην πλατφόρμα Ancient and Modern Medical Records Cloud για τυποποίηση και αντιγραφή, με αποτέλεσμα 580 πιθανά φαρμακευτικά βότανα. Περιλαμβάνονται τα πιο συχνά αναφερόμενα βόταναSha Yuan Zi(σπόρος Αστραγάλου),Σαν Ζα Γιε(φύλλο κράταιγος),Ju Ju(Ραδίκι),Feng Mi(Μέλι),Γκουάνγκ Ζάο(Καραμέλα),Ζι Ζι(Γαρδένια),Λούο Σουάν Ζάο(σπιρουλίνα),Rou Cong Rong(Cistanche), Που Γκονγκ Γινγκ(Πικραλίδα),Qiao Mai(Είδος σίκαλης),Μα Χουάνγκ(Εφέδρα),Γου Μέι(Μουμέ φρούτο), καιΓι Γι Ρεν(Σπόρος Coix) (Πίνακας 4).

Η ανάλυση συστάδων των 30 κορυφαίων βοτάνων οδήγησε σε πέντε μεγάλες κατηγορίες:

Ντα Χουάνγκ(Ραβέντι),Sha Ji(Ιπποφαές).

Σαν Ζου Γιου(Cornus),Gou Gu Ye(Φύλλο πουρνάρι),Γου Ζου Γιου(Εύβοδια),Μα Χουάνγκ(Εφέδρα),Μου Γκουά(Παπάγια).

Long Kui(Solanum nigrum),Ρεν Σεν(τζίνσενγκ),Τσουάν Σιόνγκ(Ligusticum),Ju Ju(Ραδίκι),Jin Qiao Mai(χρυσό φαγόπυρο),Feng Mi(Μέλι),Γου Μέι(Μουμέ φρούτο).

Γι Γι Ρεν(σπόρος Coix),Τζι Σι Τενγκ(Παιδέρια),Sha Yuan Zi(σπόρος Αστραγάλου),Γκουάνγκ Ζάο(Καραμέλα).

Ε Τζιάο(Ζελατίνη από δέρμα γαϊδάρου),Σι Χου(δεντρόβιο),Λούο Σουάν Ζάο(σπιρουλίνα),Sang Piao Xiao(αυγοθήκη μαντίς),Ντα Σουάν(Σκόρδο),Σαν Ζα Γιε(φύλλο κράταιγος),Qiao Mai(Είδος σίκαλης),Νινγκ Μενγκ(Λεμόνι),Ζι Ζι(Γαρδένια),Rou Cong Rong(Cistanche),Που Γκονγκ Γινγκ(Πικραλίδα),Ντα Τζι(Γαϊδουράγκαθο) (Εικόνα 6).

Χαρακτηριστικά των προβλεπόμενων βοτάνων

Τέσσερις Φύσεις: Τα ζεστά βότανα ήταν τα πιο κοινά (17,46%), ακολουθούμενα από τα ουδέτερα (15,80%) και τα κρύα (13,81%) βότανα (Εικόνα 7-Α).

Πέντε Γεύσεις: Το γλυκό ήταν η κυρίαρχη γεύση (29,28%), ακολουθούμενη από το πικρό (26,19%) και το πικάντικο (20,88%) (Εικόνα 7-Β).

Μεσημβρινός Τροπισμός: Τα βότανα δρούσαν κυρίως στο συκώτι, ακολουθούμενο από τους πνεύμονες, τη σπλήνα, το στομάχι, τα νεφρά και την καρδιά (Εικόνα 7-Γ).

Βασικές Αποτελεσματικές: Η κύρια αποτελεσματικότητα ήταν η κάθαρση της θερμότητας και η αποτοξίνωση (7,96%), ακολουθούμενη από ψύξη του αίματος και διακοπή της αιμορραγίας (3,43%), αποτοξίνωση (3,31%), αιμόσταση (2,43%) και κάθαρση θερμότητας και υγρασίας (2,10%) (Εικόνα 7-Δ).

Ταυτοποίηση Κλασικών Συνταγών

Ανάμεσα στα 15 κορυφαία βότανα, βασικά βότανα όπως π.χΜα Χουάνγκ(Εφέδρα),Ζι Ζι(Γαρδένια),Γι Γι Ρεν(σπόρος Coix),Που Γκονγκ Γινγκ(Πικραλίδα), καιRou Cong Rong(Cistanche) εντοπίζονταν συχνά. Παρόμοιες κλασικές συνταγές περιλαμβάνονταιΦόρμουλες βασισμένες στο Ma Huang, Χούα Χούα Σαν(Sophora Flower Powder),Huang Lian Jie Du Tang(Αφέψημα αποτοξίνωσης Coptis),Γουέι Τζινγκ Τανγκ(Αφέψημα καλαμιού),Wu Wei Xiao Du Yin(Ρόφημα αποτοξίνωσης πέντε συστατικών),Τζι Τσουάν Τζιαν(Benefit River αφέψημα),Χουά Γκαν Τζιαν(Αφέψημα Μετασχηματισμού Ήπατος), καιΣανγκ Σινγκ Τανγκ(Αφέψημα μουριάς και βερίκοκου) (Πίνακας 5).

Χρησιμοποιώντας το Cytoscape (V3.10.3), κατασκευάστηκε ένα δίκτυο χαρτογράφησης "IVNGs-compounds-herbs", που περιλαμβάνει 41 χημικά συστατικά, 54 IVNGs και 580 φαρμακευτικά βότανα (Εικόνα 7-Ε).

 

 

Εικ. 5 Αποτελέσματα ανάλυσης εμπλουτισμού και σχηματικό διάγραμμα της οδού χολινεργικής σηματοδότησης

 

Πίνακας 4 Κορυφαία 30 πιθανή παρέμβαση παραδοσιακά κινέζικα φάρμακα

κινέζικο βότανο	Συχνότητα	Συχνότητα %	κινέζικο βότανο	Συχνότητα	Συχνότητα %
Σπόρος Αστραγάλου	9	17.65%	Φρούτο Mume	9	17.65%
Φύλλο κράταιγος	9	17.65%	Σπόρος Coix	9	17.65%
Ραδίκι	9	17.65%	Εφέδρα	9	17.65%
Μέλι	9	17.65%	Πικραλίδα	9	17.65%
Καραμέλα	8	15.69%	Είδος σίκαλης	8	15.69%
Γαρδένια	8	15.69%	Σκόρδο	8	15.69%
Σπιρουλίνα	8	15.69%	Γαϊδουράγκαθο	8	15.69%
Cistanche	8	15.69%	Λεμόνι	8	15.69%
Μουριά γκι	8	15.69%	Δεντρόβιο	8	15.69%
Ζελατίνη από δέρμα γαϊδουριού	8	15.69%	Ιπποφαές	8	15.69%
Λουλούδι Σοφόρα	8	15.69%	Solanum nigrum	8	15.69%
Τζίνσενγκ	8	15.69%	Ligusticum	8	15.69%
Παπάγια	8	15.69%	Cornus	8	15.69%
Φύλλο πουρνάρι	8	15.69%	Ευοδία	8	15.69%

 

 

Εικ. 6 Αποτελέσματα ανάλυσης συμπλέγματος παραδοσιακών κινεζικών φαρμάκων